Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV0

KLRC4-KLRK1, KLRC4-KLRK1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLRC4-KLRK1H3BQV0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLRC4-KLRK1H3BQV0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KLRC4-KLRK1H3BQV0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLRC4-KLRK1H3BQV0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms