Protein–RNA interactions for Protein: P47152

YJR115W, Uncharacterized protein YJR115W, yeastyeast

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJR115WP47152 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.87■□□□□ 0.61
YJR115WP47152 NSR1YGR159C 1245 nt18.72■□□□□ 0.59
YJR115WP47152 NOP1YDL014W 984 nt18.42■□□□□ 0.54
YJR115WP47152 YKL036CYKL036C 393 nt17.12■□□□□ 0.33
YJR115WP47152 MDJ1YFL016C 1536 nt16.45■□□□□ 0.22
YJR115WP47152 Q0297Q0297 156 nt16.21■□□□□ 0.19
YJR115WP47152 SRX1YKL086W 384 nt16.13■□□□□ 0.17
YJR115WP47152 YJL027CYJL027C 417 nt15.96■□□□□ 0.15
YJR115WP47152 SCS3YGL126W 1143 nt15.64■□□□□ 0.09
YJR115WP47152 YCR051WYCR051W 669 nt15.23■□□□□ 0.03
YJR115WP47152 YOL085CYOL085C 342 nt14.82□□□□□ -0.04
YJR115WP47152 DBP2YNL112W 1641 nt14.67□□□□□ -0.06
YJR115WP47152 Q0182Q0182 405 nt14.56□□□□□ -0.08
YJR115WP47152 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.53□□□□□ -0.08
YJR115WP47152 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.53□□□□□ -0.08
YJR115WP47152 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.53□□□□□ -0.08
YJR115WP47152 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.53□□□□□ -0.08
YJR115WP47152 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.53□□□□□ -0.08
YJR115WP47152 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.53□□□□□ -0.08
YJR115WP47152 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.53□□□□□ -0.08
YJR115WP47152 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.53□□□□□ -0.08
YJR115WP47152 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.53□□□□□ -0.08
YJR115WP47152 RPP1BYDL130W 321 nt14.52□□□□□ -0.09
YJR115WP47152 PKP1YIL042C 1185 nt14.52□□□□□ -0.09
YJR115WP47152 CCC1YLR220W 969 nt14.27□□□□□ -0.13
YJR115WP47152 MOT3YMR070W 1473 nt14.16□□□□□ -0.14
YJR115WP47152 SCJ1YMR214W 1134 nt14.06□□□□□ -0.16
YJR115WP47152 YBR190WYBR190W 312 nt14.05□□□□□ -0.16
YJR115WP47152 ATS1YAL020C 1002 nt14.01□□□□□ -0.17
YJR115WP47152 PET122YER153C 765 nt13.84□□□□□ -0.19
YJR115WP47152 RVS167YDR388W 1449 nt13.77□□□□□ -0.21
YJR115WP47152 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.75□□□□□ -0.21
YJR115WP47152 SCR1SCR1 522 nt13.72□□□□□ -0.21
YJR115WP47152 RTC3YHR087W 336 nt13.65□□□□□ -0.22
YJR115WP47152 YGR139WYGR139W 339 nt13.54□□□□□ -0.24
YJR115WP47152 RRN5YLR141W 1092 nt13.44□□□□□ -0.26
YJR115WP47152 SHR5YOL110W 714 nt13.36□□□□□ -0.27
YJR115WP47152 YDJ1YNL064C 1230 nt13.34□□□□□ -0.27
YJR115WP47152 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.19□□□□□ -0.3
YJR115WP47152 RSB1YOR049C 1065 nt13.17□□□□□ -0.3
YJR115WP47152 PST2YDR032C 597 nt12.99□□□□□ -0.33
YJR115WP47152 GAR1YHR089C 618 nt12.94□□□□□ -0.34
YJR115WP47152 URN1YPR152C 1398 nt12.87□□□□□ -0.35
YJR115WP47152 DEP1YAL013W 1218 nt12.85□□□□□ -0.35
YJR115WP47152 RPN10YHR200W 807 nt12.73□□□□□ -0.37
YJR115WP47152 YNL208WYNL208W 600 nt12.73□□□□□ -0.37
YJR115WP47152 OPI9YLR338W 858 nt12.71□□□□□ -0.37
