RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W TY1A-JR2P47099 440 aa6.95□□□□□ -1.3
VFA1YER128W TY1A-DR1Q03856 440 aa6.95□□□□□ -1.3
VFA1YER128W TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
VFA1YER128W TY1A-BRQ12217 440 aa6.95□□□□□ -1.3
VFA1YER128W TY1A-NL2Q12470 440 aa6.95□□□□□ -1.3
VFA1YER128W TY1A-GR2Q12485 440 aa6.95□□□□□ -1.3
VFA1YER128W SEC2P17065 759 aa6.94□□□□□ -1.3
VFA1YER128W AIR1P40507 360 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
VFA1YER128W BRE2P43132 505 aa6.94□□□□□ -1.3
VFA1YER128W GCR2Q01722 534 aa6.93□□□□□ -1.3
VFA1YER128W YPR109WQ06104 294 aa6.93□□□□□ -1.3
VFA1YER128W CLA4P48562 842 aa6.92□□□□□ -1.3
VFA1YER128W LAM6Q08001 693 aa6.92□□□□□ -1.3
VFA1YER128W RGR1P19263 1082 aa6.91□□□□□ -1.3
VFA1YER128W PAT1P25644 796 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
VFA1YER128W RRN7P40992 514 aa6.91□□□□□ -1.3
VFA1YER128W FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
VFA1YER128W YPL062WQ02781 134 aa6.88□□□□□ -1.31
VFA1YER128W BDP1P46678 594 aa6.87□□□□□ -1.31
VFA1YER128W CDC4P07834 779 aa6.85□□□□□ -1.31
VFA1YER128W GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data6.85□□□□□ -1.31not detected
VFA1YER128W GAR1P28007 205 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
VFA1YER128W KEX2P13134 814 aa6.84□□□□□ -1.31
VFA1YER128W PBS2P08018 668 aa6.81□□□□□ -1.32
VFA1YER128W CKB1P43639 278 aa6.81□□□□□ -1.32
VFA1YER128W HED1Q03937 162 aa6.81□□□□□ -1.32
VFA1YER128W ERF2Q06551 359 aa6.81□□□□□ -1.32
VFA1YER128W PSE1P32337 1089 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
VFA1YER128W CLB5P30283 435 aa6.76□□□□□ -1.33
VFA1YER128W PAC1P39946 494 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
VFA1YER128W MET22P32179 357 aa6.74□□□□□ -1.33
VFA1YER128W TUB4P53378 473 aa6.73□□□□□ -1.33
VFA1YER128W MAM3Q12296 706 aa6.73□□□□□ -1.33
VFA1YER128W MOD5P07884 428 aa6.72□□□□□ -1.33
VFA1YER128W ENV9Q08651 330 aa6.72□□□□□ -1.33
VFA1YER128W RTF1P53064 558 aa6.71□□□□□ -1.34
VFA1YER128W AGE1Q04412 482 aa6.71□□□□□ -1.34
VFA1YER128W ASH1P34233 588 aa6.7□□□□□ -1.34
VFA1YER128W HST3P53687 447 aa6.7□□□□□ -1.34
VFA1YER128W MET32Q12041 191 aa6.7□□□□□ -1.34
VFA1YER128W YNL115CP53925 644 aa6.69□□□□□ -1.34
VFA1YER128W YDR444WQ04093 687 aa6.69□□□□□ -1.34
VFA1YER128W PUS5Q06244 254 aa6.69□□□□□ -1.34
VFA1YER128W AFT1P22149 690 aa6.68□□□□□ -1.34
VFA1YER128W IES2P40154 320 aa6.67□□□□□ -1.34
VFA1YER128W TEA1P47988 759 aa6.66□□□□□ -1.34
VFA1YER128W DSF2P38213 736 aa6.65□□□□□ -1.34
VFA1YER128W KXD1P53158 218 aa6.64□□□□□ -1.35
VFA1YER128W SIT4P20604 311 aa6.63□□□□□ -1.35
VFA1YER128W LCB5Q06147 687 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
VFA1YER128W NIS1P53939 407 aa6.61□□□□□ -1.35
VFA1YER128W YJR115WP47152 169 aa6.6□□□□□ -1.35
