Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PADI3Q9ULW8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PADI3Q9ULW8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
PADI3Q9ULW8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PADI3Q9ULW8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PADI3Q9ULW8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PADI3Q9ULW8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PADI3Q9ULW8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
PADI3Q9ULW8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PADI3Q9ULW8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PADI3Q9ULW8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PADI3Q9ULW8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PADI3Q9ULW8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PADI3Q9ULW8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PADI3Q9ULW8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PADI3Q9ULW8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PADI3Q9ULW8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PADI3Q9ULW8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PADI3Q9ULW8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PADI3Q9ULW8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PADI3Q9ULW8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PADI3Q9ULW8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PADI3Q9ULW8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PADI3Q9ULW8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PADI3Q9ULW8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PADI3Q9ULW8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PADI3Q9ULW8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PADI3Q9ULW8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PADI3Q9ULW8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PADI3Q9ULW8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PADI3Q9ULW8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PADI3Q9ULW8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PADI3Q9ULW8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PADI3Q9ULW8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
PADI3Q9ULW8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.81■■■■□ 3
PADI3Q9ULW8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PADI3Q9ULW8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PADI3Q9ULW8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
PADI3Q9ULW8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.77■■■■□ 3
PADI3Q9ULW8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
PADI3Q9ULW8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PADI3Q9ULW8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PADI3Q9ULW8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PADI3Q9ULW8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PADI3Q9ULW8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PADI3Q9ULW8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PADI3Q9ULW8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PADI3Q9ULW8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PADI3Q9ULW8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PADI3Q9ULW8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PADI3Q9ULW8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PADI3Q9ULW8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PADI3Q9ULW8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PADI3Q9ULW8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PADI3Q9ULW8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
PADI3Q9ULW8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PADI3Q9ULW8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PADI3Q9ULW8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PADI3Q9ULW8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PADI3Q9ULW8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PADI3Q9ULW8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PADI3Q9ULW8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PADI3Q9ULW8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PADI3Q9ULW8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PADI3Q9ULW8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PADI3Q9ULW8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PADI3Q9ULW8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PADI3Q9ULW8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PADI3Q9ULW8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PADI3Q9ULW8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PADI3Q9ULW8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PADI3Q9ULW8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PADI3Q9ULW8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PADI3Q9ULW8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PADI3Q9ULW8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PADI3Q9ULW8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PADI3Q9ULW8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PADI3Q9ULW8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PADI3Q9ULW8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PADI3Q9ULW8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PADI3Q9ULW8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PADI3Q9ULW8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PADI3Q9ULW8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PADI3Q9ULW8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PADI3Q9ULW8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PADI3Q9ULW8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PADI3Q9ULW8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PADI3Q9ULW8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PADI3Q9ULW8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
PADI3Q9ULW8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PADI3Q9ULW8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PADI3Q9ULW8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PADI3Q9ULW8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PADI3Q9ULW8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PADI3Q9ULW8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PADI3Q9ULW8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PADI3Q9ULW8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PADI3Q9ULW8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PADI3Q9ULW8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PADI3Q9ULW8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms