Protein–RNA interactions for Protein: P27539

GDF1, Embryonic growth/differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF1P27539 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF1P27539 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF1P27539 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF1P27539 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF1P27539 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF1P27539 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF1P27539 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF1P27539 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF1P27539 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF1P27539 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF1P27539 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF1P27539 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF1P27539 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF1P27539 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF1P27539 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF1P27539 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF1P27539 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF1P27539 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF1P27539 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF1P27539 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF1P27539 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF1P27539 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF1P27539 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF1P27539 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF1P27539 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF1P27539 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF1P27539 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF1P27539 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF1P27539 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF1P27539 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF1P27539 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF1P27539 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF1P27539 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF1P27539 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF1P27539 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF1P27539 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF1P27539 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF1P27539 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF1P27539 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF1P27539 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF1P27539 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF1P27539 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF1P27539 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF1P27539 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF1P27539 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF1P27539 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF1P27539 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF1P27539 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF1P27539 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF1P27539 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF1P27539 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF1P27539 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF1P27539 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF1P27539 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF1P27539 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF1P27539 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF1P27539 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF1P27539 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF1P27539 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF1P27539 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF1P27539 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF1P27539 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF1P27539 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF1P27539 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF1P27539 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF1P27539 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF1P27539 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF1P27539 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF1P27539 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF1P27539 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF1P27539 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF1P27539 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF1P27539 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF1P27539 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF1P27539 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF1P27539 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF1P27539 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF1P27539 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF1P27539 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF1P27539 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF1P27539 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF1P27539 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF1P27539 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF1P27539 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF1P27539 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF1P27539 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF1P27539 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF1P27539 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF1P27539 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF1P27539 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF1P27539 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF1P27539 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF1P27539 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF1P27539 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF1P27539 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF1P27539 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF1P27539 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF1P27539 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF1P27539 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF1P27539 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms