Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ALDH1A3P47895 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ALDH1A3P47895 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ALDH1A3P47895 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ALDH1A3P47895 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALDH1A3P47895 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALDH1A3P47895 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALDH1A3P47895 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALDH1A3P47895 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALDH1A3P47895 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALDH1A3P47895 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALDH1A3P47895 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALDH1A3P47895 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALDH1A3P47895 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALDH1A3P47895 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALDH1A3P47895 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALDH1A3P47895 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALDH1A3P47895 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALDH1A3P47895 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALDH1A3P47895 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALDH1A3P47895 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALDH1A3P47895 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALDH1A3P47895 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALDH1A3P47895 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALDH1A3P47895 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALDH1A3P47895 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALDH1A3P47895 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALDH1A3P47895 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALDH1A3P47895 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALDH1A3P47895 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALDH1A3P47895 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALDH1A3P47895 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALDH1A3P47895 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALDH1A3P47895 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALDH1A3P47895 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALDH1A3P47895 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALDH1A3P47895 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALDH1A3P47895 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ALDH1A3P47895 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALDH1A3P47895 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ALDH1A3P47895 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALDH1A3P47895 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALDH1A3P47895 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALDH1A3P47895 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALDH1A3P47895 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ALDH1A3P47895 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALDH1A3P47895 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALDH1A3P47895 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALDH1A3P47895 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALDH1A3P47895 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALDH1A3P47895 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALDH1A3P47895 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALDH1A3P47895 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALDH1A3P47895 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALDH1A3P47895 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALDH1A3P47895 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ALDH1A3P47895 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALDH1A3P47895 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ALDH1A3P47895 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALDH1A3P47895 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALDH1A3P47895 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALDH1A3P47895 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALDH1A3P47895 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALDH1A3P47895 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALDH1A3P47895 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALDH1A3P47895 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALDH1A3P47895 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALDH1A3P47895 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALDH1A3P47895 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALDH1A3P47895 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALDH1A3P47895 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALDH1A3P47895 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALDH1A3P47895 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALDH1A3P47895 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALDH1A3P47895 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALDH1A3P47895 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALDH1A3P47895 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALDH1A3P47895 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALDH1A3P47895 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALDH1A3P47895 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ALDH1A3P47895 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms