Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXC4P09017 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXC4P09017 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXC4P09017 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXC4P09017 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXC4P09017 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXC4P09017 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXC4P09017 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXC4P09017 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXC4P09017 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXC4P09017 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXC4P09017 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC4P09017 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC4P09017 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC4P09017 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC4P09017 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC4P09017 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC4P09017 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC4P09017 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC4P09017 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC4P09017 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC4P09017 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC4P09017 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC4P09017 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC4P09017 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC4P09017 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC4P09017 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC4P09017 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC4P09017 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC4P09017 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC4P09017 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC4P09017 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC4P09017 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC4P09017 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC4P09017 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC4P09017 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC4P09017 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC4P09017 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC4P09017 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC4P09017 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC4P09017 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC4P09017 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC4P09017 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC4P09017 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC4P09017 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC4P09017 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC4P09017 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC4P09017 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC4P09017 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC4P09017 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC4P09017 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC4P09017 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC4P09017 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC4P09017 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC4P09017 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC4P09017 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC4P09017 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC4P09017 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC4P09017 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC4P09017 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC4P09017 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC4P09017 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC4P09017 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC4P09017 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC4P09017 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC4P09017 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC4P09017 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC4P09017 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC4P09017 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC4P09017 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC4P09017 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC4P09017 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC4P09017 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC4P09017 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC4P09017 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC4P09017 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXC4P09017 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXC4P09017 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXC4P09017 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXC4P09017 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXC4P09017 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXC4P09017 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC4P09017 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC4P09017 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC4P09017 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC4P09017 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC4P09017 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC4P09017 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC4P09017 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC4P09017 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC4P09017 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC4P09017 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC4P09017 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC4P09017 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC4P09017 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC4P09017 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC4P09017 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC4P09017 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC4P09017 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXC4P09017 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.2 ms