Protein–RNA interactions for Protein: Q06593

OPT2, Oligopeptide transporter 2, yeastyeast

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
OPT2Q06593 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.9■□□□□ 0.78
OPT2Q06593 NOP1YDL014W 984 nt19.61■□□□□ 0.73
OPT2Q06593 NSR1YGR159C 1245 nt19.36■□□□□ 0.69
OPT2Q06593 YKL036CYKL036C 393 nt18.56■□□□□ 0.56
OPT2Q06593 YJL027CYJL027C 417 nt17.41■□□□□ 0.38
OPT2Q06593 Q0297Q0297 156 nt17.31■□□□□ 0.36
OPT2Q06593 SRX1YKL086W 384 nt17.12■□□□□ 0.33
OPT2Q06593 SCS3YGL126W 1143 nt17.11■□□□□ 0.33
OPT2Q06593 MDJ1YFL016C 1536 nt16.63■□□□□ 0.25
OPT2Q06593 YCR051WYCR051W 669 nt16.26■□□□□ 0.19
OPT2Q06593 YOL085CYOL085C 342 nt16.03■□□□□ 0.16
OPT2Q06593 SCJ1YMR214W 1134 nt15.88■□□□□ 0.13
OPT2Q06593 PKP1YIL042C 1185 nt15.69■□□□□ 0.1
OPT2Q06593 RPP1BYDL130W 321 nt15.53■□□□□ 0.08
OPT2Q06593 ATS1YAL020C 1002 nt15.47■□□□□ 0.07
OPT2Q06593 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.15■□□□□ 0.02
OPT2Q06593 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.15■□□□□ 0.02
OPT2Q06593 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.15■□□□□ 0.02
OPT2Q06593 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.15■□□□□ 0.02
OPT2Q06593 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.15■□□□□ 0.02
OPT2Q06593 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.15■□□□□ 0.02
OPT2Q06593 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.15■□□□□ 0.02
OPT2Q06593 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.15■□□□□ 0.02
OPT2Q06593 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.15■□□□□ 0.02
OPT2Q06593 CCC1YLR220W 969 nt14.98□□□□□ -0.01
OPT2Q06593 DBP2YNL112W 1641 nt14.92□□□□□ -0.02
OPT2Q06593 SCR1SCR1 522 nt14.79□□□□□ -0.04
OPT2Q06593 PET122YER153C 765 nt14.74□□□□□ -0.05
OPT2Q06593 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.51□□□□□ -0.09
OPT2Q06593 RTC3YHR087W 336 nt14.39□□□□□ -0.11
OPT2Q06593 RRN5YLR141W 1092 nt14.39□□□□□ -0.11
OPT2Q06593 YBR190WYBR190W 312 nt14.27□□□□□ -0.13
OPT2Q06593 RSB1YOR049C 1065 nt14.26□□□□□ -0.13
OPT2Q06593 RVS167YDR388W 1449 nt14.24□□□□□ -0.13
OPT2Q06593 PST2YDR032C 597 nt14.23□□□□□ -0.13
OPT2Q06593 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.1□□□□□ -0.15
OPT2Q06593 YDJ1YNL064C 1230 nt14.06□□□□□ -0.16
OPT2Q06593 YKL097CYKL097C 411 nt13.96□□□□□ -0.17
OPT2Q06593 SHR5YOL110W 714 nt13.84□□□□□ -0.19
OPT2Q06593 SSA3YBL075C 1950 nt13.8□□□□□ -0.2
OPT2Q06593 GAR1YHR089C 618 nt13.62□□□□□ -0.23
OPT2Q06593 SHU1YHL006C 453 nt13.51□□□□□ -0.25
OPT2Q06593 PUT4YOR348C 1884 nt13.31□□□□□ -0.28
OPT2Q06593 YOR139CYOR139C 393 nt13.26□□□□□ -0.29
OPT2Q06593 YGR139WYGR139W 339 nt13.25□□□□□ -0.29
OPT2Q06593 DEP1YAL013W 1218 nt13.22□□□□□ -0.29
OPT2Q06593 TIR1YER011W 765 nt13.15□□□□□ -0.3
OPT2Q06593 YNL208WYNL208W 600 nt13.13□□□□□ -0.31
OPT2Q06593 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.12□□□□□ -0.31
OPT2Q06593 URN1YPR152C 1398 nt13.11□□□□□ -0.31
OPT2Q06593 RPN10YHR200W 807 nt13.1□□□□□ -0.31
OPT2Q06593 NPL3YDR432W 1245 nt13.09□□□□□ -0.31
OPT2Q06593 ARE1YCR048W 1833 nt12.9□□□□□ -0.34
OPT2Q06593 POA1YBR022W 534 nt12.85□□□□□ -0.35
OPT2Q06593 SSA1YAL005C 1929 nt12.85□□□□□ -0.35
OPT2Q06593 OPI9YLR338W 858 nt12.83□□□□□ -0.36
OPT2Q06593 YGR021WYGR021W 873 nt12.79□□□□□ -0.36
OPT2Q06593 YOL037CYOL037C 354 nt12.78□□□□□ -0.36
OPT2Q06593 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.76□□□□□ -0.37
OPT2Q06593 SAH1YER043C 1350 nt12.75□□□□□ -0.37
OPT2Q06593 HOM6YJR139C 1080 nt12.73□□□□□ -0.37
OPT2Q06593 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.72□□□□□ -0.37
OPT2Q06593 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.72□□□□□ -0.37
OPT2Q06593 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.72□□□□□ -0.37
OPT2Q06593 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.72□□□□□ -0.37
OPT2Q06593 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.72□□□□□ -0.37
OPT2Q06593 MNP1YGL068W 585 nt12.71□□□□□ -0.37
OPT2Q06593 BSC6YOL137W 1494 nt12.69□□□□□ -0.38
OPT2Q06593 SRB2YHR041C 633 nt12.68□□□□□ -0.38
OPT2Q06593 WWM1YFL010C 636 nt12.64□□□□□ -0.39
OPT2Q06593 YJR018WYJR018W 363 nt12.56□□□□□ -0.4
OPT2Q06593 RKM5YLR137W 1104 nt12.54□□□□□ -0.4
OPT2Q06593 MOT3YMR070W 1473 nt12.53□□□□□ -0.4
OPT2Q06593 Q0182Q0182 405 nt12.53□□□□□ -0.4
OPT2Q06593 PUN1YLR414C 792 nt12.49□□□□□ -0.41
OPT2Q06593 RPP2BYDR382W 333 nt12.48□□□□□ -0.41
OPT2Q06593 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.48□□□□□ -0.41
OPT2Q06593 SPT5YML010W 3192 nt12.46□□□□□ -0.41
OPT2Q06593 PUS2YGL063W 1113 nt12.45□□□□□ -0.42
OPT2Q06593 BUD23YCR047C 828 nt12.43□□□□□ -0.42
OPT2Q06593 YJR120WYJR120W 351 nt12.41□□□□□ -0.42
OPT2Q06593 YLR281CYLR281C 468 nt12.4□□□□□ -0.42
OPT2Q06593 SSA4YER103W 1929 nt12.34□□□□□ -0.43
OPT2Q06593 PTC2YER089C 1395 nt12.3□□□□□ -0.44
OPT2Q06593 BDH2YAL061W 1254 nt12.29□□□□□ -0.44
OPT2Q06593 WHI5YOR083W 888 nt12.29□□□□□ -0.44
OPT2Q06593 NAB2YGL122C 1578 nt12.26□□□□□ -0.45
OPT2Q06593 LSM3YLR438C-A 270 nt12.25□□□□□ -0.45
OPT2Q06593 MRPL8YJL063C 717 nt12.2□□□□□ -0.46
OPT2Q06593 NME1NME1 340 nt12.2□□□□□ -0.46
OPT2Q06593 FMP45YDL222C 930 nt12.13□□□□□ -0.47
OPT2Q06593 DSK2YMR276W 1122 nt12.1□□□□□ -0.47
OPT2Q06593 IMP2'YIL154C 1041 nt12.09□□□□□ -0.47
OPT2Q06593 INM2YDR287W 879 nt12.07□□□□□ -0.48
OPT2Q06593 YCH1YGR203W 447 nt12.07□□□□□ -0.48
OPT2Q06593 YPR011CYPR011C 981 nt12.03□□□□□ -0.48
OPT2Q06593 ADO1YJR105W 1023 nt12□□□□□ -0.49
OPT2Q06593 FPR4YLR449W 1179 nt12□□□□□ -0.49
OPT2Q06593 YBL100CYBL100C 315 nt12□□□□□ -0.49
OPT2Q06593 DAL1YIR027C 1383 nt12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12 ms