Protein–RNA interactions for Protein: Q9P217

ZSWIM5, Zinc finger SWIM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM5Q9P217 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.46■■■■■ 4.07
ZSWIM5Q9P217 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
ZSWIM5Q9P217 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
ZSWIM5Q9P217 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
ZSWIM5Q9P217 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
ZSWIM5Q9P217 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
ZSWIM5Q9P217 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.8
ZSWIM5Q9P217 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
ZSWIM5Q9P217 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
ZSWIM5Q9P217 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
ZSWIM5Q9P217 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
ZSWIM5Q9P217 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
ZSWIM5Q9P217 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
ZSWIM5Q9P217 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ZSWIM5Q9P217 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ZSWIM5Q9P217 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
ZSWIM5Q9P217 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ZSWIM5Q9P217 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
ZSWIM5Q9P217 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ZSWIM5Q9P217 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
ZSWIM5Q9P217 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
ZSWIM5Q9P217 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ZSWIM5Q9P217 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
ZSWIM5Q9P217 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ZSWIM5Q9P217 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ZSWIM5Q9P217 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ZSWIM5Q9P217 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
ZSWIM5Q9P217 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ZSWIM5Q9P217 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ZSWIM5Q9P217 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ZSWIM5Q9P217 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ZSWIM5Q9P217 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ZSWIM5Q9P217 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ZSWIM5Q9P217 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ZSWIM5Q9P217 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ZSWIM5Q9P217 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ZSWIM5Q9P217 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ZSWIM5Q9P217 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ZSWIM5Q9P217 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ZSWIM5Q9P217 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ZSWIM5Q9P217 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ZSWIM5Q9P217 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ZSWIM5Q9P217 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ZSWIM5Q9P217 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ZSWIM5Q9P217 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ZSWIM5Q9P217 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ZSWIM5Q9P217 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ZSWIM5Q9P217 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ZSWIM5Q9P217 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
ZSWIM5Q9P217 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ZSWIM5Q9P217 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ZSWIM5Q9P217 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ZSWIM5Q9P217 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ZSWIM5Q9P217 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ZSWIM5Q9P217 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ZSWIM5Q9P217 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ZSWIM5Q9P217 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ZSWIM5Q9P217 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ZSWIM5Q9P217 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ZSWIM5Q9P217 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ZSWIM5Q9P217 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ZSWIM5Q9P217 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ZSWIM5Q9P217 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
ZSWIM5Q9P217 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ZSWIM5Q9P217 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ZSWIM5Q9P217 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ZSWIM5Q9P217 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ZSWIM5Q9P217 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ZSWIM5Q9P217 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ZSWIM5Q9P217 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ZSWIM5Q9P217 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
ZSWIM5Q9P217 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ZSWIM5Q9P217 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ZSWIM5Q9P217 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
ZSWIM5Q9P217 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ZSWIM5Q9P217 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ZSWIM5Q9P217 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ZSWIM5Q9P217 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ZSWIM5Q9P217 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ZSWIM5Q9P217 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ZSWIM5Q9P217 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ZSWIM5Q9P217 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ZSWIM5Q9P217 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ZSWIM5Q9P217 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ZSWIM5Q9P217 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ZSWIM5Q9P217 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ZSWIM5Q9P217 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ZSWIM5Q9P217 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ZSWIM5Q9P217 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ZSWIM5Q9P217 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ZSWIM5Q9P217 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ZSWIM5Q9P217 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ZSWIM5Q9P217 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ZSWIM5Q9P217 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZSWIM5Q9P217 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZSWIM5Q9P217 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZSWIM5Q9P217 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZSWIM5Q9P217 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZSWIM5Q9P217 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZSWIM5Q9P217 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms