Protein–RNA interactions for Protein: Q12470

TY1A-NL2, Transposon Ty1-NL2 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL2Q12470 NSR1YGR159C 1245 nt16.05■□□□□ 0.16
TY1A-NL2Q12470 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.43■□□□□ 0.06
TY1A-NL2Q12470 MDJ1YFL016C 1536 nt15.07■□□□□ 0
TY1A-NL2Q12470 NOP1YDL014W 984 nt14.68□□□□□ -0.06
TY1A-NL2Q12470 YGR139WYGR139W 339 nt14.67□□□□□ -0.06
TY1A-NL2Q12470 MOT3YMR070W 1473 nt14.55□□□□□ -0.08
TY1A-NL2Q12470 Q0182Q0182 405 nt14.43□□□□□ -0.1
TY1A-NL2Q12470 SSA3YBL075C 1950 nt13.75□□□□□ -0.21
TY1A-NL2Q12470 NME1NME1 340 nt13.75□□□□□ -0.21
TY1A-NL2Q12470 YJL027CYJL027C 417 nt13.71□□□□□ -0.21
TY1A-NL2Q12470 CSM2YIL132C 642 nt13.26□□□□□ -0.29
TY1A-NL2Q12470 YKL036CYKL036C 393 nt13.17□□□□□ -0.3
TY1A-NL2Q12470 DBP2YNL112W 1641 nt13.11□□□□□ -0.31
TY1A-NL2Q12470 PAU21YOR394W 495 nt13.05□□□□□ -0.32
TY1A-NL2Q12470 PAU22YPL282C 495 nt13.05□□□□□ -0.32
TY1A-NL2Q12470 YBR190WYBR190W 312 nt12.99□□□□□ -0.33
TY1A-NL2Q12470 ARO7YPR060C 771 nt12.9□□□□□ -0.34
TY1A-NL2Q12470 SRX1YKL086W 384 nt12.85□□□□□ -0.35
TY1A-NL2Q12470 PAM17YKR065C 594 nt12.68□□□□□ -0.38
TY1A-NL2Q12470 Q0297Q0297 156 nt12.67□□□□□ -0.38
TY1A-NL2Q12470 RTC3YHR087W 336 nt12.59□□□□□ -0.39
TY1A-NL2Q12470 REG2YBR050C 1017 nt12.55□□□□□ -0.4
TY1A-NL2Q12470 PUT4YOR348C 1884 nt12.53□□□□□ -0.4
TY1A-NL2Q12470 YDR509WYDR509W 348 nt12.38□□□□□ -0.43
TY1A-NL2Q12470 BUR6YER159C 429 nt12.31□□□□□ -0.44
TY1A-NL2Q12470 VAR1Q0140 1197 nt12.31□□□□□ -0.44
TY1A-NL2Q12470 BMT5YIL096C 1011 nt12.23□□□□□ -0.45
TY1A-NL2Q12470 Q0010Q0010 387 nt12.22□□□□□ -0.45
TY1A-NL2Q12470 SPT5YML010W 3192 nt12.2□□□□□ -0.46
TY1A-NL2Q12470 YCR051WYCR051W 669 nt12.12□□□□□ -0.47
TY1A-NL2Q12470 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.12□□□□□ -0.47
TY1A-NL2Q12470 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.12□□□□□ -0.47
TY1A-NL2Q12470 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.12□□□□□ -0.47
TY1A-NL2Q12470 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.12□□□□□ -0.47
TY1A-NL2Q12470 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.12□□□□□ -0.47
TY1A-NL2Q12470 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.12□□□□□ -0.47
TY1A-NL2Q12470 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.12□□□□□ -0.47
TY1A-NL2Q12470 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.12□□□□□ -0.47
TY1A-NL2Q12470 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.12□□□□□ -0.47
TY1A-NL2Q12470 ARE1YCR048W 1833 nt12.07□□□□□ -0.48
TY1A-NL2Q12470 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt12.05□□□□□ -0.48
TY1A-NL2Q12470 SRN2YLR119W 642 nt12.03□□□□□ -0.48
TY1A-NL2Q12470 ARA2YMR041C 1008 nt12.02□□□□□ -0.49
TY1A-NL2Q12470 POA1YBR022W 534 nt12.02□□□□□ -0.49
TY1A-NL2Q12470 SSA4YER103W 1929 nt12.01□□□□□ -0.49
TY1A-NL2Q12470 Q0144Q0144 330 nt12□□□□□ -0.49
TY1A-NL2Q12470 SEM1YDR363W-A 270 nt11.96□□□□□ -0.49
