Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC44.59■■■■■ 4.73
ATF5Q9Y2D1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.17■■■■■ 4.66
ATF5Q9Y2D1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC44.16■■■■■ 4.66
ATF5Q9Y2D1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
ATF5Q9Y2D1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
ATF5Q9Y2D1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
ATF5Q9Y2D1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
ATF5Q9Y2D1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
ATF5Q9Y2D1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC42.56■■■■■ 4.4
ATF5Q9Y2D1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
ATF5Q9Y2D1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
ATF5Q9Y2D1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC42.05■■■■■ 4.32
ATF5Q9Y2D1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
ATF5Q9Y2D1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
ATF5Q9Y2D1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
ATF5Q9Y2D1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
ATF5Q9Y2D1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
ATF5Q9Y2D1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
ATF5Q9Y2D1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
ATF5Q9Y2D1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
ATF5Q9Y2D1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
ATF5Q9Y2D1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC41.34■■■■■ 4.21
ATF5Q9Y2D1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
ATF5Q9Y2D1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
ATF5Q9Y2D1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
ATF5Q9Y2D1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
ATF5Q9Y2D1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
ATF5Q9Y2D1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
ATF5Q9Y2D1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
ATF5Q9Y2D1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC40.76■■■■■ 4.12
ATF5Q9Y2D1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
ATF5Q9Y2D1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
ATF5Q9Y2D1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
ATF5Q9Y2D1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
ATF5Q9Y2D1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
ATF5Q9Y2D1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
ATF5Q9Y2D1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC40.03■■■■■ 4
ATF5Q9Y2D1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
ATF5Q9Y2D1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
ATF5Q9Y2D1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
ATF5Q9Y2D1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
ATF5Q9Y2D1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
ATF5Q9Y2D1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
ATF5Q9Y2D1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
ATF5Q9Y2D1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
ATF5Q9Y2D1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
ATF5Q9Y2D1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
ATF5Q9Y2D1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
ATF5Q9Y2D1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
ATF5Q9Y2D1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
ATF5Q9Y2D1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC39.29■■■■□ 3.88
ATF5Q9Y2D1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
ATF5Q9Y2D1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
ATF5Q9Y2D1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
ATF5Q9Y2D1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ATF5Q9Y2D1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
ATF5Q9Y2D1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
ATF5Q9Y2D1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
ATF5Q9Y2D1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
ATF5Q9Y2D1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
ATF5Q9Y2D1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
ATF5Q9Y2D1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
ATF5Q9Y2D1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
ATF5Q9Y2D1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
ATF5Q9Y2D1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
ATF5Q9Y2D1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
ATF5Q9Y2D1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
ATF5Q9Y2D1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
ATF5Q9Y2D1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
ATF5Q9Y2D1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
ATF5Q9Y2D1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ATF5Q9Y2D1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
ATF5Q9Y2D1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
ATF5Q9Y2D1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
ATF5Q9Y2D1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
ATF5Q9Y2D1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
ATF5Q9Y2D1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
ATF5Q9Y2D1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
ATF5Q9Y2D1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
ATF5Q9Y2D1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
ATF5Q9Y2D1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
ATF5Q9Y2D1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
ATF5Q9Y2D1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
ATF5Q9Y2D1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
ATF5Q9Y2D1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
ATF5Q9Y2D1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
ATF5Q9Y2D1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
ATF5Q9Y2D1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
ATF5Q9Y2D1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
ATF5Q9Y2D1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ATF5Q9Y2D1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ATF5Q9Y2D1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
ATF5Q9Y2D1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
ATF5Q9Y2D1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ATF5Q9Y2D1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ATF5Q9Y2D1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ATF5Q9Y2D1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
ATF5Q9Y2D1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ATF5Q9Y2D1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
ATF5Q9Y2D1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms