Protein–RNA interactions for Protein: P53158

KXD1, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit KXD1, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
KXD1P53158 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.73■□□□□ 0.75
KXD1P53158 NSR1YGR159C 1245 nt19.66■□□□□ 0.74
KXD1P53158 NOP1YDL014W 984 nt19.21■□□□□ 0.67
KXD1P53158 YKL036CYKL036C 393 nt17.73■□□□□ 0.43
KXD1P53158 MDJ1YFL016C 1536 nt17.4■□□□□ 0.38
KXD1P53158 Q0297Q0297 156 nt16.84■□□□□ 0.29
KXD1P53158 SRX1YKL086W 384 nt16.8■□□□□ 0.28
KXD1P53158 YJL027CYJL027C 417 nt16.52■□□□□ 0.24
KXD1P53158 SCS3YGL126W 1143 nt16.13■□□□□ 0.17
KXD1P53158 YCR051WYCR051W 669 nt15.89■□□□□ 0.13
KXD1P53158 DBP2YNL112W 1641 nt15.43■□□□□ 0.06
KXD1P53158 YOL085CYOL085C 342 nt15.36■□□□□ 0.05
KXD1P53158 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.19■□□□□ 0.02
KXD1P53158 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.19■□□□□ 0.02
KXD1P53158 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.19■□□□□ 0.02
KXD1P53158 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.19■□□□□ 0.02
KXD1P53158 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.19■□□□□ 0.02
KXD1P53158 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.19■□□□□ 0.02
KXD1P53158 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.19■□□□□ 0.02
KXD1P53158 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.19■□□□□ 0.02
KXD1P53158 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.19■□□□□ 0.02
KXD1P53158 RPP1BYDL130W 321 nt15.09■□□□□ 0.01
KXD1P53158 PKP1YIL042C 1185 nt15.08■□□□□ 0
KXD1P53158 CCC1YLR220W 969 nt14.97□□□□□ -0.01
KXD1P53158 YBR190WYBR190W 312 nt14.88□□□□□ -0.03
KXD1P53158 Q0182Q0182 405 nt14.57□□□□□ -0.08
KXD1P53158 RTC3YHR087W 336 nt14.49□□□□□ -0.09
KXD1P53158 RVS167YDR388W 1449 nt14.49□□□□□ -0.09
KXD1P53158 MOT3YMR070W 1473 nt14.44□□□□□ -0.1
KXD1P53158 ATS1YAL020C 1002 nt14.43□□□□□ -0.1
KXD1P53158 SCJ1YMR214W 1134 nt14.43□□□□□ -0.1
KXD1P53158 PET122YER153C 765 nt14.41□□□□□ -0.1
KXD1P53158 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.36□□□□□ -0.11
KXD1P53158 YGR139WYGR139W 339 nt14.31□□□□□ -0.12
KXD1P53158 SCR1SCR1 522 nt14.25□□□□□ -0.13
KXD1P53158 SHR5YOL110W 714 nt14.01□□□□□ -0.17
KXD1P53158 RRN5YLR141W 1092 nt13.99□□□□□ -0.17
KXD1P53158 YDJ1YNL064C 1230 nt13.92□□□□□ -0.18
KXD1P53158 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.72□□□□□ -0.21
KXD1P53158 RSB1YOR049C 1065 nt13.69□□□□□ -0.22
KXD1P53158 NME1NME1 340 nt13.62□□□□□ -0.23
KXD1P53158 URN1YPR152C 1398 nt13.59□□□□□ -0.23
KXD1P53158 GAR1YHR089C 618 nt13.55□□□□□ -0.24
KXD1P53158 DEP1YAL013W 1218 nt13.55□□□□□ -0.24
KXD1P53158 PUT4YOR348C 1884 nt13.5□□□□□ -0.25
KXD1P53158 OPI9YLR338W 858 nt13.42□□□□□ -0.26
KXD1P53158 RPN10YHR200W 807 nt13.4□□□□□ -0.26
KXD1P53158 YNL208WYNL208W 600 nt13.39□□□□□ -0.27
KXD1P53158 PST2YDR032C 597 nt13.38□□□□□ -0.27
KXD1P53158 SAH1YER043C 1350 nt13.31□□□□□ -0.28
KXD1P53158 SSA3YBL075C 1950 nt13.25□□□□□ -0.29
KXD1P53158 ARE1YCR048W 1833 nt13.25□□□□□ -0.29
KXD1P53158 TIR1YER011W 765 nt13.12□□□□□ -0.31
KXD1P53158 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.07□□□□□ -0.32
KXD1P53158 POA1YBR022W 534 nt13.05□□□□□ -0.32
KXD1P53158 PUN1YLR414C 792 nt13.03□□□□□ -0.32
KXD1P53158 YJR018WYJR018W 363 nt12.97□□□□□ -0.33
KXD1P53158 SSA1YAL005C 1929 nt12.96□□□□□ -0.33
KXD1P53158 CSM2YIL132C 642 nt12.96□□□□□ -0.33
KXD1P53158 PTC2YER089C 1395 nt12.84□□□□□ -0.35
KXD1P53158 SHU1YHL006C 453 nt12.82□□□□□ -0.36
KXD1P53158 YKL097CYKL097C 411 nt12.82□□□□□ -0.36
KXD1P53158 YJR120WYJR120W 351 nt12.8□□□□□ -0.36
KXD1P53158 BSC6YOL137W 1494 nt12.78□□□□□ -0.36
KXD1P53158 SRB2YHR041C 633 nt12.75□□□□□ -0.37
KXD1P53158 BUD23YCR047C 828 nt12.74□□□□□ -0.37
KXD1P53158 RPP2BYDR382W 333 nt12.71□□□□□ -0.37
KXD1P53158 NAB2YGL122C 1578 nt12.69□□□□□ -0.38
KXD1P53158 PAU21YOR394W 495 nt12.68□□□□□ -0.38
KXD1P53158 PAU22YPL282C 495 nt12.68□□□□□ -0.38
KXD1P53158 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.58□□□□□ -0.4
KXD1P53158 ARO7YPR060C 771 nt12.57□□□□□ -0.4
KXD1P53158 INM2YDR287W 879 nt12.53□□□□□ -0.4
KXD1P53158 WWM1YFL010C 636 nt12.53□□□□□ -0.4
KXD1P53158 FIS1YIL065C 468 nt12.53□□□□□ -0.4
KXD1P53158 DAL1YIR027C 1383 nt12.53□□□□□ -0.4
KXD1P53158 YGR021WYGR021W 873 nt12.48□□□□□ -0.41
KXD1P53158 BDH2YAL061W 1254 nt12.48□□□□□ -0.41
KXD1P53158 HOM6YJR139C 1080 nt12.45□□□□□ -0.42
KXD1P53158 FPR4YLR449W 1179 nt12.44□□□□□ -0.42
KXD1P53158 PHO4YFR034C 939 nt12.4□□□□□ -0.42
KXD1P53158 YBL100CYBL100C 315 nt12.39□□□□□ -0.43
KXD1P53158 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.36□□□□□ -0.43
KXD1P53158 MNP1YGL068W 585 nt12.35□□□□□ -0.43
KXD1P53158 LSM3YLR438C-A 270 nt12.33□□□□□ -0.44
KXD1P53158 YOR139CYOR139C 393 nt12.33□□□□□ -0.44
KXD1P53158 PAM17YKR065C 594 nt12.31□□□□□ -0.44
KXD1P53158 RKM5YLR137W 1104 nt12.26□□□□□ -0.45
KXD1P53158 REG2YBR050C 1017 nt12.25□□□□□ -0.45
KXD1P53158 FUN26YAL022C 1554 nt12.25□□□□□ -0.45
KXD1P53158 TRM9YML014W 840 nt12.22□□□□□ -0.45
KXD1P53158 SPT5YML010W 3192 nt12.21□□□□□ -0.45
KXD1P53158 NPL3YDR432W 1245 nt12.19□□□□□ -0.46
KXD1P53158 YOL037CYOL037C 354 nt12.19□□□□□ -0.46
KXD1P53158 YPS1YLR120C 1710 nt12.17□□□□□ -0.46
KXD1P53158 CCT6YDR188W 1641 nt12.12□□□□□ -0.47
KXD1P53158 YDR095CYDR095C 411 nt12.11□□□□□ -0.47
KXD1P53158 ALF1YNL148C 765 nt12.06□□□□□ -0.48
KXD1P53158 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.01□□□□□ -0.49
KXD1P53158 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.3 ms