Protein–RNA interactions for Protein: P19263

RGR1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 14, yeastyeast

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RGR1P19263 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.41■■□□□ 1.02
RGR1P19263 NSR1YGR159C 1245 nt21.12■□□□□ 0.97
RGR1P19263 NOP1YDL014W 984 nt20.88■□□□□ 0.93
RGR1P19263 YKL036CYKL036C 393 nt19.38■□□□□ 0.69
RGR1P19263 MDJ1YFL016C 1536 nt18.62■□□□□ 0.57
RGR1P19263 Q0297Q0297 156 nt18.28■□□□□ 0.52
RGR1P19263 SRX1YKL086W 384 nt18.21■□□□□ 0.51
RGR1P19263 YJL027CYJL027C 417 nt18.13■□□□□ 0.49
RGR1P19263 SCS3YGL126W 1143 nt17.68■□□□□ 0.42
RGR1P19263 YCR051WYCR051W 669 nt17.32■□□□□ 0.36
RGR1P19263 YOL085CYOL085C 342 nt16.76■□□□□ 0.27
RGR1P19263 PKP1YIL042C 1185 nt16.5■□□□□ 0.23
RGR1P19263 DBP2YNL112W 1641 nt16.48■□□□□ 0.23
RGR1P19263 RPP1BYDL130W 321 nt16.41■□□□□ 0.22
RGR1P19263 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.37■□□□□ 0.21
RGR1P19263 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.37■□□□□ 0.21
RGR1P19263 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.37■□□□□ 0.21
RGR1P19263 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.37■□□□□ 0.21
RGR1P19263 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.37■□□□□ 0.21
RGR1P19263 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.37■□□□□ 0.21
RGR1P19263 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.37■□□□□ 0.21
RGR1P19263 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.37■□□□□ 0.21
RGR1P19263 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.37■□□□□ 0.21
RGR1P19263 CCC1YLR220W 969 nt16.25■□□□□ 0.19
RGR1P19263 SCJ1YMR214W 1134 nt15.94■□□□□ 0.14
RGR1P19263 ATS1YAL020C 1002 nt15.85■□□□□ 0.13
RGR1P19263 YBR190WYBR190W 312 nt15.84■□□□□ 0.13
RGR1P19263 Q0182Q0182 405 nt15.82■□□□□ 0.12
RGR1P19263 MOT3YMR070W 1473 nt15.78■□□□□ 0.12
RGR1P19263 PET122YER153C 765 nt15.65■□□□□ 0.1
RGR1P19263 RVS167YDR388W 1449 nt15.63■□□□□ 0.09
RGR1P19263 SCR1SCR1 522 nt15.58■□□□□ 0.08
RGR1P19263 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.55■□□□□ 0.08
RGR1P19263 RTC3YHR087W 336 nt15.55■□□□□ 0.08
RGR1P19263 RRN5YLR141W 1092 nt15.22■□□□□ 0.03
RGR1P19263 YGR139WYGR139W 339 nt15.16■□□□□ 0.02
RGR1P19263 SHR5YOL110W 714 nt15.08■□□□□ 0
RGR1P19263 YDJ1YNL064C 1230 nt15.03■□□□□ -0
RGR1P19263 RSB1YOR049C 1065 nt14.99□□□□□ -0.01
RGR1P19263 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.92□□□□□ -0.02
RGR1P19263 SSA3YBL075C 1950 nt14.75□□□□□ -0.05
RGR1P19263 GAR1YHR089C 618 nt14.7□□□□□ -0.06
RGR1P19263 PST2YDR032C 597 nt14.63□□□□□ -0.07
RGR1P19263 DEP1YAL013W 1218 nt14.62□□□□□ -0.07
RGR1P19263 NME1NME1 340 nt14.59□□□□□ -0.07
RGR1P19263 URN1YPR152C 1398 nt14.58□□□□□ -0.08
RGR1P19263 RPN10YHR200W 807 nt14.44□□□□□ -0.1
