Protein–RNA interactions for Protein: P53189

SCW11, Probable family 17 glucosidase SCW11, yeastyeast

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SCW11P53189 NSR1YGR159C 1245 nt18.12■□□□□ 0.49
SCW11P53189 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.83■□□□□ 0.44
SCW11P53189 NOP1YDL014W 984 nt17.02■□□□□ 0.32
SCW11P53189 MDJ1YFL016C 1536 nt16.7■□□□□ 0.26
SCW11P53189 YKL036CYKL036C 393 nt15.28■□□□□ 0.04
SCW11P53189 YJL027CYJL027C 417 nt15.27■□□□□ 0.04
SCW11P53189 SRX1YKL086W 384 nt14.93□□□□□ -0.02
SCW11P53189 Q0297Q0297 156 nt14.79□□□□□ -0.04
SCW11P53189 DBP2YNL112W 1641 nt14.58□□□□□ -0.08
SCW11P53189 YBR190WYBR190W 312 nt14.29□□□□□ -0.12
SCW11P53189 YCR051WYCR051W 669 nt14.15□□□□□ -0.14
SCW11P53189 RTC3YHR087W 336 nt13.96□□□□□ -0.17
SCW11P53189 SSA3YBL075C 1950 nt13.86□□□□□ -0.19
SCW11P53189 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.83□□□□□ -0.2
SCW11P53189 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.83□□□□□ -0.2
SCW11P53189 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.83□□□□□ -0.2
SCW11P53189 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.83□□□□□ -0.2
SCW11P53189 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.83□□□□□ -0.2
SCW11P53189 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.83□□□□□ -0.2
SCW11P53189 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.83□□□□□ -0.2
SCW11P53189 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.83□□□□□ -0.2
SCW11P53189 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.83□□□□□ -0.2
SCW11P53189 CCC1YLR220W 969 nt13.73□□□□□ -0.21
SCW11P53189 SCS3YGL126W 1143 nt13.68□□□□□ -0.22
SCW11P53189 PUT4YOR348C 1884 nt13.44□□□□□ -0.26
SCW11P53189 RVS167YDR388W 1449 nt13.43□□□□□ -0.26
SCW11P53189 SCJ1YMR214W 1134 nt13.4□□□□□ -0.26
SCW11P53189 YOL085CYOL085C 342 nt13.29□□□□□ -0.28
SCW11P53189 RPP1BYDL130W 321 nt13.27□□□□□ -0.29
SCW11P53189 PKP1YIL042C 1185 nt13.21□□□□□ -0.29
SCW11P53189 YGR139WYGR139W 339 nt13.14□□□□□ -0.31
SCW11P53189 ARE1YCR048W 1833 nt13.04□□□□□ -0.32
SCW11P53189 POA1YBR022W 534 nt12.98□□□□□ -0.33
SCW11P53189 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.92□□□□□ -0.34
SCW11P53189 SAH1YER043C 1350 nt12.9□□□□□ -0.34
SCW11P53189 URN1YPR152C 1398 nt12.9□□□□□ -0.34
SCW11P53189 SHR5YOL110W 714 nt12.88□□□□□ -0.35
SCW11P53189 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.86□□□□□ -0.35
SCW11P53189 PET122YER153C 765 nt12.8□□□□□ -0.36
SCW11P53189 OPI9YLR338W 858 nt12.8□□□□□ -0.36
SCW11P53189 BSC6YOL137W 1494 nt12.79□□□□□ -0.36
SCW11P53189 DEP1YAL013W 1218 nt12.79□□□□□ -0.36
SCW11P53189 SPT5YML010W 3192 nt12.64□□□□□ -0.39
SCW11P53189 BUD23YCR047C 828 nt12.52□□□□□ -0.41
SCW11P53189 Q0182Q0182 405 nt12.5□□□□□ -0.41
SCW11P53189 RPN10YHR200W 807 nt12.47□□□□□ -0.41
