Protein–RNA interactions for Protein: B0FP48

UPK3BL1, Uroplakin-3b-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL1B0FP48 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
UPK3BL1B0FP48 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPK3BL1B0FP48 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPK3BL1B0FP48 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPK3BL1B0FP48 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPK3BL1B0FP48 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPK3BL1B0FP48 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPK3BL1B0FP48 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPK3BL1B0FP48 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPK3BL1B0FP48 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UPK3BL1B0FP48 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UPK3BL1B0FP48 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPK3BL1B0FP48 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPK3BL1B0FP48 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPK3BL1B0FP48 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPK3BL1B0FP48 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPK3BL1B0FP48 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPK3BL1B0FP48 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPK3BL1B0FP48 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPK3BL1B0FP48 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPK3BL1B0FP48 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPK3BL1B0FP48 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPK3BL1B0FP48 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UPK3BL1B0FP48 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UPK3BL1B0FP48 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UPK3BL1B0FP48 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPK3BL1B0FP48 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPK3BL1B0FP48 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPK3BL1B0FP48 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPK3BL1B0FP48 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UPK3BL1B0FP48 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UPK3BL1B0FP48 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UPK3BL1B0FP48 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UPK3BL1B0FP48 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPK3BL1B0FP48 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UPK3BL1B0FP48 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UPK3BL1B0FP48 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UPK3BL1B0FP48 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UPK3BL1B0FP48 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UPK3BL1B0FP48 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UPK3BL1B0FP48 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPK3BL1B0FP48 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPK3BL1B0FP48 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPK3BL1B0FP48 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPK3BL1B0FP48 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPK3BL1B0FP48 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UPK3BL1B0FP48 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPK3BL1B0FP48 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPK3BL1B0FP48 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UPK3BL1B0FP48 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UPK3BL1B0FP48 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UPK3BL1B0FP48 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UPK3BL1B0FP48 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UPK3BL1B0FP48 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
UPK3BL1B0FP48 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UPK3BL1B0FP48 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UPK3BL1B0FP48 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
UPK3BL1B0FP48 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UPK3BL1B0FP48 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UPK3BL1B0FP48 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UPK3BL1B0FP48 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UPK3BL1B0FP48 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UPK3BL1B0FP48 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UPK3BL1B0FP48 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UPK3BL1B0FP48 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UPK3BL1B0FP48 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UPK3BL1B0FP48 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UPK3BL1B0FP48 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UPK3BL1B0FP48 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPK3BL1B0FP48 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPK3BL1B0FP48 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPK3BL1B0FP48 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UPK3BL1B0FP48 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UPK3BL1B0FP48 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPK3BL1B0FP48 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPK3BL1B0FP48 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPK3BL1B0FP48 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPK3BL1B0FP48 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPK3BL1B0FP48 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPK3BL1B0FP48 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPK3BL1B0FP48 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPK3BL1B0FP48 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UPK3BL1B0FP48 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UPK3BL1B0FP48 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UPK3BL1B0FP48 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UPK3BL1B0FP48 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UPK3BL1B0FP48 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms