Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SNX11Q9Y5W9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SNX11Q9Y5W9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SNX11Q9Y5W9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SNX11Q9Y5W9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SNX11Q9Y5W9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SNX11Q9Y5W9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SNX11Q9Y5W9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
SNX11Q9Y5W9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SNX11Q9Y5W9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SNX11Q9Y5W9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SNX11Q9Y5W9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SNX11Q9Y5W9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SNX11Q9Y5W9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SNX11Q9Y5W9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SNX11Q9Y5W9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SNX11Q9Y5W9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SNX11Q9Y5W9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SNX11Q9Y5W9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SNX11Q9Y5W9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SNX11Q9Y5W9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SNX11Q9Y5W9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SNX11Q9Y5W9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SNX11Q9Y5W9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SNX11Q9Y5W9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SNX11Q9Y5W9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SNX11Q9Y5W9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SNX11Q9Y5W9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SNX11Q9Y5W9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SNX11Q9Y5W9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SNX11Q9Y5W9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SNX11Q9Y5W9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
SNX11Q9Y5W9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SNX11Q9Y5W9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SNX11Q9Y5W9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SNX11Q9Y5W9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
SNX11Q9Y5W9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
SNX11Q9Y5W9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
SNX11Q9Y5W9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SNX11Q9Y5W9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SNX11Q9Y5W9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SNX11Q9Y5W9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SNX11Q9Y5W9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SNX11Q9Y5W9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SNX11Q9Y5W9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SNX11Q9Y5W9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SNX11Q9Y5W9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SNX11Q9Y5W9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SNX11Q9Y5W9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SNX11Q9Y5W9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SNX11Q9Y5W9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SNX11Q9Y5W9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SNX11Q9Y5W9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SNX11Q9Y5W9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SNX11Q9Y5W9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNX11Q9Y5W9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNX11Q9Y5W9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNX11Q9Y5W9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNX11Q9Y5W9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNX11Q9Y5W9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SNX11Q9Y5W9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SNX11Q9Y5W9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SNX11Q9Y5W9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SNX11Q9Y5W9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SNX11Q9Y5W9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SNX11Q9Y5W9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SNX11Q9Y5W9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SNX11Q9Y5W9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SNX11Q9Y5W9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SNX11Q9Y5W9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SNX11Q9Y5W9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SNX11Q9Y5W9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SNX11Q9Y5W9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SNX11Q9Y5W9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SNX11Q9Y5W9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SNX11Q9Y5W9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SNX11Q9Y5W9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SNX11Q9Y5W9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNX11Q9Y5W9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SNX11Q9Y5W9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNX11Q9Y5W9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SNX11Q9Y5W9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SNX11Q9Y5W9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SNX11Q9Y5W9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SNX11Q9Y5W9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SNX11Q9Y5W9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SNX11Q9Y5W9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SNX11Q9Y5W9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SNX11Q9Y5W9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SNX11Q9Y5W9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SNX11Q9Y5W9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SNX11Q9Y5W9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SNX11Q9Y5W9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNX11Q9Y5W9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SNX11Q9Y5W9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SNX11Q9Y5W9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SNX11Q9Y5W9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNX11Q9Y5W9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNX11Q9Y5W9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SNX11Q9Y5W9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms