Protein–RNA interactions for Protein: P08123

COL1A2, Collagen alpha-2(I) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL1A2P08123 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL1A2P08123 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL1A2P08123 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
COL1A2P08123 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL1A2P08123 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
COL1A2P08123 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL1A2P08123 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL1A2P08123 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL1A2P08123 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL1A2P08123 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL1A2P08123 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL1A2P08123 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL1A2P08123 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL1A2P08123 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL1A2P08123 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
COL1A2P08123 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL1A2P08123 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL1A2P08123 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL1A2P08123 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL1A2P08123 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL1A2P08123 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL1A2P08123 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL1A2P08123 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL1A2P08123 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL1A2P08123 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL1A2P08123 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL1A2P08123 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL1A2P08123 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL1A2P08123 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL1A2P08123 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL1A2P08123 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL1A2P08123 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL1A2P08123 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL1A2P08123 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL1A2P08123 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL1A2P08123 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL1A2P08123 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL1A2P08123 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL1A2P08123 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL1A2P08123 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL1A2P08123 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
COL1A2P08123 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL1A2P08123 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
COL1A2P08123 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL1A2P08123 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL1A2P08123 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL1A2P08123 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
COL1A2P08123 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL1A2P08123 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL1A2P08123 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL1A2P08123 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL1A2P08123 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL1A2P08123 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL1A2P08123 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL1A2P08123 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
COL1A2P08123 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL1A2P08123 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL1A2P08123 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL1A2P08123 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL1A2P08123 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL1A2P08123 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL1A2P08123 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL1A2P08123 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL1A2P08123 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL1A2P08123 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL1A2P08123 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL1A2P08123 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL1A2P08123 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL1A2P08123 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL1A2P08123 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL1A2P08123 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL1A2P08123 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL1A2P08123 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL1A2P08123 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
COL1A2P08123 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL1A2P08123 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL1A2P08123 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL1A2P08123 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL1A2P08123 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL1A2P08123 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL1A2P08123 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL1A2P08123 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL1A2P08123 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL1A2P08123 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL1A2P08123 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
COL1A2P08123 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL1A2P08123 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL1A2P08123 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL1A2P08123 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL1A2P08123 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL1A2P08123 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL1A2P08123 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL1A2P08123 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL1A2P08123 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL1A2P08123 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL1A2P08123 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL1A2P08123 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL1A2P08123 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL1A2P08123 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL1A2P08123 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms