Protein–RNA interactions for Protein: P26370

UGA3, Transcriptional activator protein UGA3, yeastyeast

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UGA3P26370 YML009W-BYML009W-B 477 nt26.01■■□□□ 1.75
UGA3P26370 NSR1YGR159C 1245 nt25.56■■□□□ 1.68
UGA3P26370 NOP1YDL014W 984 nt25.35■■□□□ 1.65
UGA3P26370 YKL036CYKL036C 393 nt23.62■■□□□ 1.37
UGA3P26370 MDJ1YFL016C 1536 nt22.52■■□□□ 1.2
UGA3P26370 Q0297Q0297 156 nt22.22■■□□□ 1.15
UGA3P26370 YJL027CYJL027C 417 nt22.13■■□□□ 1.13
UGA3P26370 SRX1YKL086W 384 nt22.13■■□□□ 1.13
UGA3P26370 SCS3YGL126W 1143 nt21.62■■□□□ 1.05
UGA3P26370 YCR051WYCR051W 669 nt21.09■□□□□ 0.97
UGA3P26370 YOL085CYOL085C 342 nt20.44■□□□□ 0.86
UGA3P26370 PKP1YIL042C 1185 nt20.16■□□□□ 0.82
UGA3P26370 RPP1BYDL130W 321 nt19.97■□□□□ 0.79
UGA3P26370 DBP2YNL112W 1641 nt19.96■□□□□ 0.79
UGA3P26370 TRN1tP(UGG)A 72 nt19.85■□□□□ 0.77
UGA3P26370 SUF9tP(UGG)F 72 nt19.85■□□□□ 0.77
UGA3P26370 SUF8tP(UGG)H 72 nt19.85■□□□□ 0.77
UGA3P26370 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt19.85■□□□□ 0.77
UGA3P26370 SUF7tP(UGG)M 72 nt19.85■□□□□ 0.77
UGA3P26370 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt19.85■□□□□ 0.77
UGA3P26370 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt19.85■□□□□ 0.77
UGA3P26370 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt19.85■□□□□ 0.77
UGA3P26370 SUF11tP(UGG)O2 72 nt19.85■□□□□ 0.77
UGA3P26370 CCC1YLR220W 969 nt19.75■□□□□ 0.75
UGA3P26370 SCJ1YMR214W 1134 nt19.4■□□□□ 0.7
UGA3P26370 ATS1YAL020C 1002 nt19.39■□□□□ 0.69
UGA3P26370 YBR190WYBR190W 312 nt19.09■□□□□ 0.65
UGA3P26370 PET122YER153C 765 nt19.06■□□□□ 0.64
UGA3P26370 SCR1SCR1 522 nt18.95■□□□□ 0.62
UGA3P26370 RVS167YDR388W 1449 nt18.9■□□□□ 0.62
UGA3P26370 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt18.88■□□□□ 0.61
UGA3P26370 RTC3YHR087W 336 nt18.77■□□□□ 0.6
UGA3P26370 RRN5YLR141W 1092 nt18.54■□□□□ 0.56
UGA3P26370 RSB1YOR049C 1065 nt18.28■□□□□ 0.52
UGA3P26370 SHR5YOL110W 714 nt18.26■□□□□ 0.51
UGA3P26370 YDJ1YNL064C 1230 nt18.24■□□□□ 0.51
UGA3P26370 YER088W-BYER088W-B 147 nt18.17■□□□□ 0.5
UGA3P26370 PST2YDR032C 597 nt17.89■□□□□ 0.45
UGA3P26370 GAR1YHR089C 618 nt17.86■□□□□ 0.45
UGA3P26370 DEP1YAL013W 1218 nt17.73■□□□□ 0.43
UGA3P26370 URN1YPR152C 1398 nt17.63■□□□□ 0.41
UGA3P26370 RPN10YHR200W 807 nt17.43■□□□□ 0.38
UGA3P26370 YNL208WYNL208W 600 nt17.43■□□□□ 0.38
UGA3P26370 YKL097CYKL097C 411 nt17.37■□□□□ 0.37
UGA3P26370 OPI9YLR338W 858 nt17.28■□□□□ 0.36
UGA3P26370 TIR1YER011W 765 nt17.22■□□□□ 0.35
UGA3P26370 SHU1YHL006C 453 nt17.14■□□□□ 0.33
UGA3P26370 SAH1YER043C 1350 nt17.14■□□□□ 0.33
UGA3P26370 PUT4YOR348C 1884 nt17.12■□□□□ 0.33
UGA3P26370 SSA1YAL005C 1929 nt16.95■□□□□ 0.3