SCW11P53189 YDJ1YNL064C 1230 nt12.46□□□□□ -0.41
SCW11P53189 MOT3YMR070W 1473 nt12.45□□□□□ -0.42
SCW11P53189 YNL208WYNL208W 600 nt12.43□□□□□ -0.42
SCW11P53189 SSA4YER103W 1929 nt12.41□□□□□ -0.42
SCW11P53189 SCR1SCR1 522 nt12.41□□□□□ -0.42
SCW11P53189 PTC2YER089C 1395 nt12.38□□□□□ -0.43
SCW11P53189 RRN5YLR141W 1092 nt12.37□□□□□ -0.43
SCW11P53189 PUN1YLR414C 792 nt12.37□□□□□ -0.43
SCW11P53189 GAR1YHR089C 618 nt12.32□□□□□ -0.44
SCW11P53189 ATS1YAL020C 1002 nt12.26□□□□□ -0.45
SCW11P53189 YJR018WYJR018W 363 nt12.25□□□□□ -0.45
SCW11P53189 NAB2YGL122C 1578 nt12.25□□□□□ -0.45
SCW11P53189 NME1NME1 340 nt12.15□□□□□ -0.46
SCW11P53189 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.11□□□□□ -0.47
SCW11P53189 FIS1YIL065C 468 nt12.08□□□□□ -0.48
SCW11P53189 YJR120WYJR120W 351 nt12.05□□□□□ -0.48
SCW11P53189 MEP2YNL142W 1500 nt12.05□□□□□ -0.48
SCW11P53189 BDF1YLR399C 2061 nt12.01□□□□□ -0.49
SCW11P53189 FPR4YLR449W 1179 nt11.99□□□□□ -0.49
SCW11P53189 DAL1YIR027C 1383 nt11.99□□□□□ -0.49
SCW11P53189 SSA1YAL005C 1929 nt11.94□□□□□ -0.5
SCW11P53189 RSB1YOR049C 1065 nt11.93□□□□□ -0.5
SCW11P53189 TIR1YER011W 765 nt11.92□□□□□ -0.5
SCW11P53189 DCW1YKL046C 1350 nt11.92□□□□□ -0.5
SCW11P53189 PHO4YFR034C 939 nt11.91□□□□□ -0.5
SCW11P53189 YPS1YLR120C 1710 nt11.87□□□□□ -0.51
SCW11P53189 INM2YDR287W 879 nt11.83□□□□□ -0.52
SCW11P53189 TAT1YBR069C 1860 nt11.81□□□□□ -0.52
SCW11P53189 RPP2BYDR382W 333 nt11.79□□□□□ -0.52
SCW11P53189 CSM2YIL132C 642 nt11.77□□□□□ -0.53
SCW11P53189 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.75□□□□□ -0.53
SCW11P53189 SRB2YHR041C 633 nt11.73□□□□□ -0.53
SCW11P53189 YDR095CYDR095C 411 nt11.7□□□□□ -0.54
SCW11P53189 EMI2YDR516C 1503 nt11.69□□□□□ -0.54
SCW11P53189 YBL100CYBL100C 315 nt11.67□□□□□ -0.54
SCW11P53189 YBR220CYBR220C 1683 nt11.66□□□□□ -0.54
SCW11P53189 CAC2YML102W 1407 nt11.59□□□□□ -0.55
SCW11P53189 PAU21YOR394W 495 nt11.58□□□□□ -0.56
SCW11P53189 PAU22YPL282C 495 nt11.58□□□□□ -0.56
SCW11P53189 PTP1YDL230W 1008 nt11.56□□□□□ -0.56
SCW11P53189 YMR090WYMR090W 684 nt11.55□□□□□ -0.56
SCW11P53189 YDL221WYDL221W 552 nt11.54□□□□□ -0.56
SCW11P53189 FUN26YAL022C 1554 nt11.54□□□□□ -0.56
SCW11P53189 BDH2YAL061W 1254 nt11.52□□□□□ -0.57
SCW11P53189 SDH1YKL148C 1923 nt11.51□□□□□ -0.57
SCW11P53189 ARO7YPR060C 771 nt11.48□□□□□ -0.57
SCW11P53189 RPP2AYOL039W 321 nt11.47□□□□□ -0.57
SCW11P53189 ALF1YNL148C 765 nt11.43□□□□□ -0.58
SCW11P53189 PAM17YKR065C 594 nt11.41□□□□□ -0.58
SCW11P53189 IRC15YPL017C 1500 nt11.39□□□□□ -0.59
SCW11P53189 TRM9YML014W 840 nt11.38□□□□□ -0.59
SCW11P53189 PAC11YDR488C 1602 nt11.38□□□□□ -0.59
SCW11P53189 SCC4YER147C 1875 nt11.36□□□□□ -0.59
SCW11P53189 WWM1YFL010C 636 nt11.35□□□□□ -0.59
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