RGR1P19263 YNL208WYNL208W 600 nt14.41□□□□□ -0.1
RGR1P19263 OPI9YLR338W 858 nt14.32□□□□□ -0.12
RGR1P19263 PUT4YOR348C 1884 nt14.26□□□□□ -0.13
RGR1P19263 SAH1YER043C 1350 nt14.19□□□□□ -0.14
RGR1P19263 TIR1YER011W 765 nt14.18□□□□□ -0.14
RGR1P19263 YKL097CYKL097C 411 nt14.18□□□□□ -0.14
RGR1P19263 SHU1YHL006C 453 nt14.02□□□□□ -0.17
RGR1P19263 ARE1YCR048W 1833 nt14.01□□□□□ -0.17
RGR1P19263 SSA1YAL005C 1929 nt13.96□□□□□ -0.18
RGR1P19263 PUN1YLR414C 792 nt13.94□□□□□ -0.18
RGR1P19263 YJR018WYJR018W 363 nt13.92□□□□□ -0.18
RGR1P19263 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.89□□□□□ -0.19
RGR1P19263 CSM2YIL132C 642 nt13.84□□□□□ -0.19
RGR1P19263 POA1YBR022W 534 nt13.84□□□□□ -0.19
RGR1P19263 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.77□□□□□ -0.21
RGR1P19263 PTC2YER089C 1395 nt13.72□□□□□ -0.21
RGR1P19263 RPP2BYDR382W 333 nt13.72□□□□□ -0.21
RGR1P19263 SRB2YHR041C 633 nt13.71□□□□□ -0.21
RGR1P19263 YJR120WYJR120W 351 nt13.66□□□□□ -0.22
RGR1P19263 BUD23YCR047C 828 nt13.61□□□□□ -0.23
RGR1P19263 WWM1YFL010C 636 nt13.58□□□□□ -0.24
RGR1P19263 YGR021WYGR021W 873 nt13.57□□□□□ -0.24
RGR1P19263 BSC6YOL137W 1494 nt13.56□□□□□ -0.24
RGR1P19263 PAU21YOR394W 495 nt13.55□□□□□ -0.24
RGR1P19263 PAU22YPL282C 495 nt13.55□□□□□ -0.24
RGR1P19263 YOR139CYOR139C 393 nt13.54□□□□□ -0.24
RGR1P19263 NAB2YGL122C 1578 nt13.52□□□□□ -0.25
RGR1P19263 HOM6YJR139C 1080 nt13.49□□□□□ -0.25
RGR1P19263 NPL3YDR432W 1245 nt13.47□□□□□ -0.25
RGR1P19263 MNP1YGL068W 585 nt13.46□□□□□ -0.25
RGR1P19263 SPT5YML010W 3192 nt13.44□□□□□ -0.26
RGR1P19263 BDH2YAL061W 1254 nt13.42□□□□□ -0.26
RGR1P19263 INM2YDR287W 879 nt13.41□□□□□ -0.26
RGR1P19263 ARO7YPR060C 771 nt13.4□□□□□ -0.26
RGR1P19263 FPR4YLR449W 1179 nt13.39□□□□□ -0.27
RGR1P19263 DAL1YIR027C 1383 nt13.38□□□□□ -0.27
RGR1P19263 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.37□□□□□ -0.27
RGR1P19263 FIS1YIL065C 468 nt13.32□□□□□ -0.28
RGR1P19263 RKM5YLR137W 1104 nt13.31□□□□□ -0.28
RGR1P19263 YBL100CYBL100C 315 nt13.31□□□□□ -0.28
RGR1P19263 YOL037CYOL037C 354 nt13.31□□□□□ -0.28
RGR1P19263 LSM3YLR438C-A 270 nt13.27□□□□□ -0.29
RGR1P19263 PHO4YFR034C 939 nt13.25□□□□□ -0.29
RGR1P19263 SSA4YER103W 1929 nt13.2□□□□□ -0.3
RGR1P19263 TRM9YML014W 840 nt13.17□□□□□ -0.3
RGR1P19263 FUN26YAL022C 1554 nt13.14□□□□□ -0.31
RGR1P19263 REG2YBR050C 1017 nt13.01□□□□□ -0.33
RGR1P19263 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13□□□□□ -0.33
RGR1P19263 IMT4tM(CAU)E 72 nt13□□□□□ -0.33
RGR1P19263 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13□□□□□ -0.33
RGR1P19263 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13□□□□□ -0.33
RGR1P19263 IMT2tM(CAU)P 72 nt13□□□□□ -0.33
RGR1P19263 PAM17YKR065C 594 nt13□□□□□ -0.33
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