Protein–RNA interactions for Protein: Q04336

YMR196W, Uncharacterized protein YMR196W, yeastyeast

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Length 1,088 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR196WQ04336 YML009W-BYML009W-B 477 nt28.67■■■□□ 2.18
YMR196WQ04336 NOP1YDL014W 984 nt28.23■■■□□ 2.11
YMR196WQ04336 NSR1YGR159C 1245 nt27.65■■■□□ 2.02
YMR196WQ04336 YKL036CYKL036C 393 nt26.86■■□□□ 1.89
YMR196WQ04336 YJL027CYJL027C 417 nt25.29■■□□□ 1.64
YMR196WQ04336 Q0297Q0297 156 nt24.92■■□□□ 1.58
YMR196WQ04336 SCS3YGL126W 1143 nt24.86■■□□□ 1.57
YMR196WQ04336 SRX1YKL086W 384 nt24.61■■□□□ 1.53
YMR196WQ04336 MDJ1YFL016C 1536 nt23.72■■□□□ 1.39
YMR196WQ04336 YCR051WYCR051W 669 nt23.53■■□□□ 1.36
YMR196WQ04336 YOL085CYOL085C 342 nt23.21■■□□□ 1.31
YMR196WQ04336 SCJ1YMR214W 1134 nt23.12■■□□□ 1.29
YMR196WQ04336 PKP1YIL042C 1185 nt22.82■■□□□ 1.24
YMR196WQ04336 ATS1YAL020C 1002 nt22.51■■□□□ 1.19
YMR196WQ04336 RPP1BYDL130W 321 nt22.4■■□□□ 1.18
YMR196WQ04336 TRN1tP(UGG)A 72 nt21.69■■□□□ 1.06
YMR196WQ04336 SUF9tP(UGG)F 72 nt21.69■■□□□ 1.06
YMR196WQ04336 SUF8tP(UGG)H 72 nt21.69■■□□□ 1.06
YMR196WQ04336 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt21.69■■□□□ 1.06
YMR196WQ04336 SUF7tP(UGG)M 72 nt21.69■■□□□ 1.06
YMR196WQ04336 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt21.69■■□□□ 1.06
YMR196WQ04336 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt21.69■■□□□ 1.06
YMR196WQ04336 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt21.69■■□□□ 1.06
YMR196WQ04336 SUF11tP(UGG)O2 72 nt21.69■■□□□ 1.06
YMR196WQ04336 CCC1YLR220W 969 nt21.64■■□□□ 1.05
YMR196WQ04336 SCR1SCR1 522 nt21.39■■□□□ 1.01
YMR196WQ04336 PET122YER153C 765 nt21.29■■□□□ 1
YMR196WQ04336 DBP2YNL112W 1641 nt21.26■□□□□ 0.99
YMR196WQ04336 RTC3YHR087W 336 nt21.11■□□□□ 0.97
YMR196WQ04336 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt20.87■□□□□ 0.93
YMR196WQ04336 RRN5YLR141W 1092 nt20.81■□□□□ 0.92
YMR196WQ04336 RSB1YOR049C 1065 nt20.7■□□□□ 0.9
YMR196WQ04336 PST2YDR032C 597 nt20.66■□□□□ 0.9
YMR196WQ04336 YKL097CYKL097C 411 nt20.39■□□□□ 0.85
YMR196WQ04336 YER088W-BYER088W-B 147 nt20.37■□□□□ 0.85
YMR196WQ04336 RVS167YDR388W 1449 nt20.35■□□□□ 0.85
YMR196WQ04336 YDJ1YNL064C 1230 nt20.14■□□□□ 0.81
YMR196WQ04336 YBR190WYBR190W 312 nt19.97■□□□□ 0.79
YMR196WQ04336 SHR5YOL110W 714 nt19.78■□□□□ 0.76
YMR196WQ04336 GAR1YHR089C 618 nt19.65■□□□□ 0.74
YMR196WQ04336 SHU1YHL006C 453 nt19.62■□□□□ 0.73
YMR196WQ04336 YOR139CYOR139C 393 nt19.32■□□□□ 0.68
YMR196WQ04336 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt19.12■□□□□ 0.65
YMR196WQ04336 NPL3YDR432W 1245 nt19.08■□□□□ 0.64
YMR196WQ04336 DEP1YAL013W 1218 nt19.01■□□□□ 0.63
YMR196WQ04336 TIR1YER011W 765 nt18.9■□□□□ 0.62
YMR196WQ04336 YNL208WYNL208W 600 nt18.75■□□□□ 0.59
YMR196WQ04336 URN1YPR152C 1398 nt18.7■□□□□ 0.58
