Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGFR4P22455 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGFR4P22455 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FGFR4P22455 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGFR4P22455 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGFR4P22455 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FGFR4P22455 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FGFR4P22455 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FGFR4P22455 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FGFR4P22455 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
FGFR4P22455 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FGFR4P22455 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FGFR4P22455 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FGFR4P22455 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FGFR4P22455 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FGFR4P22455 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FGFR4P22455 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FGFR4P22455 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FGFR4P22455 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FGFR4P22455 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FGFR4P22455 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FGFR4P22455 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FGFR4P22455 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
FGFR4P22455 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FGFR4P22455 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FGFR4P22455 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FGFR4P22455 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FGFR4P22455 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FGFR4P22455 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FGFR4P22455 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FGFR4P22455 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FGFR4P22455 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FGFR4P22455 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FGFR4P22455 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FGFR4P22455 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FGFR4P22455 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FGFR4P22455 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FGFR4P22455 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
FGFR4P22455 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGFR4P22455 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGFR4P22455 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGFR4P22455 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGFR4P22455 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGFR4P22455 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGFR4P22455 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGFR4P22455 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGFR4P22455 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGFR4P22455 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGFR4P22455 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGFR4P22455 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGFR4P22455 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FGFR4P22455 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FGFR4P22455 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FGFR4P22455 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGFR4P22455 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGFR4P22455 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGFR4P22455 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGFR4P22455 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGFR4P22455 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGFR4P22455 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGFR4P22455 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGFR4P22455 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FGFR4P22455 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGFR4P22455 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGFR4P22455 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGFR4P22455 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGFR4P22455 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGFR4P22455 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FGFR4P22455 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FGFR4P22455 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FGFR4P22455 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FGFR4P22455 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FGFR4P22455 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FGFR4P22455 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FGFR4P22455 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FGFR4P22455 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FGFR4P22455 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FGFR4P22455 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FGFR4P22455 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGFR4P22455 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGFR4P22455 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGFR4P22455 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGFR4P22455 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGFR4P22455 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGFR4P22455 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGFR4P22455 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGFR4P22455 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FGFR4P22455 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FGFR4P22455 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
FGFR4P22455 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FGFR4P22455 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FGFR4P22455 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FGFR4P22455 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FGFR4P22455 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FGFR4P22455 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FGFR4P22455 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
FGFR4P22455 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FGFR4P22455 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FGFR4P22455 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FGFR4P22455 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms