Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y490

TLN1, Talin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLN1Q9Y490 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TLN1Q9Y490 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TLN1Q9Y490 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TLN1Q9Y490 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TLN1Q9Y490 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TLN1Q9Y490 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TLN1Q9Y490 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TLN1Q9Y490 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TLN1Q9Y490 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TLN1Q9Y490 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TLN1Q9Y490 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TLN1Q9Y490 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TLN1Q9Y490 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TLN1Q9Y490 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
TLN1Q9Y490 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TLN1Q9Y490 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TLN1Q9Y490 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TLN1Q9Y490 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TLN1Q9Y490 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TLN1Q9Y490 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TLN1Q9Y490 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TLN1Q9Y490 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TLN1Q9Y490 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TLN1Q9Y490 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TLN1Q9Y490 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TLN1Q9Y490 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TLN1Q9Y490 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TLN1Q9Y490 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TLN1Q9Y490 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TLN1Q9Y490 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TLN1Q9Y490 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TLN1Q9Y490 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TLN1Q9Y490 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TLN1Q9Y490 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TLN1Q9Y490 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TLN1Q9Y490 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TLN1Q9Y490 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TLN1Q9Y490 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TLN1Q9Y490 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TLN1Q9Y490 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TLN1Q9Y490 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TLN1Q9Y490 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TLN1Q9Y490 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TLN1Q9Y490 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TLN1Q9Y490 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TLN1Q9Y490 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TLN1Q9Y490 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TLN1Q9Y490 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TLN1Q9Y490 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TLN1Q9Y490 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TLN1Q9Y490 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TLN1Q9Y490 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
TLN1Q9Y490 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TLN1Q9Y490 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TLN1Q9Y490 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TLN1Q9Y490 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TLN1Q9Y490 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TLN1Q9Y490 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TLN1Q9Y490 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TLN1Q9Y490 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TLN1Q9Y490 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TLN1Q9Y490 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TLN1Q9Y490 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TLN1Q9Y490 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TLN1Q9Y490 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TLN1Q9Y490 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TLN1Q9Y490 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TLN1Q9Y490 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TLN1Q9Y490 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TLN1Q9Y490 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TLN1Q9Y490 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TLN1Q9Y490 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TLN1Q9Y490 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TLN1Q9Y490 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TLN1Q9Y490 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TLN1Q9Y490 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TLN1Q9Y490 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TLN1Q9Y490 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TLN1Q9Y490 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TLN1Q9Y490 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TLN1Q9Y490 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TLN1Q9Y490 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TLN1Q9Y490 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TLN1Q9Y490 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TLN1Q9Y490 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TLN1Q9Y490 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TLN1Q9Y490 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TLN1Q9Y490 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TLN1Q9Y490 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TLN1Q9Y490 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TLN1Q9Y490 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TLN1Q9Y490 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TLN1Q9Y490 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TLN1Q9Y490 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TLN1Q9Y490 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TLN1Q9Y490 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TLN1Q9Y490 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TLN1Q9Y490 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TLN1Q9Y490 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TLN1Q9Y490 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms