Protein–RNA interactions for Protein: O75888

TNFSF13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13O75888 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF13O75888 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF13O75888 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF13O75888 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF13O75888 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF13O75888 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF13O75888 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFSF13O75888 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF13O75888 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF13O75888 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF13O75888 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF13O75888 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF13O75888 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF13O75888 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF13O75888 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF13O75888 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF13O75888 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF13O75888 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF13O75888 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF13O75888 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF13O75888 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF13O75888 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF13O75888 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF13O75888 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF13O75888 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF13O75888 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF13O75888 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF13O75888 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF13O75888 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF13O75888 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF13O75888 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF13O75888 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF13O75888 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF13O75888 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF13O75888 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF13O75888 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF13O75888 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF13O75888 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF13O75888 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF13O75888 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF13O75888 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF13O75888 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF13O75888 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF13O75888 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF13O75888 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF13O75888 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF13O75888 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF13O75888 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF13O75888 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF13O75888 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF13O75888 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF13O75888 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF13O75888 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF13O75888 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF13O75888 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF13O75888 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF13O75888 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF13O75888 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF13O75888 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF13O75888 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFSF13O75888 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF13O75888 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF13O75888 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF13O75888 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF13O75888 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF13O75888 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF13O75888 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms