Protein–RNA interactions for Protein: Q06147

LCB5, Sphingoid long chain base kinase 5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB5Q06147 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.75■□□□□ 0.91
LCB5Q06147 NSR1YGR159C 1245 nt20.4■□□□□ 0.86
LCB5Q06147 NOP1YDL014W 984 nt20.3■□□□□ 0.84
LCB5Q06147 YKL036CYKL036C 393 nt18.93■□□□□ 0.62
LCB5Q06147 MDJ1YFL016C 1536 nt17.94■□□□□ 0.46
LCB5Q06147 Q0297Q0297 156 nt17.8■□□□□ 0.44
LCB5Q06147 YJL027CYJL027C 417 nt17.72■□□□□ 0.43
LCB5Q06147 SRX1YKL086W 384 nt17.71■□□□□ 0.43
LCB5Q06147 SCS3YGL126W 1143 nt17.33■□□□□ 0.36
LCB5Q06147 YCR051WYCR051W 669 nt16.83■□□□□ 0.28
LCB5Q06147 YOL085CYOL085C 342 nt16.36■□□□□ 0.21
LCB5Q06147 PKP1YIL042C 1185 nt16.08■□□□□ 0.16
LCB5Q06147 RPP1BYDL130W 321 nt15.99■□□□□ 0.15
LCB5Q06147 SSA3YBL075C 1950 nt15.96■□□□□ 0.15
LCB5Q06147 DBP2YNL112W 1641 nt15.88■□□□□ 0.13
LCB5Q06147 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.86■□□□□ 0.13
LCB5Q06147 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.86■□□□□ 0.13
LCB5Q06147 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.86■□□□□ 0.13
LCB5Q06147 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.86■□□□□ 0.13
LCB5Q06147 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.86■□□□□ 0.13
LCB5Q06147 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.86■□□□□ 0.13
LCB5Q06147 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.86■□□□□ 0.13
LCB5Q06147 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.86■□□□□ 0.13
LCB5Q06147 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.86■□□□□ 0.13
LCB5Q06147 CCC1YLR220W 969 nt15.7■□□□□ 0.1
LCB5Q06147 SCJ1YMR214W 1134 nt15.68■□□□□ 0.1
LCB5Q06147 ATS1YAL020C 1002 nt15.56■□□□□ 0.08
LCB5Q06147 YBR190WYBR190W 312 nt15.46■□□□□ 0.07
LCB5Q06147 PET122YER153C 765 nt15.23■□□□□ 0.03
LCB5Q06147 SCR1SCR1 522 nt15.18■□□□□ 0.02
LCB5Q06147 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.09■□□□□ 0.01
LCB5Q06147 RVS167YDR388W 1449 nt15.08■□□□□ 0
LCB5Q06147 RTC3YHR087W 336 nt15.03■□□□□ -0
LCB5Q06147 RRN5YLR141W 1092 nt14.8□□□□□ -0.04
LCB5Q06147 PUT4YOR348C 1884 nt14.72□□□□□ -0.05
LCB5Q06147 RSB1YOR049C 1065 nt14.61□□□□□ -0.07
LCB5Q06147 YDJ1YNL064C 1230 nt14.6□□□□□ -0.07
LCB5Q06147 SHR5YOL110W 714 nt14.58□□□□□ -0.08
LCB5Q06147 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.52□□□□□ -0.09
LCB5Q06147 PST2YDR032C 597 nt14.35□□□□□ -0.11
LCB5Q06147 GAR1YHR089C 618 nt14.22□□□□□ -0.13
LCB5Q06147 ARE1YCR048W 1833 nt14.18□□□□□ -0.14
LCB5Q06147 POA1YBR022W 534 nt14.17□□□□□ -0.14
LCB5Q06147 SPT5YML010W 3192 nt14.13□□□□□ -0.15
LCB5Q06147 DEP1YAL013W 1218 nt14.08□□□□□ -0.16
LCB5Q06147 BSC6YOL137W 1494 nt14.02□□□□□ -0.16
LCB5Q06147 SSA4YER103W 1929 nt14.02□□□□□ -0.17
LCB5Q06147 URN1YPR152C 1398 nt14.01□□□□□ -0.17
