Protein–RNA interactions for Protein: P53739

FPK1, Flippase kinase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FPK1P53739 YML009W-BYML009W-B 477 nt24.77■■□□□ 1.56
FPK1P53739 NOP1YDL014W 984 nt24.42■■□□□ 1.5
FPK1P53739 NSR1YGR159C 1245 nt23.89■■□□□ 1.41
FPK1P53739 YKL036CYKL036C 393 nt23.23■■□□□ 1.31
FPK1P53739 YJL027CYJL027C 417 nt21.87■■□□□ 1.09
FPK1P53739 Q0297Q0297 156 nt21.56■■□□□ 1.04
FPK1P53739 SCS3YGL126W 1143 nt21.52■■□□□ 1.04
FPK1P53739 SRX1YKL086W 384 nt21.29■■□□□ 1
FPK1P53739 MDJ1YFL016C 1536 nt20.48■□□□□ 0.87
FPK1P53739 YCR051WYCR051W 669 nt20.32■□□□□ 0.84
FPK1P53739 YOL085CYOL085C 342 nt20.07■□□□□ 0.8
FPK1P53739 SCJ1YMR214W 1134 nt20.05■□□□□ 0.8
FPK1P53739 PKP1YIL042C 1185 nt19.71■□□□□ 0.75
FPK1P53739 ATS1YAL020C 1002 nt19.47■□□□□ 0.71
FPK1P53739 RPP1BYDL130W 321 nt19.37■□□□□ 0.69
FPK1P53739 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.76■□□□□ 0.59
FPK1P53739 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.76■□□□□ 0.59
FPK1P53739 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.76■□□□□ 0.59
FPK1P53739 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.76■□□□□ 0.59
FPK1P53739 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.76■□□□□ 0.59
FPK1P53739 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.76■□□□□ 0.59
FPK1P53739 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.76■□□□□ 0.59
FPK1P53739 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.76■□□□□ 0.59
FPK1P53739 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.76■□□□□ 0.59
FPK1P53739 CCC1YLR220W 969 nt18.67■□□□□ 0.58
FPK1P53739 SCR1SCR1 522 nt18.49■□□□□ 0.55
FPK1P53739 PET122YER153C 765 nt18.41■□□□□ 0.54
FPK1P53739 DBP2YNL112W 1641 nt18.37■□□□□ 0.53
FPK1P53739 RTC3YHR087W 336 nt18.25■□□□□ 0.51
FPK1P53739 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt18.03■□□□□ 0.48
FPK1P53739 RRN5YLR141W 1092 nt17.97■□□□□ 0.47
FPK1P53739 RSB1YOR049C 1065 nt17.88■□□□□ 0.45
FPK1P53739 PST2YDR032C 597 nt17.87■□□□□ 0.45
FPK1P53739 YKL097CYKL097C 411 nt17.64■□□□□ 0.41
FPK1P53739 YER088W-BYER088W-B 147 nt17.61■□□□□ 0.41
FPK1P53739 RVS167YDR388W 1449 nt17.58■□□□□ 0.41
FPK1P53739 YDJ1YNL064C 1230 nt17.42■□□□□ 0.38
FPK1P53739 YBR190WYBR190W 312 nt17.24■□□□□ 0.35
FPK1P53739 SHR5YOL110W 714 nt17.1■□□□□ 0.33
FPK1P53739 SHU1YHL006C 453 nt16.97■□□□□ 0.31
FPK1P53739 GAR1YHR089C 618 nt16.95■□□□□ 0.3
FPK1P53739 YOR139CYOR139C 393 nt16.71■□□□□ 0.27
FPK1P53739 NPL3YDR432W 1245 nt16.5■□□□□ 0.23
FPK1P53739 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.49■□□□□ 0.23
FPK1P53739 DEP1YAL013W 1218 nt16.39■□□□□ 0.21
FPK1P53739 TIR1YER011W 765 nt16.33■□□□□ 0.2
FPK1P53739 YNL208WYNL208W 600 nt16.21■□□□□ 0.19