YMR196WQ04336 RPN10YHR200W 807 nt18.67■□□□□ 0.58
YMR196WQ04336 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt18.52■□□□□ 0.56
YMR196WQ04336 IMT4tM(CAU)E 72 nt18.52■□□□□ 0.56
YMR196WQ04336 IMT3tM(CAU)J3 72 nt18.52■□□□□ 0.56
YMR196WQ04336 IMT1tM(CAU)O1 72 nt18.52■□□□□ 0.56
YMR196WQ04336 IMT2tM(CAU)P 72 nt18.52■□□□□ 0.56
YMR196WQ04336 SSA1YAL005C 1929 nt18.45■□□□□ 0.54
YMR196WQ04336 YOL037CYOL037C 354 nt18.43■□□□□ 0.54
YMR196WQ04336 MNP1YGL068W 585 nt18.4■□□□□ 0.54
YMR196WQ04336 YGR021WYGR021W 873 nt18.39■□□□□ 0.53
YMR196WQ04336 HOM6YJR139C 1080 nt18.32■□□□□ 0.52
YMR196WQ04336 BSC6YOL137W 1494 nt18.3■□□□□ 0.52
YMR196WQ04336 SRB2YHR041C 633 nt18.25■□□□□ 0.51
YMR196WQ04336 WWM1YFL010C 636 nt18.23■□□□□ 0.51
YMR196WQ04336 OPI9YLR338W 858 nt18.2■□□□□ 0.5
YMR196WQ04336 MOT3YMR070W 1473 nt18.18■□□□□ 0.5
YMR196WQ04336 PUS2YGL063W 1113 nt18.14■□□□□ 0.49
YMR196WQ04336 RKM5YLR137W 1104 nt18.08■□□□□ 0.48
YMR196WQ04336 YLR281CYLR281C 468 nt17.94■□□□□ 0.46
YMR196WQ04336 YJR018WYJR018W 363 nt17.9■□□□□ 0.46
YMR196WQ04336 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt17.89■□□□□ 0.45
YMR196WQ04336 SAH1YER043C 1350 nt17.88■□□□□ 0.45
YMR196WQ04336 RPP2BYDR382W 333 nt17.84■□□□□ 0.45
YMR196WQ04336 WHI5YOR083W 888 nt17.79■□□□□ 0.44
YMR196WQ04336 MRPL8YJL063C 717 nt17.76■□□□□ 0.43
YMR196WQ04336 PUN1YLR414C 792 nt17.71■□□□□ 0.43
YMR196WQ04336 FMP45YDL222C 930 nt17.67■□□□□ 0.42
YMR196WQ04336 YJR120WYJR120W 351 nt17.67■□□□□ 0.42
YMR196WQ04336 BDH2YAL061W 1254 nt17.56■□□□□ 0.4
YMR196WQ04336 YCH1YGR203W 447 nt17.54■□□□□ 0.4
YMR196WQ04336 UBX6YJL048C 1191 nt17.52■□□□□ 0.4
YMR196WQ04336 LSM3YLR438C-A 270 nt17.5■□□□□ 0.39
YMR196WQ04336 DSK2YMR276W 1122 nt17.5■□□□□ 0.39
YMR196WQ04336 ADO1YJR105W 1023 nt17.49■□□□□ 0.39
YMR196WQ04336 YPR011CYPR011C 981 nt17.47■□□□□ 0.39
YMR196WQ04336 SSA3YBL075C 1950 nt17.44■□□□□ 0.38
YMR196WQ04336 IMP2'YIL154C 1041 nt17.38■□□□□ 0.37
YMR196WQ04336 PUT4YOR348C 1884 nt17.37■□□□□ 0.37
YMR196WQ04336 YLR236CYLR236C 324 nt17.36■□□□□ 0.37
YMR196WQ04336 PTC2YER089C 1395 nt17.36■□□□□ 0.37
YMR196WQ04336 ARE1YCR048W 1833 nt17.35■□□□□ 0.37
YMR196WQ04336 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt17.31■□□□□ 0.36
YMR196WQ04336 YEL076CYEL076C 651 nt17.31■□□□□ 0.36
YMR196WQ04336 YLR464WYLR464W 651 nt17.31■□□□□ 0.36
YMR196WQ04336 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt17.19■□□□□ 0.34
YMR196WQ04336 INM2YDR287W 879 nt17.15■□□□□ 0.34
YMR196WQ04336 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt17.15■□□□□ 0.34
YMR196WQ04336 TRM9YML014W 840 nt17.15■□□□□ 0.34
YMR196WQ04336 YBL100CYBL100C 315 nt17.13■□□□□ 0.33
YMR196WQ04336 SIS1YNL007C 1059 nt17.09■□□□□ 0.33
YMR196WQ04336 SPP1YPL138C 1062 nt17.09■□□□□ 0.33
YMR196WQ04336 RTG1YOL067C 534 nt17.06■□□□□ 0.32
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