RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W MTC1P47018 478 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
VFA1YER128W FAP1P53971 965 aa12.8□□□□□ -0.36
VFA1YER128W DRS1P32892 752 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
VFA1YER128W PRY3P47033 881 aa12.03□□□□□ -0.48
VFA1YER128W PRI1P10363 409 aa11.74□□□□□ -0.53
VFA1YER128W AAD16Q02895 342 aa11.73□□□□□ -0.53
VFA1YER128W ISW2Q08773 1120 aa11.45□□□□□ -0.58
VFA1YER128W RPG1P38249 964 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
VFA1YER128W YCK3P39962 524 aa11.26□□□□□ -0.61
VFA1YER128W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
VFA1YER128W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
VFA1YER128W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
VFA1YER128W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
VFA1YER128W MRPL32P25348 183 aa10.68□□□□□ -0.7
VFA1YER128W REB1P21538 810 aa10.45□□□□□ -0.74
VFA1YER128W AVT3P36062 692 aa10.44□□□□□ -0.74
VFA1YER128W RPL17AP05740 184 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
VFA1YER128W RPL17BP46990 184 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
VFA1YER128W YGL015CP33199 130 aa10.35□□□□□ -0.75
VFA1YER128W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
VFA1YER128W CDC27P38042 758 aa10.02□□□□□ -0.81
VFA1YER128W SPT21P35209 758 aa9.91□□□□□ -0.82
VFA1YER128W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
VFA1YER128W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
VFA1YER128W MAP2P38174 421 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
VFA1YER128W HOP09932 586 aa9.71□□□□□ -0.86
VFA1YER128W TFC8Q12308 588 aa9.71□□□□□ -0.86
VFA1YER128W DCD1P06773 312 aa9.68□□□□□ -0.86
VFA1YER128W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
VFA1YER128W SCY1P53009 804 aa9.52□□□□□ -0.89
VFA1YER128W RIM101P33400 625 aa9.48□□□□□ -0.89
VFA1YER128W TIF4632P39936 914 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
VFA1YER128W SLX5P32828 619 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
VFA1YER128W TGL3P40308 642 aa9.39□□□□□ -0.91
VFA1YER128W BCH2P36122 765 aa9.37□□□□□ -0.91
VFA1YER128W UBP9P39967 754 aa9.26□□□□□ -0.93
VFA1YER128W SIS1P25294 352 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
VFA1YER128W OXP1P28273 1286 aa9.14□□□□□ -0.95
VFA1YER128W EPS1P40557 701 aa9.12□□□□□ -0.95
VFA1YER128W BDF1P35817 686 aa9.09□□□□□ -0.95
VFA1YER128W PTP3P40048 928 aa9.08□□□□□ -0.96
VFA1YER128W YIL055CP40523 627 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
VFA1YER128W BBC1P47068 1157 aa8.93□□□□□ -0.98
VFA1YER128W MST1P07236 462 aa8.92□□□□□ -0.98
VFA1YER128W YOR238WQ08634 303 aa8.92□□□□□ -0.98
VFA1YER128W RSM7P47150 247 aa8.9□□□□□ -0.98
VFA1YER128W YBL029C-AQ3E756 94 aa8.87□□□□□ -0.99
VFA1YER128W AI2P03876 854 aa8.86□□□□□ -0.99
VFA1YER128W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
VFA1YER128W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data8.84□□□□□ -0.99 RIP-Chip
VFA1YER128W YAP5P40574 245 aa8.8□□□□□ -1
VFA1YER128W VNX1P42839 908 aa8.75□□□□□ -1.01
VFA1YER128W TFA1P36100 482 aa8.74□□□□□ -1.01
VFA1YER128W SPP1Q03012 353 aa8.7□□□□□ -1.02
VFA1YER128W WSC3Q12215 556 aa8.69□□□□□ -1.02
VFA1YER128W YLR271WQ06152 274 aa8.66□□□□□ -1.02
VFA1YER128W GTT3P39996 337 aa8.64□□□□□ -1.03
VFA1YER128W TIF11P38912 153 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
VFA1YER128W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
VFA1YER128W MRM1P25270 412 aa8.52□□□□□ -1.05
VFA1YER128W PIB1Q06651 286 aa8.52□□□□□ -1.05
VFA1YER128W YJL171CP46992 396 aa8.51□□□□□ -1.05
VFA1YER128W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
VFA1YER128W FKH1P40466 484 aa8.5□□□□□ -1.05
VFA1YER128W ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data8.49□□□□□ -1.05 RIP-Chip
VFA1YER128W SSP1P38871 571 aa8.47□□□□□ -1.05
VFA1YER128W ULI1P43604 169 aa8.46□□□□□ -1.06
VFA1YER128W LDB19Q12502 818 aa8.45□□□□□ -1.06
VFA1YER128W IOC2Q12072 812 aa8.41□□□□□ -1.06
VFA1YER128W MSB4Q12317 492 aa8.39□□□□□ -1.07
VFA1YER128W EAP1P36041 632 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
VFA1YER128W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data8.35□□□□□ -1.07not detected
VFA1YER128W BMT6Q12291 365 aa8.35□□□□□ -1.07
VFA1YER128W CST9Q06032 482 aa8.33□□□□□ -1.08
VFA1YER128W YOL036WQ08206 761 aa8.33□□□□□ -1.08
VFA1YER128W DBP1P24784 617 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
VFA1YER128W RTG3P38165 486 aa8.32□□□□□ -1.08
VFA1YER128W MGA2P40578 1113 aa8.32□□□□□ -1.08
VFA1YER128W SET4P42948 560 aa8.32□□□□□ -1.08
VFA1YER128W VPS29P38759 282 aa8.31□□□□□ -1.08
VFA1YER128W YFR006WP43590 535 aa8.29□□□□□ -1.08
VFA1YER128W TRP5P00931 707 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
VFA1YER128W RTG1P32607 177 aa8.27□□□□□ -1.09
VFA1YER128W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
VFA1YER128W STS1P38637 319 aa8.24□□□□□ -1.09
VFA1YER128W NCR1Q12200 1170 aa8.23□□□□□ -1.09
VFA1YER128W YNL035CP53962 389 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
VFA1YER128W SAM3Q08986 587 aa8.2□□□□□ -1.1
VFA1YER128W SEC61P32915 480 aa8.19□□□□□ -1.1
VFA1YER128W RCR1P38212 213 aa8.17□□□□□ -1.1
VFA1YER128W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
VFA1YER128W ABP1P15891 592 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
VFA1YER128W GYP5Q12344 894 aa8.1□□□□□ -1.11
VFA1YER128W JIP4Q03361 876 aa8.08□□□□□ -1.12
VFA1YER128W HTA1P04911 132 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
VFA1YER128W HTA2P04912 132 aa8.06□□□□□ -1.12
VFA1YER128W SAP30P38429 201 aa8.05□□□□□ -1.12
VFA1YER128W DAN4P47179 1161 aa8.05□□□□□ -1.12
VFA1YER128W DCW1P36091 449 aa8.04□□□□□ -1.12
VFA1YER128W YDL129WQ07555 291 aa8.01□□□□□ -1.13
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