TY1A-NL2Q12470 CCC1YLR220W 969 nt11.96□□□□□ -0.49
TY1A-NL2Q12470 BSC6YOL137W 1494 nt11.91□□□□□ -0.5
TY1A-NL2Q12470 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt11.87□□□□□ -0.51
TY1A-NL2Q12470 RVS167YDR388W 1449 nt11.86□□□□□ -0.51
TY1A-NL2Q12470 SCJ1YMR214W 1134 nt11.86□□□□□ -0.51
TY1A-NL2Q12470 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.81□□□□□ -0.52
TY1A-NL2Q12470 YLR122CYLR122C 378 nt11.8□□□□□ -0.52
TY1A-NL2Q12470 SCS3YGL126W 1143 nt11.76□□□□□ -0.53
TY1A-NL2Q12470 SAH1YER043C 1350 nt11.75□□□□□ -0.53
TY1A-NL2Q12470 BDF1YLR399C 2061 nt11.74□□□□□ -0.53
TY1A-NL2Q12470 MET8YBR213W 825 nt11.73□□□□□ -0.53
TY1A-NL2Q12470 CLB6YGR109C 1143 nt11.71□□□□□ -0.53
TY1A-NL2Q12470 ABZ2YMR289W 1125 nt11.69□□□□□ -0.54
TY1A-NL2Q12470 ARP10YDR106W 855 nt11.67□□□□□ -0.54
TY1A-NL2Q12470 URN1YPR152C 1398 nt11.6□□□□□ -0.55
TY1A-NL2Q12470 TOM20YGR082W 552 nt11.58□□□□□ -0.56
TY1A-NL2Q12470 YCR099CYCR099C 468 nt11.57□□□□□ -0.56
TY1A-NL2Q12470 OPI9YLR338W 858 nt11.57□□□□□ -0.56
TY1A-NL2Q12470 TAT1YBR069C 1860 nt11.51□□□□□ -0.57
TY1A-NL2Q12470 AI3Q0060 1248 nt11.49□□□□□ -0.57
TY1A-NL2Q12470 UTP6YDR449C 1323 nt11.46□□□□□ -0.57
TY1A-NL2Q12470 BUD23YCR047C 828 nt11.43□□□□□ -0.58
TY1A-NL2Q12470 PET20YPL159C 762 nt11.43□□□□□ -0.58
TY1A-NL2Q12470 URH1YDR400W 1023 nt11.42□□□□□ -0.58
TY1A-NL2Q12470 LCP5YER127W 1074 nt11.41□□□□□ -0.58
TY1A-NL2Q12470 PAC11YDR488C 1602 nt11.39□□□□□ -0.59
TY1A-NL2Q12470 YOL085CYOL085C 342 nt11.39□□□□□ -0.59
TY1A-NL2Q12470 RPP1BYDL130W 321 nt11.38□□□□□ -0.59
TY1A-NL2Q12470 DEP1YAL013W 1218 nt11.36□□□□□ -0.59
TY1A-NL2Q12470 SHR5YOL110W 714 nt11.36□□□□□ -0.59
TY1A-NL2Q12470 AI5_BETAQ0075 1065 nt11.35□□□□□ -0.59
TY1A-NL2Q12470 SKG1YKR100C 1068 nt11.34□□□□□ -0.59
TY1A-NL2Q12470 HMT1YBR034C 1047 nt11.34□□□□□ -0.59
TY1A-NL2Q12470 Q0142Q0142 177 nt11.32□□□□□ -0.6
TY1A-NL2Q12470 snR78snR78 87 nt11.28□□□□□ -0.6
TY1A-NL2Q12470 MEP2YNL142W 1500 nt11.27□□□□□ -0.61
TY1A-NL2Q12470 PKP1YIL042C 1185 nt11.26□□□□□ -0.61
TY1A-NL2Q12470 PTC2YER089C 1395 nt11.24□□□□□ -0.61
TY1A-NL2Q12470 NVJ2YPR091C 2313 nt11.23□□□□□ -0.61
TY1A-NL2Q12470 YPL071CYPL071C 471 nt11.22□□□□□ -0.61
TY1A-NL2Q12470 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.2□□□□□ -0.62
TY1A-NL2Q12470 YNR068CYNR068C 819 nt11.16□□□□□ -0.62
TY1A-NL2Q12470 NAB2YGL122C 1578 nt11.16□□□□□ -0.62
TY1A-NL2Q12470 PUN1YLR414C 792 nt11.15□□□□□ -0.62
TY1A-NL2Q12470 DCW1YKL046C 1350 nt11.14□□□□□ -0.63
TY1A-NL2Q12470 Q0255Q0255 1419 nt11.12□□□□□ -0.63
TY1A-NL2Q12470 YHM2YMR241W 945 nt11.1□□□□□ -0.63
TY1A-NL2Q12470 YPL168WYPL168W 1293 nt11.1□□□□□ -0.63
TY1A-NL2Q12470 YJL118WYJL118W 660 nt11.09□□□□□ -0.63
TY1A-NL2Q12470 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt11.08□□□□□ -0.64
TY1A-NL2Q12470 RPN10YHR200W 807 nt11.05□□□□□ -0.64
TY1A-NL2Q12470 Q0017Q0017 162 nt11.05□□□□□ -0.64
TY1A-NL2Q12470 YBR220CYBR220C 1683 nt11.04□□□□□ -0.64
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