Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYA0

TMED7-TICAM2, Protein TMED7-TICAM2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
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TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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