LCB5Q06147 Q0182Q0182 405 nt14□□□□□ -0.17
LCB5Q06147 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.96□□□□□ -0.17
LCB5Q06147 YKL097CYKL097C 411 nt13.95□□□□□ -0.18
LCB5Q06147 RPN10YHR200W 807 nt13.92□□□□□ -0.18
LCB5Q06147 YNL208WYNL208W 600 nt13.89□□□□□ -0.19
LCB5Q06147 SAH1YER043C 1350 nt13.88□□□□□ -0.19
LCB5Q06147 OPI9YLR338W 858 nt13.76□□□□□ -0.21
LCB5Q06147 TIR1YER011W 765 nt13.74□□□□□ -0.21
LCB5Q06147 SHU1YHL006C 453 nt13.71□□□□□ -0.21
LCB5Q06147 BDF1YLR399C 2061 nt13.6□□□□□ -0.23
LCB5Q06147 BUD23YCR047C 828 nt13.56□□□□□ -0.24
LCB5Q06147 SSA1YAL005C 1929 nt13.5□□□□□ -0.25
LCB5Q06147 MOT3YMR070W 1473 nt13.45□□□□□ -0.26
LCB5Q06147 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.41□□□□□ -0.26
LCB5Q06147 YJR018WYJR018W 363 nt13.39□□□□□ -0.27
LCB5Q06147 PUN1YLR414C 792 nt13.39□□□□□ -0.27
LCB5Q06147 TAT1YBR069C 1860 nt13.38□□□□□ -0.27
LCB5Q06147 PTC2YER089C 1395 nt13.32□□□□□ -0.28
LCB5Q06147 NAB2YGL122C 1578 nt13.29□□□□□ -0.28
LCB5Q06147 YGR139WYGR139W 339 nt13.29□□□□□ -0.28
LCB5Q06147 YOR139CYOR139C 393 nt13.29□□□□□ -0.28
LCB5Q06147 MEP2YNL142W 1500 nt13.29□□□□□ -0.28
LCB5Q06147 SRB2YHR041C 633 nt13.27□□□□□ -0.29
LCB5Q06147 PAC11YDR488C 1602 nt13.25□□□□□ -0.29
LCB5Q06147 RPP2BYDR382W 333 nt13.22□□□□□ -0.29
LCB5Q06147 NPL3YDR432W 1245 nt13.2□□□□□ -0.3
LCB5Q06147 YGR021WYGR021W 873 nt13.2□□□□□ -0.3
LCB5Q06147 YJR120WYJR120W 351 nt13.18□□□□□ -0.3
LCB5Q06147 WWM1YFL010C 636 nt13.15□□□□□ -0.3
LCB5Q06147 HOM6YJR139C 1080 nt13.13□□□□□ -0.31
LCB5Q06147 MNP1YGL068W 585 nt13.1□□□□□ -0.31
LCB5Q06147 YOL037CYOL037C 354 nt13.03□□□□□ -0.32
LCB5Q06147 DCW1YKL046C 1350 nt13.03□□□□□ -0.32
LCB5Q06147 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.98□□□□□ -0.33
LCB5Q06147 FIS1YIL065C 468 nt12.98□□□□□ -0.33
LCB5Q06147 BDH2YAL061W 1254 nt12.97□□□□□ -0.33
LCB5Q06147 RKM5YLR137W 1104 nt12.95□□□□□ -0.34
LCB5Q06147 DAL1YIR027C 1383 nt12.94□□□□□ -0.34
LCB5Q06147 NVJ2YPR091C 2313 nt12.93□□□□□ -0.34
LCB5Q06147 YBR220CYBR220C 1683 nt12.93□□□□□ -0.34
LCB5Q06147 FPR4YLR449W 1179 nt12.9□□□□□ -0.34
LCB5Q06147 YPS1YLR120C 1710 nt12.9□□□□□ -0.34
LCB5Q06147 INM2YDR287W 879 nt12.89□□□□□ -0.35
LCB5Q06147 LSM3YLR438C-A 270 nt12.85□□□□□ -0.35
LCB5Q06147 EMI2YDR516C 1503 nt12.83□□□□□ -0.35
LCB5Q06147 YMR090WYMR090W 684 nt12.83□□□□□ -0.36
LCB5Q06147 YBL100CYBL100C 315 nt12.81□□□□□ -0.36
LCB5Q06147 PHO4YFR034C 939 nt12.8□□□□□ -0.36
LCB5Q06147 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.78□□□□□ -0.36
LCB5Q06147 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.77□□□□□ -0.37
LCB5Q06147 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.77□□□□□ -0.37
LCB5Q06147 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.77□□□□□ -0.37
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