Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XCL2Q9UBD3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XCL2Q9UBD3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
XCL2Q9UBD3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XCL2Q9UBD3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XCL2Q9UBD3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XCL2Q9UBD3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XCL2Q9UBD3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XCL2Q9UBD3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XCL2Q9UBD3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XCL2Q9UBD3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XCL2Q9UBD3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XCL2Q9UBD3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XCL2Q9UBD3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XCL2Q9UBD3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XCL2Q9UBD3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XCL2Q9UBD3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XCL2Q9UBD3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XCL2Q9UBD3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XCL2Q9UBD3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XCL2Q9UBD3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XCL2Q9UBD3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XCL2Q9UBD3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XCL2Q9UBD3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
XCL2Q9UBD3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XCL2Q9UBD3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XCL2Q9UBD3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XCL2Q9UBD3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XCL2Q9UBD3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XCL2Q9UBD3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XCL2Q9UBD3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XCL2Q9UBD3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XCL2Q9UBD3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XCL2Q9UBD3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XCL2Q9UBD3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XCL2Q9UBD3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XCL2Q9UBD3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XCL2Q9UBD3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XCL2Q9UBD3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XCL2Q9UBD3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XCL2Q9UBD3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XCL2Q9UBD3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XCL2Q9UBD3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XCL2Q9UBD3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XCL2Q9UBD3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XCL2Q9UBD3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XCL2Q9UBD3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XCL2Q9UBD3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XCL2Q9UBD3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XCL2Q9UBD3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XCL2Q9UBD3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XCL2Q9UBD3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
XCL2Q9UBD3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XCL2Q9UBD3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XCL2Q9UBD3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XCL2Q9UBD3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
XCL2Q9UBD3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XCL2Q9UBD3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XCL2Q9UBD3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XCL2Q9UBD3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XCL2Q9UBD3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XCL2Q9UBD3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XCL2Q9UBD3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XCL2Q9UBD3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XCL2Q9UBD3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XCL2Q9UBD3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
XCL2Q9UBD3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XCL2Q9UBD3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XCL2Q9UBD3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XCL2Q9UBD3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XCL2Q9UBD3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XCL2Q9UBD3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XCL2Q9UBD3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XCL2Q9UBD3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XCL2Q9UBD3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XCL2Q9UBD3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XCL2Q9UBD3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XCL2Q9UBD3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XCL2Q9UBD3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
XCL2Q9UBD3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XCL2Q9UBD3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XCL2Q9UBD3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XCL2Q9UBD3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XCL2Q9UBD3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XCL2Q9UBD3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XCL2Q9UBD3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
XCL2Q9UBD3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XCL2Q9UBD3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XCL2Q9UBD3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XCL2Q9UBD3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
XCL2Q9UBD3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
XCL2Q9UBD3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XCL2Q9UBD3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
XCL2Q9UBD3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
XCL2Q9UBD3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XCL2Q9UBD3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XCL2Q9UBD3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XCL2Q9UBD3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XCL2Q9UBD3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XCL2Q9UBD3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms