Protein–RNA interactions for Protein: Q12372

MMP1, S-methylmethionine permease 1, yeastyeast

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MMP1Q12372 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.89■□□□□ 0.61
MMP1Q12372 NSR1YGR159C 1245 nt18.88■□□□□ 0.61
MMP1Q12372 NOP1YDL014W 984 nt18.33■□□□□ 0.52
MMP1Q12372 YKL036CYKL036C 393 nt16.93■□□□□ 0.3
MMP1Q12372 MDJ1YFL016C 1536 nt16.8■□□□□ 0.28
MMP1Q12372 Q0297Q0297 156 nt16.16■□□□□ 0.18
MMP1Q12372 SRX1YKL086W 384 nt16.11■□□□□ 0.17
MMP1Q12372 Q0182Q0182 405 nt15.9■□□□□ 0.14
MMP1Q12372 YJL027CYJL027C 417 nt15.76■□□□□ 0.11
MMP1Q12372 MOT3YMR070W 1473 nt15.75■□□□□ 0.11
MMP1Q12372 SCS3YGL126W 1143 nt15.44■□□□□ 0.06
MMP1Q12372 YCR051WYCR051W 669 nt15.18■□□□□ 0.02
MMP1Q12372 DBP2YNL112W 1641 nt14.98□□□□□ -0.01
MMP1Q12372 YOL085CYOL085C 342 nt14.73□□□□□ -0.05
MMP1Q12372 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.62□□□□□ -0.07
MMP1Q12372 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.62□□□□□ -0.07
MMP1Q12372 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.62□□□□□ -0.07
MMP1Q12372 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.62□□□□□ -0.07
MMP1Q12372 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.62□□□□□ -0.07
MMP1Q12372 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.62□□□□□ -0.07
MMP1Q12372 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.62□□□□□ -0.07
MMP1Q12372 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.62□□□□□ -0.07
MMP1Q12372 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.62□□□□□ -0.07
MMP1Q12372 YGR139WYGR139W 339 nt14.56□□□□□ -0.08
MMP1Q12372 RPP1BYDL130W 321 nt14.46□□□□□ -0.09
MMP1Q12372 PKP1YIL042C 1185 nt14.45□□□□□ -0.1
MMP1Q12372 CCC1YLR220W 969 nt14.35□□□□□ -0.11
MMP1Q12372 YBR190WYBR190W 312 nt14.33□□□□□ -0.12
MMP1Q12372 NME1NME1 340 nt14.3□□□□□ -0.12
MMP1Q12372 SCJ1YMR214W 1134 nt13.95□□□□□ -0.18
MMP1Q12372 RTC3YHR087W 336 nt13.89□□□□□ -0.19
MMP1Q12372 PET122YER153C 765 nt13.84□□□□□ -0.19
MMP1Q12372 RVS167YDR388W 1449 nt13.83□□□□□ -0.2
MMP1Q12372 ATS1YAL020C 1002 nt13.8□□□□□ -0.2
MMP1Q12372 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.79□□□□□ -0.2
MMP1Q12372 SCR1SCR1 522 nt13.56□□□□□ -0.24
MMP1Q12372 SHR5YOL110W 714 nt13.45□□□□□ -0.26
MMP1Q12372 RRN5YLR141W 1092 nt13.42□□□□□ -0.26
MMP1Q12372 CSM2YIL132C 642 nt13.38□□□□□ -0.27
MMP1Q12372 SSA3YBL075C 1950 nt13.38□□□□□ -0.27
MMP1Q12372 YDJ1YNL064C 1230 nt13.36□□□□□ -0.27
MMP1Q12372 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.18□□□□□ -0.3
MMP1Q12372 PUT4YOR348C 1884 nt13.14□□□□□ -0.31
MMP1Q12372 URN1YPR152C 1398 nt13.07□□□□□ -0.32
MMP1Q12372 RSB1YOR049C 1065 nt13.06□□□□□ -0.32
MMP1Q12372 DEP1YAL013W 1218 nt13.04□□□□□ -0.32
MMP1Q12372 PAU21YOR394W 495 nt13.04□□□□□ -0.32
MMP1Q12372 PAU22YPL282C 495 nt13.04□□□□□ -0.32
MMP1Q12372 GAR1YHR089C 618 nt13□□□□□ -0.33
MMP1Q12372 OPI9YLR338W 858 nt12.94□□□□□ -0.34
MMP1Q12372 ARO7YPR060C 771 nt12.9□□□□□ -0.34
MMP1Q12372 ARE1YCR048W 1833 nt12.88□□□□□ -0.35
MMP1Q12372 SAH1YER043C 1350 nt12.85□□□□□ -0.35
MMP1Q12372 PST2YDR032C 597 nt12.85□□□□□ -0.35
MMP1Q12372 YNL208WYNL208W 600 nt12.84□□□□□ -0.35
MMP1Q12372 RPN10YHR200W 807 nt12.78□□□□□ -0.36
MMP1Q12372 POA1YBR022W 534 nt12.63□□□□□ -0.39
MMP1Q12372 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.61□□□□□ -0.39
MMP1Q12372 TIR1YER011W 765 nt12.6□□□□□ -0.39
MMP1Q12372 SSA1YAL005C 1929 nt12.52□□□□□ -0.41
MMP1Q12372 REG2YBR050C 1017 nt12.51□□□□□ -0.41
MMP1Q12372 PUN1YLR414C 792 nt12.5□□□□□ -0.41
MMP1Q12372 YJR018WYJR018W 363 nt12.47□□□□□ -0.41
MMP1Q12372 MET8YBR213W 825 nt12.47□□□□□ -0.41
MMP1Q12372 YJR120WYJR120W 351 nt12.45□□□□□ -0.42
MMP1Q12372 SRB2YHR041C 633 nt12.4□□□□□ -0.42
MMP1Q12372 PAM17YKR065C 594 nt12.39□□□□□ -0.43
MMP1Q12372 BSC6YOL137W 1494 nt12.39□□□□□ -0.43
MMP1Q12372 PTC2YER089C 1395 nt12.37□□□□□ -0.43
MMP1Q12372 CLB6YGR109C 1143 nt12.32□□□□□ -0.44
MMP1Q12372 SHU1YHL006C 453 nt12.31□□□□□ -0.44
MMP1Q12372 BUD23YCR047C 828 nt12.24□□□□□ -0.45
MMP1Q12372 NAB2YGL122C 1578 nt12.22□□□□□ -0.45
MMP1Q12372 YKL097CYKL097C 411 nt12.2□□□□□ -0.46
MMP1Q12372 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt12.18□□□□□ -0.46
MMP1Q12372 FIS1YIL065C 468 nt12.13□□□□□ -0.47
MMP1Q12372 RPP2BYDR382W 333 nt12.11□□□□□ -0.47
MMP1Q12372 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.09□□□□□ -0.47
MMP1Q12372 SPT5YML010W 3192 nt12.07□□□□□ -0.48
MMP1Q12372 ARA2YMR041C 1008 nt12.07□□□□□ -0.48
MMP1Q12372 DAL1YIR027C 1383 nt12.05□□□□□ -0.48
MMP1Q12372 WWM1YFL010C 636 nt12.05□□□□□ -0.48
MMP1Q12372 BUR6YER159C 429 nt12.03□□□□□ -0.48
MMP1Q12372 INM2YDR287W 879 nt12.02□□□□□ -0.49
MMP1Q12372 Q0010Q0010 387 nt12.02□□□□□ -0.49
MMP1Q12372 YLR122CYLR122C 378 nt11.99□□□□□ -0.49
MMP1Q12372 BDH2YAL061W 1254 nt11.98□□□□□ -0.49
MMP1Q12372 PHO4YFR034C 939 nt11.96□□□□□ -0.49
MMP1Q12372 HOM6YJR139C 1080 nt11.96□□□□□ -0.49
MMP1Q12372 FPR4YLR449W 1179 nt11.92□□□□□ -0.5
MMP1Q12372 YGR021WYGR021W 873 nt11.91□□□□□ -0.5
MMP1Q12372 YBL100CYBL100C 315 nt11.89□□□□□ -0.51
MMP1Q12372 MNP1YGL068W 585 nt11.87□□□□□ -0.51
MMP1Q12372 BMT5YIL096C 1011 nt11.87□□□□□ -0.51
MMP1Q12372 YOR139CYOR139C 393 nt11.85□□□□□ -0.51
MMP1Q12372 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.84□□□□□ -0.51
MMP1Q12372 LSM3YLR438C-A 270 nt11.82□□□□□ -0.52
MMP1Q12372 ABZ2YMR289W 1125 nt11.8□□□□□ -0.52
MMP1Q12372 LCP5YER127W 1074 nt11.79□□□□□ -0.52
MMP1Q12372 FUN26YAL022C 1554 nt11.79□□□□□ -0.52
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