Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PADI1Q9ULC6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PADI1Q9ULC6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PADI1Q9ULC6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PADI1Q9ULC6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PADI1Q9ULC6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PADI1Q9ULC6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PADI1Q9ULC6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
PADI1Q9ULC6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PADI1Q9ULC6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PADI1Q9ULC6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PADI1Q9ULC6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PADI1Q9ULC6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PADI1Q9ULC6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PADI1Q9ULC6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PADI1Q9ULC6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PADI1Q9ULC6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PADI1Q9ULC6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PADI1Q9ULC6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PADI1Q9ULC6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PADI1Q9ULC6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PADI1Q9ULC6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PADI1Q9ULC6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PADI1Q9ULC6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PADI1Q9ULC6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PADI1Q9ULC6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PADI1Q9ULC6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PADI1Q9ULC6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PADI1Q9ULC6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PADI1Q9ULC6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PADI1Q9ULC6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PADI1Q9ULC6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PADI1Q9ULC6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PADI1Q9ULC6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PADI1Q9ULC6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PADI1Q9ULC6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PADI1Q9ULC6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PADI1Q9ULC6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PADI1Q9ULC6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PADI1Q9ULC6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PADI1Q9ULC6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PADI1Q9ULC6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PADI1Q9ULC6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PADI1Q9ULC6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PADI1Q9ULC6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PADI1Q9ULC6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PADI1Q9ULC6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PADI1Q9ULC6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PADI1Q9ULC6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PADI1Q9ULC6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PADI1Q9ULC6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PADI1Q9ULC6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PADI1Q9ULC6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PADI1Q9ULC6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PADI1Q9ULC6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PADI1Q9ULC6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PADI1Q9ULC6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PADI1Q9ULC6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PADI1Q9ULC6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PADI1Q9ULC6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PADI1Q9ULC6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PADI1Q9ULC6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PADI1Q9ULC6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PADI1Q9ULC6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PADI1Q9ULC6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PADI1Q9ULC6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PADI1Q9ULC6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PADI1Q9ULC6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PADI1Q9ULC6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PADI1Q9ULC6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PADI1Q9ULC6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PADI1Q9ULC6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PADI1Q9ULC6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PADI1Q9ULC6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PADI1Q9ULC6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PADI1Q9ULC6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PADI1Q9ULC6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PADI1Q9ULC6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PADI1Q9ULC6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PADI1Q9ULC6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PADI1Q9ULC6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PADI1Q9ULC6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PADI1Q9ULC6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PADI1Q9ULC6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PADI1Q9ULC6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PADI1Q9ULC6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PADI1Q9ULC6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PADI1Q9ULC6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PADI1Q9ULC6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PADI1Q9ULC6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PADI1Q9ULC6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PADI1Q9ULC6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PADI1Q9ULC6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PADI1Q9ULC6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PADI1Q9ULC6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PADI1Q9ULC6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PADI1Q9ULC6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PADI1Q9ULC6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PADI1Q9ULC6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PADI1Q9ULC6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms