Protein–RNA interactions for Protein: O14904

WNT9A, Protein Wnt-9a, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT9AO14904 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
WNT9AO14904 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WNT9AO14904 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WNT9AO14904 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
WNT9AO14904 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WNT9AO14904 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WNT9AO14904 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WNT9AO14904 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WNT9AO14904 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
WNT9AO14904 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WNT9AO14904 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WNT9AO14904 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
WNT9AO14904 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WNT9AO14904 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WNT9AO14904 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WNT9AO14904 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WNT9AO14904 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WNT9AO14904 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WNT9AO14904 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
WNT9AO14904 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
WNT9AO14904 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
WNT9AO14904 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WNT9AO14904 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WNT9AO14904 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
WNT9AO14904 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
WNT9AO14904 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WNT9AO14904 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WNT9AO14904 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WNT9AO14904 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WNT9AO14904 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WNT9AO14904 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WNT9AO14904 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
WNT9AO14904 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
WNT9AO14904 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WNT9AO14904 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WNT9AO14904 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WNT9AO14904 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
WNT9AO14904 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WNT9AO14904 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WNT9AO14904 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WNT9AO14904 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WNT9AO14904 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WNT9AO14904 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WNT9AO14904 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WNT9AO14904 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WNT9AO14904 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WNT9AO14904 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WNT9AO14904 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WNT9AO14904 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WNT9AO14904 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
WNT9AO14904 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WNT9AO14904 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WNT9AO14904 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WNT9AO14904 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WNT9AO14904 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WNT9AO14904 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WNT9AO14904 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WNT9AO14904 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WNT9AO14904 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WNT9AO14904 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WNT9AO14904 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WNT9AO14904 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WNT9AO14904 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WNT9AO14904 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
WNT9AO14904 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
WNT9AO14904 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
WNT9AO14904 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms