Protein–RNA interactions for Protein: P19388

POLR2E, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2EP19388 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2EP19388 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2EP19388 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2EP19388 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2EP19388 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2EP19388 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2EP19388 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2EP19388 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2EP19388 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2EP19388 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2EP19388 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2EP19388 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2EP19388 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2EP19388 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2EP19388 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2EP19388 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2EP19388 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2EP19388 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2EP19388 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2EP19388 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2EP19388 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLR2EP19388 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2EP19388 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2EP19388 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2EP19388 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2EP19388 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2EP19388 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2EP19388 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2EP19388 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2EP19388 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2EP19388 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2EP19388 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2EP19388 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2EP19388 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2EP19388 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2EP19388 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2EP19388 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2EP19388 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2EP19388 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2EP19388 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2EP19388 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2EP19388 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2EP19388 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2EP19388 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2EP19388 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2EP19388 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR2EP19388 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR2EP19388 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR2EP19388 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR2EP19388 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2EP19388 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2EP19388 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2EP19388 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2EP19388 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2EP19388 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2EP19388 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2EP19388 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2EP19388 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2EP19388 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2EP19388 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2EP19388 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2EP19388 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2EP19388 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2EP19388 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2EP19388 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2EP19388 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2EP19388 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2EP19388 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2EP19388 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2EP19388 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2EP19388 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2EP19388 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2EP19388 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2EP19388 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2EP19388 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2EP19388 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2EP19388 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2EP19388 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2EP19388 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2EP19388 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2EP19388 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2EP19388 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2EP19388 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2EP19388 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2EP19388 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2EP19388 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2EP19388 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2EP19388 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2EP19388 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2EP19388 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2EP19388 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2EP19388 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2EP19388 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2EP19388 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2EP19388 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2EP19388 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2EP19388 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2EP19388 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2EP19388 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2EP19388 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms