Protein–RNA interactions for Protein: Q12424

YDL206W, Putative cation exchanger YDL206W, yeastyeast

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDL206WQ12424 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.04■■□□□ 1.12
YDL206WQ12424 NSR1YGR159C 1245 nt21.87■■□□□ 1.09
YDL206WQ12424 NOP1YDL014W 984 nt21.32■■□□□ 1
YDL206WQ12424 YKL036CYKL036C 393 nt19.68■□□□□ 0.74
YDL206WQ12424 MDJ1YFL016C 1536 nt19.56■□□□□ 0.72
YDL206WQ12424 Q0297Q0297 156 nt18.68■□□□□ 0.58
YDL206WQ12424 SRX1YKL086W 384 nt18.67■□□□□ 0.58
YDL206WQ12424 YJL027CYJL027C 417 nt18.37■□□□□ 0.53
YDL206WQ12424 SCS3YGL126W 1143 nt17.91■□□□□ 0.46
YDL206WQ12424 YCR051WYCR051W 669 nt17.74■□□□□ 0.43
YDL206WQ12424 DBP2YNL112W 1641 nt17.27■□□□□ 0.36
YDL206WQ12424 YOL085CYOL085C 342 nt17.07■□□□□ 0.32
YDL206WQ12424 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.92■□□□□ 0.3
YDL206WQ12424 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.92■□□□□ 0.3
YDL206WQ12424 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.92■□□□□ 0.3
YDL206WQ12424 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.92■□□□□ 0.3
YDL206WQ12424 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.92■□□□□ 0.3
YDL206WQ12424 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.92■□□□□ 0.3
YDL206WQ12424 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.92■□□□□ 0.3
YDL206WQ12424 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.92■□□□□ 0.3
YDL206WQ12424 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.92■□□□□ 0.3
YDL206WQ12424 PKP1YIL042C 1185 nt16.87■□□□□ 0.29
YDL206WQ12424 CCC1YLR220W 969 nt16.79■□□□□ 0.28
YDL206WQ12424 RPP1BYDL130W 321 nt16.77■□□□□ 0.28
YDL206WQ12424 YBR190WYBR190W 312 nt16.61■□□□□ 0.25
YDL206WQ12424 RTC3YHR087W 336 nt16.28■□□□□ 0.2
YDL206WQ12424 SCJ1YMR214W 1134 nt16.16■□□□□ 0.18
YDL206WQ12424 RVS167YDR388W 1449 nt16.15■□□□□ 0.18
YDL206WQ12424 PET122YER153C 765 nt16.07■□□□□ 0.16
YDL206WQ12424 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16■□□□□ 0.15
YDL206WQ12424 ATS1YAL020C 1002 nt15.99■□□□□ 0.15
YDL206WQ12424 SCR1SCR1 522 nt15.82■□□□□ 0.12
YDL206WQ12424 SHR5YOL110W 714 nt15.61■□□□□ 0.09
YDL206WQ12424 RRN5YLR141W 1092 nt15.6■□□□□ 0.09
YDL206WQ12424 YDJ1YNL064C 1230 nt15.44■□□□□ 0.06
YDL206WQ12424 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.28■□□□□ 0.04
YDL206WQ12424 DEP1YAL013W 1218 nt15.26■□□□□ 0.03
YDL206WQ12424 RSB1YOR049C 1065 nt15.26■□□□□ 0.03
YDL206WQ12424 URN1YPR152C 1398 nt15.23■□□□□ 0.03
YDL206WQ12424 GAR1YHR089C 618 nt15.16■□□□□ 0.02
YDL206WQ12424 PUT4YOR348C 1884 nt15.14■□□□□ 0.01
YDL206WQ12424 OPI9YLR338W 858 nt14.99□□□□□ -0.01
YDL206WQ12424 Q0182Q0182 405 nt14.97□□□□□ -0.01
YDL206WQ12424 SAH1YER043C 1350 nt14.95□□□□□ -0.02
YDL206WQ12424 RPN10YHR200W 807 nt14.93□□□□□ -0.02
YDL206WQ12424 YNL208WYNL208W 600 nt14.93□□□□□ -0.02
YDL206WQ12424 MOT3YMR070W 1473 nt14.9□□□□□ -0.02
YDL206WQ12424 ARE1YCR048W 1833 nt14.87□□□□□ -0.03
YDL206WQ12424 PST2YDR032C 597 nt14.82□□□□□ -0.04
YDL206WQ12424 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.7□□□□□ -0.06
YDL206WQ12424 POA1YBR022W 534 nt14.7□□□□□ -0.06
YDL206WQ12424 TIR1YER011W 765 nt14.64□□□□□ -0.07
YDL206WQ12424 PUN1YLR414C 792 nt14.54□□□□□ -0.08
YDL206WQ12424 YJR018WYJR018W 363 nt14.51□□□□□ -0.09
YDL206WQ12424 SSA1YAL005C 1929 nt14.49□□□□□ -0.09
YDL206WQ12424 PTC2YER089C 1395 nt14.41□□□□□ -0.1
YDL206WQ12424 BSC6YOL137W 1494 nt14.38□□□□□ -0.11
YDL206WQ12424 BUD23YCR047C 828 nt14.36□□□□□ -0.11
YDL206WQ12424 YJR120WYJR120W 351 nt14.33□□□□□ -0.12
YDL206WQ12424 SRB2YHR041C 633 nt14.31□□□□□ -0.12
YDL206WQ12424 YGR139WYGR139W 339 nt14.29□□□□□ -0.12
YDL206WQ12424 SHU1YHL006C 453 nt14.26□□□□□ -0.13
YDL206WQ12424 SSA3YBL075C 1950 nt14.2□□□□□ -0.14
YDL206WQ12424 YKL097CYKL097C 411 nt14.2□□□□□ -0.14
YDL206WQ12424 NAB2YGL122C 1578 nt14.19□□□□□ -0.14
YDL206WQ12424 RPP2BYDR382W 333 nt14.17□□□□□ -0.14
YDL206WQ12424 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.09□□□□□ -0.15
YDL206WQ12424 FIS1YIL065C 468 nt14.03□□□□□ -0.16
YDL206WQ12424 WWM1YFL010C 636 nt14.02□□□□□ -0.17
YDL206WQ12424 FPR4YLR449W 1179 nt14.02□□□□□ -0.17
YDL206WQ12424 DAL1YIR027C 1383 nt14□□□□□ -0.17
YDL206WQ12424 INM2YDR287W 879 nt13.96□□□□□ -0.17
YDL206WQ12424 BDH2YAL061W 1254 nt13.91□□□□□ -0.18
YDL206WQ12424 PHO4YFR034C 939 nt13.9□□□□□ -0.18
YDL206WQ12424 YBL100CYBL100C 315 nt13.86□□□□□ -0.19
YDL206WQ12424 YGR021WYGR021W 873 nt13.84□□□□□ -0.19
YDL206WQ12424 HOM6YJR139C 1080 nt13.84□□□□□ -0.19
YDL206WQ12424 MNP1YGL068W 585 nt13.82□□□□□ -0.2
YDL206WQ12424 NME1NME1 340 nt13.77□□□□□ -0.21
YDL206WQ12424 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.73□□□□□ -0.21
YDL206WQ12424 FUN26YAL022C 1554 nt13.7□□□□□ -0.22
YDL206WQ12424 LSM3YLR438C-A 270 nt13.68□□□□□ -0.22
YDL206WQ12424 YOR139CYOR139C 393 nt13.68□□□□□ -0.22
YDL206WQ12424 SPT5YML010W 3192 nt13.68□□□□□ -0.22
YDL206WQ12424 RKM5YLR137W 1104 nt13.64□□□□□ -0.23
YDL206WQ12424 TRM9YML014W 840 nt13.64□□□□□ -0.23
YDL206WQ12424 YPS1YLR120C 1710 nt13.62□□□□□ -0.23
YDL206WQ12424 YDR095CYDR095C 411 nt13.54□□□□□ -0.24
YDL206WQ12424 NPL3YDR432W 1245 nt13.54□□□□□ -0.24
YDL206WQ12424 ALF1YNL148C 765 nt13.5□□□□□ -0.25
YDL206WQ12424 CCT6YDR188W 1641 nt13.5□□□□□ -0.25
YDL206WQ12424 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.49□□□□□ -0.25
YDL206WQ12424 YOL037CYOL037C 354 nt13.48□□□□□ -0.25
YDL206WQ12424 MEP2YNL142W 1500 nt13.48□□□□□ -0.25
YDL206WQ12424 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.36□□□□□ -0.27
YDL206WQ12424 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.36□□□□□ -0.27
YDL206WQ12424 DCW1YKL046C 1350 nt13.32□□□□□ -0.28
YDL206WQ12424 SIS1YNL007C 1059 nt13.3□□□□□ -0.28
YDL206WQ12424 RPP2AYOL039W 321 nt13.28□□□□□ -0.28
YDL206WQ12424 PTP1YDL230W 1008 nt13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.4 ms