Protein–RNA interactions for Protein: Q12470

TY1A-NL2, Transposon Ty1-NL2 Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL2Q12470 NSR1YGR159C 1245 nt16.05■□□□□ 0.16
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TY1A-NL2Q12470 MDJ1YFL016C 1536 nt15.07■□□□□ 0
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TY1A-NL2Q12470 YGR139WYGR139W 339 nt14.67□□□□□ -0.06
TY1A-NL2Q12470 MOT3YMR070W 1473 nt14.55□□□□□ -0.08
TY1A-NL2Q12470 Q0182Q0182 405 nt14.43□□□□□ -0.1
TY1A-NL2Q12470 SSA3YBL075C 1950 nt13.75□□□□□ -0.21
TY1A-NL2Q12470 NME1NME1 340 nt13.75□□□□□ -0.21
TY1A-NL2Q12470 YJL027CYJL027C 417 nt13.71□□□□□ -0.21
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TY1A-NL2Q12470 PAU22YPL282C 495 nt13.05□□□□□ -0.32
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TY1A-NL2Q12470 ARO7YPR060C 771 nt12.9□□□□□ -0.34
TY1A-NL2Q12470 SRX1YKL086W 384 nt12.85□□□□□ -0.35
TY1A-NL2Q12470 PAM17YKR065C 594 nt12.68□□□□□ -0.38
TY1A-NL2Q12470 Q0297Q0297 156 nt12.67□□□□□ -0.38
TY1A-NL2Q12470 RTC3YHR087W 336 nt12.59□□□□□ -0.39
TY1A-NL2Q12470 REG2YBR050C 1017 nt12.55□□□□□ -0.4
TY1A-NL2Q12470 PUT4YOR348C 1884 nt12.53□□□□□ -0.4
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TY1A-NL2Q12470 VAR1Q0140 1197 nt12.31□□□□□ -0.44
TY1A-NL2Q12470 BMT5YIL096C 1011 nt12.23□□□□□ -0.45
TY1A-NL2Q12470 Q0010Q0010 387 nt12.22□□□□□ -0.45
TY1A-NL2Q12470 SPT5YML010W 3192 nt12.2□□□□□ -0.46
TY1A-NL2Q12470 YCR051WYCR051W 669 nt12.12□□□□□ -0.47
TY1A-NL2Q12470 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.12□□□□□ -0.47
TY1A-NL2Q12470 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.12□□□□□ -0.47
TY1A-NL2Q12470 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.12□□□□□ -0.47
TY1A-NL2Q12470 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.12□□□□□ -0.47
TY1A-NL2Q12470 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.12□□□□□ -0.47
TY1A-NL2Q12470 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.12□□□□□ -0.47
TY1A-NL2Q12470 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.12□□□□□ -0.47
TY1A-NL2Q12470 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.12□□□□□ -0.47
TY1A-NL2Q12470 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.12□□□□□ -0.47
TY1A-NL2Q12470 ARE1YCR048W 1833 nt12.07□□□□□ -0.48
TY1A-NL2Q12470 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt12.05□□□□□ -0.48
TY1A-NL2Q12470 SRN2YLR119W 642 nt12.03□□□□□ -0.48
TY1A-NL2Q12470 ARA2YMR041C 1008 nt12.02□□□□□ -0.49
TY1A-NL2Q12470 POA1YBR022W 534 nt12.02□□□□□ -0.49
TY1A-NL2Q12470 SSA4YER103W 1929 nt12.01□□□□□ -0.49
TY1A-NL2Q12470 Q0144Q0144 330 nt12□□□□□ -0.49
TY1A-NL2Q12470 SEM1YDR363W-A 270 nt11.96□□□□□ -0.49
TY1A-NL2Q12470 CCC1YLR220W 969 nt11.96□□□□□ -0.49
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TY1A-NL2Q12470 SCJ1YMR214W 1134 nt11.86□□□□□ -0.51
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TY1A-NL2Q12470 SCS3YGL126W 1143 nt11.76□□□□□ -0.53
TY1A-NL2Q12470 SAH1YER043C 1350 nt11.75□□□□□ -0.53
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TY1A-NL2Q12470 CLB6YGR109C 1143 nt11.71□□□□□ -0.53
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TY1A-NL2Q12470 ARP10YDR106W 855 nt11.67□□□□□ -0.54
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TY1A-NL2Q12470 PET20YPL159C 762 nt11.43□□□□□ -0.58
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TY1A-NL2Q12470 AI5_BETAQ0075 1065 nt11.35□□□□□ -0.59
TY1A-NL2Q12470 SKG1YKR100C 1068 nt11.34□□□□□ -0.59
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TY1A-NL2Q12470 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.2□□□□□ -0.62
TY1A-NL2Q12470 YNR068CYNR068C 819 nt11.16□□□□□ -0.62
TY1A-NL2Q12470 NAB2YGL122C 1578 nt11.16□□□□□ -0.62
TY1A-NL2Q12470 PUN1YLR414C 792 nt11.15□□□□□ -0.62
TY1A-NL2Q12470 DCW1YKL046C 1350 nt11.14□□□□□ -0.63
TY1A-NL2Q12470 Q0255Q0255 1419 nt11.12□□□□□ -0.63
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TY1A-NL2Q12470 Q0017Q0017 162 nt11.05□□□□□ -0.64
TY1A-NL2Q12470 YBR220CYBR220C 1683 nt11.04□□□□□ -0.64
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