UGA3P26370 ARE1YCR048W 1833 nt16.9■□□□□ 0.3
UGA3P26370 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.85■□□□□ 0.29
UGA3P26370 YJR018WYJR018W 363 nt16.82■□□□□ 0.28
UGA3P26370 PUN1YLR414C 792 nt16.79■□□□□ 0.28
UGA3P26370 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt16.73■□□□□ 0.27
UGA3P26370 SRB2YHR041C 633 nt16.7■□□□□ 0.26
UGA3P26370 POA1YBR022W 534 nt16.67■□□□□ 0.26
UGA3P26370 YOR139CYOR139C 393 nt16.59■□□□□ 0.25
UGA3P26370 RPP2BYDR382W 333 nt16.57■□□□□ 0.24
UGA3P26370 PTC2YER089C 1395 nt16.56■□□□□ 0.24
UGA3P26370 YJR120WYJR120W 351 nt16.56■□□□□ 0.24
UGA3P26370 WWM1YFL010C 636 nt16.52■□□□□ 0.24
UGA3P26370 YGR021WYGR021W 873 nt16.48■□□□□ 0.23
UGA3P26370 NPL3YDR432W 1245 nt16.46■□□□□ 0.23
UGA3P26370 MNP1YGL068W 585 nt16.42■□□□□ 0.22
UGA3P26370 BUD23YCR047C 828 nt16.41■□□□□ 0.22
UGA3P26370 HOM6YJR139C 1080 nt16.41■□□□□ 0.22
UGA3P26370 NAB2YGL122C 1578 nt16.29■□□□□ 0.2
UGA3P26370 BDH2YAL061W 1254 nt16.25■□□□□ 0.19
UGA3P26370 BSC6YOL137W 1494 nt16.23■□□□□ 0.19
UGA3P26370 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt16.22■□□□□ 0.19
UGA3P26370 YOL037CYOL037C 354 nt16.21■□□□□ 0.19
UGA3P26370 RKM5YLR137W 1104 nt16.19■□□□□ 0.18
UGA3P26370 FPR4YLR449W 1179 nt16.19■□□□□ 0.18
UGA3P26370 INM2YDR287W 879 nt16.17■□□□□ 0.18
UGA3P26370 DAL1YIR027C 1383 nt16.13■□□□□ 0.17
UGA3P26370 SSA3YBL075C 1950 nt16.09■□□□□ 0.17
UGA3P26370 YBL100CYBL100C 315 nt16.08■□□□□ 0.16
UGA3P26370 FIS1YIL065C 468 nt16.07■□□□□ 0.16
UGA3P26370 LSM3YLR438C-A 270 nt16.06■□□□□ 0.16
UGA3P26370 PHO4YFR034C 939 nt15.98■□□□□ 0.15
UGA3P26370 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.93■□□□□ 0.14
UGA3P26370 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.93■□□□□ 0.14
UGA3P26370 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.93■□□□□ 0.14
UGA3P26370 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.93■□□□□ 0.14
UGA3P26370 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.93■□□□□ 0.14
UGA3P26370 TRM9YML014W 840 nt15.92■□□□□ 0.14
UGA3P26370 FUN26YAL022C 1554 nt15.89■□□□□ 0.13
UGA3P26370 YLR281CYLR281C 468 nt15.8■□□□□ 0.12
UGA3P26370 PUS2YGL063W 1113 nt15.79■□□□□ 0.12
UGA3P26370 WHI5YOR083W 888 nt15.74■□□□□ 0.11
UGA3P26370 CCT6YDR188W 1641 nt15.7■□□□□ 0.1
UGA3P26370 ALF1YNL148C 765 nt15.65■□□□□ 0.1
UGA3P26370 SUF2tP(AGG)C 72 nt15.58■□□□□ 0.08
UGA3P26370 SUF10tP(AGG)N 72 nt15.58■□□□□ 0.08
UGA3P26370 YPS1YLR120C 1710 nt15.55■□□□□ 0.08
UGA3P26370 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt15.55■□□□□ 0.08
UGA3P26370 YDR095CYDR095C 411 nt15.49■□□□□ 0.07
UGA3P26370 DSK2YMR276W 1122 nt15.44■□□□□ 0.06
UGA3P26370 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.3 ms