YJR115WP47152 PUT4YOR348C 1884 nt12.68□□□□□ -0.38
YJR115WP47152 SAH1YER043C 1350 nt12.55□□□□□ -0.4
YJR115WP47152 TIR1YER011W 765 nt12.54□□□□□ -0.4
YJR115WP47152 YKL097CYKL097C 411 nt12.49□□□□□ -0.41
YJR115WP47152 NME1NME1 340 nt12.49□□□□□ -0.41
YJR115WP47152 ARE1YCR048W 1833 nt12.48□□□□□ -0.41
YJR115WP47152 SHU1YHL006C 453 nt12.41□□□□□ -0.42
YJR115WP47152 SSA1YAL005C 1929 nt12.37□□□□□ -0.43
YJR115WP47152 PUN1YLR414C 792 nt12.33□□□□□ -0.44
YJR115WP47152 YJR018WYJR018W 363 nt12.29□□□□□ -0.44
YJR115WP47152 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.28□□□□□ -0.44
YJR115WP47152 POA1YBR022W 534 nt12.23□□□□□ -0.45
YJR115WP47152 SRB2YHR041C 633 nt12.19□□□□□ -0.46
YJR115WP47152 YJR120WYJR120W 351 nt12.19□□□□□ -0.46
YJR115WP47152 CSM2YIL132C 642 nt12.15□□□□□ -0.46
YJR115WP47152 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.12□□□□□ -0.47
YJR115WP47152 PTC2YER089C 1395 nt12.11□□□□□ -0.47
YJR115WP47152 RPP2BYDR382W 333 nt12.07□□□□□ -0.48
YJR115WP47152 YOR139CYOR139C 393 nt12.01□□□□□ -0.49
YJR115WP47152 YGR021WYGR021W 873 nt12□□□□□ -0.49
YJR115WP47152 WWM1YFL010C 636 nt11.99□□□□□ -0.49
YJR115WP47152 PAU21YOR394W 495 nt11.98□□□□□ -0.49
YJR115WP47152 PAU22YPL282C 495 nt11.98□□□□□ -0.49
YJR115WP47152 NAB2YGL122C 1578 nt11.97□□□□□ -0.49
YJR115WP47152 BSC6YOL137W 1494 nt11.97□□□□□ -0.49
YJR115WP47152 HOM6YJR139C 1080 nt11.97□□□□□ -0.49
YJR115WP47152 BUD23YCR047C 828 nt11.96□□□□□ -0.49
YJR115WP47152 SSA3YBL075C 1950 nt11.94□□□□□ -0.5
YJR115WP47152 BDH2YAL061W 1254 nt11.89□□□□□ -0.51
YJR115WP47152 MNP1YGL068W 585 nt11.88□□□□□ -0.51
YJR115WP47152 INM2YDR287W 879 nt11.86□□□□□ -0.51
YJR115WP47152 FIS1YIL065C 468 nt11.86□□□□□ -0.51
YJR115WP47152 ARO7YPR060C 771 nt11.86□□□□□ -0.51
YJR115WP47152 VAR1Q0140 1197 nt11.85□□□□□ -0.51
YJR115WP47152 DAL1YIR027C 1383 nt11.84□□□□□ -0.51
YJR115WP47152 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.84□□□□□ -0.51
YJR115WP47152 NPL3YDR432W 1245 nt11.83□□□□□ -0.52
YJR115WP47152 YOL037CYOL037C 354 nt11.79□□□□□ -0.52
YJR115WP47152 PAM17YKR065C 594 nt11.78□□□□□ -0.52
YJR115WP47152 RKM5YLR137W 1104 nt11.78□□□□□ -0.52
YJR115WP47152 LSM3YLR438C-A 270 nt11.78□□□□□ -0.52
YJR115WP47152 YBL100CYBL100C 315 nt11.75□□□□□ -0.53
YJR115WP47152 PHO4YFR034C 939 nt11.73□□□□□ -0.53
YJR115WP47152 FPR4YLR449W 1179 nt11.72□□□□□ -0.53
YJR115WP47152 YDR509WYDR509W 348 nt11.65□□□□□ -0.54
YJR115WP47152 FUN26YAL022C 1554 nt11.62□□□□□ -0.55
YJR115WP47152 TRM9YML014W 840 nt11.6□□□□□ -0.55
YJR115WP47152 REG2YBR050C 1017 nt11.6□□□□□ -0.55
YJR115WP47152 CCT6YDR188W 1641 nt11.53□□□□□ -0.56
YJR115WP47152 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.52□□□□□ -0.57
YJR115WP47152 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.52□□□□□ -0.57
YJR115WP47152 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.52□□□□□ -0.57
YJR115WP47152 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.6 ms