FPK1P53739 URN1YPR152C 1398 nt16.15■□□□□ 0.18
FPK1P53739 RPN10YHR200W 807 nt16.13■□□□□ 0.17
FPK1P53739 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt16.02■□□□□ 0.16
FPK1P53739 IMT4tM(CAU)E 72 nt16.02■□□□□ 0.16
FPK1P53739 IMT3tM(CAU)J3 72 nt16.02■□□□□ 0.16
FPK1P53739 IMT1tM(CAU)O1 72 nt16.02■□□□□ 0.16
FPK1P53739 IMT2tM(CAU)P 72 nt16.02■□□□□ 0.16
FPK1P53739 YOL037CYOL037C 354 nt15.97■□□□□ 0.15
FPK1P53739 SSA1YAL005C 1929 nt15.94■□□□□ 0.14
FPK1P53739 MNP1YGL068W 585 nt15.91■□□□□ 0.14
FPK1P53739 YGR021WYGR021W 873 nt15.91■□□□□ 0.14
FPK1P53739 Q0182Q0182 405 nt15.87■□□□□ 0.13
FPK1P53739 HOM6YJR139C 1080 nt15.86■□□□□ 0.13
FPK1P53739 BSC6YOL137W 1494 nt15.84■□□□□ 0.13
FPK1P53739 SRB2YHR041C 633 nt15.77■□□□□ 0.12
FPK1P53739 MOT3YMR070W 1473 nt15.77■□□□□ 0.11
FPK1P53739 WWM1YFL010C 636 nt15.74■□□□□ 0.11
FPK1P53739 OPI9YLR338W 858 nt15.72■□□□□ 0.11
FPK1P53739 PUS2YGL063W 1113 nt15.67■□□□□ 0.1
FPK1P53739 RKM5YLR137W 1104 nt15.64■□□□□ 0.09
FPK1P53739 YLR281CYLR281C 468 nt15.51■□□□□ 0.07
FPK1P53739 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt15.47■□□□□ 0.07
FPK1P53739 YJR018WYJR018W 363 nt15.45■□□□□ 0.06
FPK1P53739 SAH1YER043C 1350 nt15.43■□□□□ 0.06
FPK1P53739 RPP2BYDR382W 333 nt15.41■□□□□ 0.06
FPK1P53739 MRPL8YJL063C 717 nt15.39■□□□□ 0.05
FPK1P53739 WHI5YOR083W 888 nt15.37■□□□□ 0.05
FPK1P53739 PUN1YLR414C 792 nt15.3■□□□□ 0.04
FPK1P53739 FMP45YDL222C 930 nt15.28■□□□□ 0.04
FPK1P53739 YJR120WYJR120W 351 nt15.28■□□□□ 0.04
FPK1P53739 BDH2YAL061W 1254 nt15.18■□□□□ 0.02
FPK1P53739 YCH1YGR203W 447 nt15.17■□□□□ 0.02
FPK1P53739 ADO1YJR105W 1023 nt15.15■□□□□ 0.02
FPK1P53739 UBX6YJL048C 1191 nt15.14■□□□□ 0.01
FPK1P53739 DSK2YMR276W 1122 nt15.14■□□□□ 0.01
FPK1P53739 LSM3YLR438C-A 270 nt15.13■□□□□ 0.01
FPK1P53739 SSA3YBL075C 1950 nt15.12■□□□□ 0.01
FPK1P53739 YPR011CYPR011C 981 nt15.08■□□□□ 0
FPK1P53739 IMP2'YIL154C 1041 nt15.05■□□□□ -0
FPK1P53739 YLR236CYLR236C 324 nt15.02■□□□□ -0
FPK1P53739 PUT4YOR348C 1884 nt15□□□□□ -0.01
FPK1P53739 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt14.99□□□□□ -0.01
FPK1P53739 YEL076CYEL076C 651 nt14.99□□□□□ -0.01
FPK1P53739 YLR464WYLR464W 651 nt14.99□□□□□ -0.01
FPK1P53739 ARE1YCR048W 1833 nt14.99□□□□□ -0.01
FPK1P53739 PTC2YER089C 1395 nt14.98□□□□□ -0.01
FPK1P53739 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.84□□□□□ -0.03
FPK1P53739 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.82□□□□□ -0.04
FPK1P53739 INM2YDR287W 879 nt14.81□□□□□ -0.04
FPK1P53739 YBL100CYBL100C 315 nt14.8□□□□□ -0.04
FPK1P53739 TRM9YML014W 840 nt14.79□□□□□ -0.04
FPK1P53739 SIS1YNL007C 1059 nt14.78□□□□□ -0.04
FPK1P53739 RTG1YOL067C 534 nt14.76□□□□□ -0.05
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