VFA1YER128W NUP42P49686 430 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
VFA1YER128W TPD3P31383 635 aa6.59□□□□□ -1.35
VFA1YER128W RRD1P40454 393 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
VFA1YER128W HXT10P43581 546 aa6.59□□□□□ -1.35
VFA1YER128W SYH1Q02875 849 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
VFA1YER128W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
VFA1YER128W PDC1P06169 563 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
VFA1YER128W SLY41P22215 453 aa6.56□□□□□ -1.36
VFA1YER128W SPB4P25808 606 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
VFA1YER128W YMR196WQ04336 1088 aa6.56□□□□□ -1.36
VFA1YER128W YDL176WQ12027 708 aa6.56□□□□□ -1.36
VFA1YER128W MSB3P48566 633 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
VFA1YER128W DIT2P21595 489 aa6.54□□□□□ -1.36
VFA1YER128W FPK1P53739 893 aa6.54□□□□□ -1.36
VFA1YER128W TBF1Q02457 562 aa6.53□□□□□ -1.36
VFA1YER128W UGA3P26370 528 aa6.52□□□□□ -1.37
VFA1YER128W KIP2P28743 706 aa6.52□□□□□ -1.37
VFA1YER128W ALR1Q08269 859 aa6.52□□□□□ -1.37
VFA1YER128W DMA1P38823 416 aa6.51□□□□□ -1.37
VFA1YER128W RPA14P50106 137 aa6.5□□□□□ -1.37
VFA1YER128W PUS6P53294 404 aa6.5□□□□□ -1.37
VFA1YER128W YDL206WQ12424 762 aa6.5□□□□□ -1.37
VFA1YER128W SRF1Q12516 437 aa6.5□□□□□ -1.37
VFA1YER128W PTK2P47116 818 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
VFA1YER128W YPR097WQ06839 1073 aa6.48□□□□□ -1.37
VFA1YER128W IXR1P33417 597 aa6.47□□□□□ -1.37
VFA1YER128W YLR346CQ06139 101 aa6.47□□□□□ -1.37
VFA1YER128W CAF120P53836 1060 aa6.46□□□□□ -1.38
VFA1YER128W TRM1P15565 570 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
VFA1YER128W HST2P53686 357 aa6.45□□□□□ -1.38
VFA1YER128W OPT2Q06593 877 aa6.45□□□□□ -1.38
VFA1YER128W SCJ1P25303 377 aa6.44□□□□□ -1.38
VFA1YER128W BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data6.44□□□□□ -1.38not detected
VFA1YER128W MRT4P33201 236 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
VFA1YER128W ACO2P39533 789 aa6.43□□□□□ -1.38
VFA1YER128W RTT106P40161 455 aa6.42□□□□□ -1.38
VFA1YER128W TYW1Q08960 810 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
VFA1YER128W MMP1Q12372 583 aa6.42□□□□□ -1.38
VFA1YER128W NUP85P46673 744 aa6.4□□□□□ -1.38
VFA1YER128W ATF2P53296 535 aa6.4□□□□□ -1.38
VFA1YER128W GLN1P32288 370 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
VFA1YER128W GLY1P37303 387 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
VFA1YER128W MIP1P15801 1254 aa6.37□□□□□ -1.39
VFA1YER128W ESS1P22696 170 aa6.37□□□□□ -1.39
VFA1YER128W SCW11P53189 542 aa6.37□□□□□ -1.39
VFA1YER128W YGR035CP53222 116 aa6.35□□□□□ -1.39
VFA1YER128W ARG82P07250 355 aa6.34□□□□□ -1.39
VFA1YER128W VAC17P25591 423 aa6.34□□□□□ -1.39
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