Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I4

PCDHAC2, Protocadherin alpha-C2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHAC2Q9Y5I4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC41.76■■■■■ 4.28
PCDHAC2Q9Y5I4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
PCDHAC2Q9Y5I4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
PCDHAC2Q9Y5I4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
PCDHAC2Q9Y5I4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
PCDHAC2Q9Y5I4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
PCDHAC2Q9Y5I4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
PCDHAC2Q9Y5I4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
PCDHAC2Q9Y5I4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
PCDHAC2Q9Y5I4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
PCDHAC2Q9Y5I4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
PCDHAC2Q9Y5I4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
PCDHAC2Q9Y5I4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
PCDHAC2Q9Y5I4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
PCDHAC2Q9Y5I4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
PCDHAC2Q9Y5I4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
PCDHAC2Q9Y5I4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
PCDHAC2Q9Y5I4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PCDHAC2Q9Y5I4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PCDHAC2Q9Y5I4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
PCDHAC2Q9Y5I4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
PCDHAC2Q9Y5I4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
PCDHAC2Q9Y5I4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PCDHAC2Q9Y5I4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
PCDHAC2Q9Y5I4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
PCDHAC2Q9Y5I4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PCDHAC2Q9Y5I4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
PCDHAC2Q9Y5I4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PCDHAC2Q9Y5I4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
PCDHAC2Q9Y5I4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PCDHAC2Q9Y5I4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
PCDHAC2Q9Y5I4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
PCDHAC2Q9Y5I4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PCDHAC2Q9Y5I4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
PCDHAC2Q9Y5I4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
PCDHAC2Q9Y5I4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PCDHAC2Q9Y5I4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PCDHAC2Q9Y5I4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
PCDHAC2Q9Y5I4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PCDHAC2Q9Y5I4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PCDHAC2Q9Y5I4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PCDHAC2Q9Y5I4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PCDHAC2Q9Y5I4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PCDHAC2Q9Y5I4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PCDHAC2Q9Y5I4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PCDHAC2Q9Y5I4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PCDHAC2Q9Y5I4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PCDHAC2Q9Y5I4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
PCDHAC2Q9Y5I4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PCDHAC2Q9Y5I4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PCDHAC2Q9Y5I4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PCDHAC2Q9Y5I4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PCDHAC2Q9Y5I4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PCDHAC2Q9Y5I4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PCDHAC2Q9Y5I4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PCDHAC2Q9Y5I4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PCDHAC2Q9Y5I4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PCDHAC2Q9Y5I4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PCDHAC2Q9Y5I4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PCDHAC2Q9Y5I4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PCDHAC2Q9Y5I4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PCDHAC2Q9Y5I4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.35
PCDHAC2Q9Y5I4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PCDHAC2Q9Y5I4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PCDHAC2Q9Y5I4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PCDHAC2Q9Y5I4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PCDHAC2Q9Y5I4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PCDHAC2Q9Y5I4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PCDHAC2Q9Y5I4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PCDHAC2Q9Y5I4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PCDHAC2Q9Y5I4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PCDHAC2Q9Y5I4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PCDHAC2Q9Y5I4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PCDHAC2Q9Y5I4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PCDHAC2Q9Y5I4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PCDHAC2Q9Y5I4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PCDHAC2Q9Y5I4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
PCDHAC2Q9Y5I4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PCDHAC2Q9Y5I4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
PCDHAC2Q9Y5I4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PCDHAC2Q9Y5I4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PCDHAC2Q9Y5I4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PCDHAC2Q9Y5I4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PCDHAC2Q9Y5I4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PCDHAC2Q9Y5I4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PCDHAC2Q9Y5I4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PCDHAC2Q9Y5I4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PCDHAC2Q9Y5I4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
PCDHAC2Q9Y5I4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
PCDHAC2Q9Y5I4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PCDHAC2Q9Y5I4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PCDHAC2Q9Y5I4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PCDHAC2Q9Y5I4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms