Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
ATF5Q9Y2D1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ATF5Q9Y2D1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
ATF5Q9Y2D1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ATF5Q9Y2D1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC38.13■■■■□ 3.7
ATF5Q9Y2D1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
ATF5Q9Y2D1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
ATF5Q9Y2D1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
ATF5Q9Y2D1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ATF5Q9Y2D1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
ATF5Q9Y2D1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
ATF5Q9Y2D1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
ATF5Q9Y2D1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
ATF5Q9Y2D1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
ATF5Q9Y2D1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ATF5Q9Y2D1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
ATF5Q9Y2D1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
ATF5Q9Y2D1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
ATF5Q9Y2D1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
ATF5Q9Y2D1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ATF5Q9Y2D1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
ATF5Q9Y2D1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
ATF5Q9Y2D1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
ATF5Q9Y2D1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
ATF5Q9Y2D1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ATF5Q9Y2D1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
ATF5Q9Y2D1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
ATF5Q9Y2D1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
ATF5Q9Y2D1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ATF5Q9Y2D1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ATF5Q9Y2D1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ATF5Q9Y2D1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ATF5Q9Y2D1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ATF5Q9Y2D1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ATF5Q9Y2D1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
ATF5Q9Y2D1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ATF5Q9Y2D1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
ATF5Q9Y2D1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ATF5Q9Y2D1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ATF5Q9Y2D1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
ATF5Q9Y2D1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ATF5Q9Y2D1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ATF5Q9Y2D1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ATF5Q9Y2D1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ATF5Q9Y2D1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ATF5Q9Y2D1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
ATF5Q9Y2D1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ATF5Q9Y2D1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
ATF5Q9Y2D1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ATF5Q9Y2D1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ATF5Q9Y2D1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
ATF5Q9Y2D1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
ATF5Q9Y2D1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ATF5Q9Y2D1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ATF5Q9Y2D1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ATF5Q9Y2D1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
ATF5Q9Y2D1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ATF5Q9Y2D1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ATF5Q9Y2D1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
ATF5Q9Y2D1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
ATF5Q9Y2D1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC37■■■■□ 3.51
ATF5Q9Y2D1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
ATF5Q9Y2D1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC37■■■■□ 3.51
ATF5Q9Y2D1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ATF5Q9Y2D1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
ATF5Q9Y2D1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
ATF5Q9Y2D1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ATF5Q9Y2D1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ATF5Q9Y2D1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ATF5Q9Y2D1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ATF5Q9Y2D1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ATF5Q9Y2D1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ATF5Q9Y2D1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ATF5Q9Y2D1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ATF5Q9Y2D1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ATF5Q9Y2D1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ATF5Q9Y2D1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
ATF5Q9Y2D1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ATF5Q9Y2D1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ATF5Q9Y2D1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ATF5Q9Y2D1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
ATF5Q9Y2D1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ATF5Q9Y2D1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ATF5Q9Y2D1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
ATF5Q9Y2D1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
ATF5Q9Y2D1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ATF5Q9Y2D1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ATF5Q9Y2D1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ATF5Q9Y2D1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ATF5Q9Y2D1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
ATF5Q9Y2D1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ATF5Q9Y2D1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
ATF5Q9Y2D1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
ATF5Q9Y2D1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ATF5Q9Y2D1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
ATF5Q9Y2D1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ATF5Q9Y2D1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ATF5Q9Y2D1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ATF5Q9Y2D1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ATF5Q9Y2D1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms