Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNOT3O75175 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNOT3O75175 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNOT3O75175 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT3O75175 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT3O75175 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT3O75175 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT3O75175 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms