Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI0

ATAD2B, ATPase family AAA domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2BQ9ULI0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC63.08■■■■■ 7.69
ATAD2BQ9ULI0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC63.01■■■■■ 7.68
ATAD2BQ9ULI0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC62.28■■■■■ 7.56
ATAD2BQ9ULI0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.65■■■■■ 7.46
ATAD2BQ9ULI0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.89■■■■■ 7.34
ATAD2BQ9ULI0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC60.3■■■■■ 7.24
ATAD2BQ9ULI0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC60.21■■■■■ 7.23
ATAD2BQ9ULI0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC60.12■■■■■ 7.21
ATAD2BQ9ULI0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC60.03■■■■■ 7.2
ATAD2BQ9ULI0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC59.87■■■■■ 7.17
ATAD2BQ9ULI0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.72■■■■■ 7.15
ATAD2BQ9ULI0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC59.71■■■■■ 7.15
ATAD2BQ9ULI0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC59.66■■■■■ 7.14
ATAD2BQ9ULI0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC59.65■■■■■ 7.14
ATAD2BQ9ULI0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.64■■■■■ 7.14
ATAD2BQ9ULI0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.26■■■■■ 7.08
ATAD2BQ9ULI0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC58.72■■■■■ 6.99
ATAD2BQ9ULI0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC58.66■■■■■ 6.98
ATAD2BQ9ULI0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC58.61■■■■■ 6.97
ATAD2BQ9ULI0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC58.35■■■■■ 6.93
ATAD2BQ9ULI0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.3■■■■■ 6.92
ATAD2BQ9ULI0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC58.3■■■■■ 6.92
ATAD2BQ9ULI0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.27■■■■■ 6.92
ATAD2BQ9ULI0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC58.15■■■■■ 6.9
ATAD2BQ9ULI0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.05■■■■■ 6.88
ATAD2BQ9ULI0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC57.9■■■■■ 6.86
ATAD2BQ9ULI0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC57.85■■■■■ 6.85
ATAD2BQ9ULI0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC57.78■■■■■ 6.84
ATAD2BQ9ULI0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC57.66■■■■■ 6.82
ATAD2BQ9ULI0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC57.58■■■■■ 6.81
ATAD2BQ9ULI0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC57.46■■■■■ 6.79
ATAD2BQ9ULI0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC57.2■■■■■ 6.75
ATAD2BQ9ULI0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.16■■■■■ 6.74
ATAD2BQ9ULI0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC57.07■■■■■ 6.73
ATAD2BQ9ULI0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC56.92■■■■■ 6.7
ATAD2BQ9ULI0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC56.91■■■■■ 6.7
ATAD2BQ9ULI0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC56.77■■■■■ 6.68
ATAD2BQ9ULI0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC56.65■■■■■ 6.66
ATAD2BQ9ULI0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC56.46■■■■■ 6.63
ATAD2BQ9ULI0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.39■■■■■ 6.62
ATAD2BQ9ULI0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC56.26■■■■■ 6.6
ATAD2BQ9ULI0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC56.04■■■■■ 6.56
ATAD2BQ9ULI0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC55.93■■■■■ 6.54
ATAD2BQ9ULI0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC55.88■■■■■ 6.54
ATAD2BQ9ULI0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC55.86■■■■■ 6.53
ATAD2BQ9ULI0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC55.84■■■■■ 6.53
ATAD2BQ9ULI0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC55.76■■■■■ 6.52
ATAD2BQ9ULI0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.57■■■■■ 6.49
ATAD2BQ9ULI0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC55.57■■■■■ 6.49
ATAD2BQ9ULI0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC55.57■■■■■ 6.49
ATAD2BQ9ULI0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC55.57■■■■■ 6.49
ATAD2BQ9ULI0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC55.56■■■■■ 6.49
ATAD2BQ9ULI0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC55.55■■■■■ 6.48
ATAD2BQ9ULI0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC55.52■■■■■ 6.48
ATAD2BQ9ULI0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC55.44■■■■■ 6.47
ATAD2BQ9ULI0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC55.43■■■■■ 6.46
ATAD2BQ9ULI0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.41■■■■■ 6.46
ATAD2BQ9ULI0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC55.41■■■■■ 6.46
ATAD2BQ9ULI0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC55.41■■■■■ 6.46
ATAD2BQ9ULI0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC55.18■■■■■ 6.42
ATAD2BQ9ULI0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.11■■■■■ 6.41
ATAD2BQ9ULI0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC55.08■■■■■ 6.41
ATAD2BQ9ULI0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.05■■■■■ 6.4
ATAD2BQ9ULI0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.05■■■■■ 6.4
ATAD2BQ9ULI0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.95■■■■■ 6.39
ATAD2BQ9ULI0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC54.9■■■■■ 6.38
ATAD2BQ9ULI0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC54.88■■■■■ 6.38
ATAD2BQ9ULI0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC54.84■■■■■ 6.37
ATAD2BQ9ULI0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC54.8■■■■■ 6.36
ATAD2BQ9ULI0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.76■■■■■ 6.36
ATAD2BQ9ULI0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.75■■■■■ 6.36
ATAD2BQ9ULI0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC54.67■■■■■ 6.34
ATAD2BQ9ULI0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC54.67■■■■■ 6.34
ATAD2BQ9ULI0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.61■■■■■ 6.33
ATAD2BQ9ULI0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC54.61■■■■■ 6.33
ATAD2BQ9ULI0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC54.56■■■■■ 6.32
ATAD2BQ9ULI0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC54.53■■■■■ 6.32
ATAD2BQ9ULI0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.53■■■■■ 6.32
ATAD2BQ9ULI0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.48■■■■■ 6.31
ATAD2BQ9ULI0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC54.43■■■■■ 6.3
ATAD2BQ9ULI0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.4■■■■■ 6.3
ATAD2BQ9ULI0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC54.39■■■■■ 6.3
ATAD2BQ9ULI0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.38■■■■■ 6.3
ATAD2BQ9ULI0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC54.28■■■■■ 6.28
ATAD2BQ9ULI0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC54.27■■■■■ 6.28
ATAD2BQ9ULI0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC54.22■■■■■ 6.27
ATAD2BQ9ULI0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC54.21■■■■■ 6.27
ATAD2BQ9ULI0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC54.2■■■■■ 6.27
ATAD2BQ9ULI0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC54.19■■■■■ 6.27
ATAD2BQ9ULI0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.19■■■■■ 6.26
ATAD2BQ9ULI0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC54.18■■■■■ 6.26
ATAD2BQ9ULI0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC54.1■■■■■ 6.25
ATAD2BQ9ULI0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC54.1■■■■■ 6.25
ATAD2BQ9ULI0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.09■■■■■ 6.25
ATAD2BQ9ULI0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.09■■■■■ 6.25
ATAD2BQ9ULI0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC54.07■■■■■ 6.25
ATAD2BQ9ULI0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC54.05■■■■■ 6.24
ATAD2BQ9ULI0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC54.05■■■■■ 6.24
ATAD2BQ9ULI0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC53.99■■■■■ 6.23
ATAD2BQ9ULI0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC53.96■■■■■ 6.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms