Protein–RNA interactions for Protein: P40454

RRD1, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRD1P40454 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.62■■□□□ 1.37
RRD1P40454 NOP1YDL014W 984 nt23.57■■□□□ 1.36
RRD1P40454 YKL036CYKL036C 393 nt23■■□□□ 1.27
RRD1P40454 NSR1YGR159C 1245 nt22.37■■□□□ 1.17
RRD1P40454 YJL027CYJL027C 417 nt22.11■■□□□ 1.13
RRD1P40454 SCS3YGL126W 1143 nt21.59■■□□□ 1.05
RRD1P40454 Q0297Q0297 156 nt21.1■□□□□ 0.97
RRD1P40454 SCJ1YMR214W 1134 nt20.93■□□□□ 0.94
RRD1P40454 SRX1YKL086W 384 nt20.6■□□□□ 0.89
RRD1P40454 YOL085CYOL085C 342 nt19.87■□□□□ 0.77
RRD1P40454 ATS1YAL020C 1002 nt19.71■□□□□ 0.75
RRD1P40454 YCR051WYCR051W 669 nt19.58■□□□□ 0.72
RRD1P40454 PKP1YIL042C 1185 nt19.32■□□□□ 0.68
RRD1P40454 RPP1BYDL130W 321 nt18.91■□□□□ 0.62
RRD1P40454 RTC3YHR087W 336 nt18.83■□□□□ 0.6
RRD1P40454 MDJ1YFL016C 1536 nt18.52■□□□□ 0.56
RRD1P40454 SCR1SCR1 522 nt18.07■□□□□ 0.48
RRD1P40454 PST2YDR032C 597 nt18.04■□□□□ 0.48
RRD1P40454 YKL097CYKL097C 411 nt18.02■□□□□ 0.48
RRD1P40454 PET122YER153C 765 nt17.87■□□□□ 0.45
RRD1P40454 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.84■□□□□ 0.45
RRD1P40454 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.84■□□□□ 0.45
RRD1P40454 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.84■□□□□ 0.45
RRD1P40454 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.84■□□□□ 0.45
RRD1P40454 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.84■□□□□ 0.45
RRD1P40454 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.84■□□□□ 0.45
RRD1P40454 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.84■□□□□ 0.45
RRD1P40454 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.84■□□□□ 0.45
RRD1P40454 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.84■□□□□ 0.45
RRD1P40454 CCC1YLR220W 969 nt17.56■□□□□ 0.4
RRD1P40454 RSB1YOR049C 1065 nt17.52■□□□□ 0.4
RRD1P40454 RRN5YLR141W 1092 nt17.5■□□□□ 0.39
RRD1P40454 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.31■□□□□ 0.36
RRD1P40454 YER088W-BYER088W-B 147 nt17.18■□□□□ 0.34
RRD1P40454 YOR139CYOR139C 393 nt17.05■□□□□ 0.32
RRD1P40454 DBP2YNL112W 1641 nt16.98■□□□□ 0.31
RRD1P40454 SHU1YHL006C 453 nt16.95■□□□□ 0.3
RRD1P40454 YDJ1YNL064C 1230 nt16.77■□□□□ 0.28
RRD1P40454 BSC6YOL137W 1494 nt16.75■□□□□ 0.27
RRD1P40454 NPL3YDR432W 1245 nt16.59■□□□□ 0.25
RRD1P40454 RVS167YDR388W 1449 nt16.28■□□□□ 0.2
RRD1P40454 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt16.28■□□□□ 0.2
RRD1P40454 IMT4tM(CAU)E 72 nt16.28■□□□□ 0.2
RRD1P40454 IMT3tM(CAU)J3 72 nt16.28■□□□□ 0.2
RRD1P40454 IMT1tM(CAU)O1 72 nt16.28■□□□□ 0.2
RRD1P40454 IMT2tM(CAU)P 72 nt16.28■□□□□ 0.2
RRD1P40454 MOT3YMR070W 1473 nt16.22■□□□□ 0.19
RRD1P40454 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.2■□□□□ 0.18
RRD1P40454 MRPL8YJL063C 717 nt16.16■□□□□ 0.18
RRD1P40454 GAR1YHR089C 618 nt16.1■□□□□ 0.17
RRD1P40454 UBX6YJL048C 1191 nt16.07■□□□□ 0.16
RRD1P40454 SHR5YOL110W 714 nt16.05■□□□□ 0.16
RRD1P40454 YOL037CYOL037C 354 nt15.88■□□□□ 0.13
RRD1P40454 RPN10YHR200W 807 nt15.85■□□□□ 0.13
RRD1P40454 ADO1YJR105W 1023 nt15.71■□□□□ 0.11
RRD1P40454 PUS2YGL063W 1113 nt15.61■□□□□ 0.09
RRD1P40454 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt15.59■□□□□ 0.09
RRD1P40454 TIR1YER011W 765 nt15.53■□□□□ 0.08
RRD1P40454 MNP1YGL068W 585 nt15.51■□□□□ 0.07
RRD1P40454 YBR190WYBR190W 312 nt15.51■□□□□ 0.07
RRD1P40454 YGR021WYGR021W 873 nt15.45■□□□□ 0.06
RRD1P40454 HOM6YJR139C 1080 nt15.44■□□□□ 0.06
RRD1P40454 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt15.43■□□□□ 0.06
RRD1P40454 YEL076CYEL076C 651 nt15.43■□□□□ 0.06
RRD1P40454 YLR464WYLR464W 651 nt15.43■□□□□ 0.06
RRD1P40454 YLR281CYLR281C 468 nt15.37■□□□□ 0.05
RRD1P40454 SBA1YKL117W 651 nt15.29■□□□□ 0.04
RRD1P40454 YDR094WYDR094W 336 nt15.26■□□□□ 0.03
RRD1P40454 FMP45YDL222C 930 nt15.22■□□□□ 0.03
RRD1P40454 YCH1YGR203W 447 nt15.22■□□□□ 0.03
RRD1P40454 URN1YPR152C 1398 nt15.22■□□□□ 0.03
RRD1P40454 RKM5YLR137W 1104 nt15.21■□□□□ 0.03
RRD1P40454 SIS1YNL007C 1059 nt15.1■□□□□ 0.01
RRD1P40454 WHI5YOR083W 888 nt15.09■□□□□ 0.01
RRD1P40454 RTG1YOL067C 534 nt15.08■□□□□ 0
RRD1P40454 YNL208WYNL208W 600 nt15.05■□□□□ -0
RRD1P40454 SSA1YAL005C 1929 nt15.04■□□□□ -0
RRD1P40454 WWM1YFL010C 636 nt15.04■□□□□ -0
RRD1P40454 DEP1YAL013W 1218 nt15.04■□□□□ -0
RRD1P40454 SRB2YHR041C 633 nt15.03■□□□□ -0
RRD1P40454 YPR011CYPR011C 981 nt14.99□□□□□ -0.01
RRD1P40454 DSK2YMR276W 1122 nt14.93□□□□□ -0.02
RRD1P40454 YJR018WYJR018W 363 nt14.88□□□□□ -0.03
RRD1P40454 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.85□□□□□ -0.03
RRD1P40454 YLR236CYLR236C 324 nt14.84□□□□□ -0.03
RRD1P40454 IMP2'YIL154C 1041 nt14.83□□□□□ -0.04
RRD1P40454 HUA1YGR268C 597 nt14.76□□□□□ -0.05
RRD1P40454 RPP2BYDR382W 333 nt14.72□□□□□ -0.05
RRD1P40454 SPP1YPL138C 1062 nt14.72□□□□□ -0.05
RRD1P40454 LPX1YOR084W 1164 nt14.48□□□□□ -0.09
RRD1P40454 ERV46YAL042W 1248 nt14.47□□□□□ -0.09
RRD1P40454 SSA3YBL075C 1950 nt14.47□□□□□ -0.09
RRD1P40454 Q0182Q0182 405 nt14.36□□□□□ -0.11
RRD1P40454 PAU16YKL224C 372 nt14.36□□□□□ -0.11
RRD1P40454 LSM3YLR438C-A 270 nt14.3□□□□□ -0.12
RRD1P40454 OPI9YLR338W 858 nt14.27□□□□□ -0.13
RRD1P40454 YJR120WYJR120W 351 nt14.22□□□□□ -0.13
RRD1P40454 FPR4YLR449W 1179 nt14.22□□□□□ -0.13
RRD1P40454 BDH2YAL061W 1254 nt14.2□□□□□ -0.14
RRD1P40454 YGR139WYGR139W 339 nt14.18□□□□□ -0.14
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