Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC41.97■■■■■ 4.31
HMG20BQ9P0W2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
HMG20BQ9P0W2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
HMG20BQ9P0W2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC40.69■■■■■ 4.1
HMG20BQ9P0W2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
HMG20BQ9P0W2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
HMG20BQ9P0W2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
HMG20BQ9P0W2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.97■■■■□ 3.99
HMG20BQ9P0W2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
HMG20BQ9P0W2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
HMG20BQ9P0W2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
HMG20BQ9P0W2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
HMG20BQ9P0W2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
HMG20BQ9P0W2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
HMG20BQ9P0W2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
HMG20BQ9P0W2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
HMG20BQ9P0W2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
HMG20BQ9P0W2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
HMG20BQ9P0W2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
HMG20BQ9P0W2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
HMG20BQ9P0W2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
HMG20BQ9P0W2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
HMG20BQ9P0W2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
HMG20BQ9P0W2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
HMG20BQ9P0W2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
HMG20BQ9P0W2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
HMG20BQ9P0W2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
HMG20BQ9P0W2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
HMG20BQ9P0W2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.79■■■■□ 3.64
HMG20BQ9P0W2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
HMG20BQ9P0W2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
HMG20BQ9P0W2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
HMG20BQ9P0W2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
HMG20BQ9P0W2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
HMG20BQ9P0W2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
HMG20BQ9P0W2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
HMG20BQ9P0W2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.58
HMG20BQ9P0W2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
HMG20BQ9P0W2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
HMG20BQ9P0W2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
HMG20BQ9P0W2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
HMG20BQ9P0W2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
HMG20BQ9P0W2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
HMG20BQ9P0W2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
HMG20BQ9P0W2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
HMG20BQ9P0W2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
HMG20BQ9P0W2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
HMG20BQ9P0W2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
HMG20BQ9P0W2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
HMG20BQ9P0W2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
HMG20BQ9P0W2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
HMG20BQ9P0W2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
HMG20BQ9P0W2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
HMG20BQ9P0W2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
HMG20BQ9P0W2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
HMG20BQ9P0W2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
HMG20BQ9P0W2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
HMG20BQ9P0W2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
HMG20BQ9P0W2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
HMG20BQ9P0W2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
HMG20BQ9P0W2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
HMG20BQ9P0W2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
HMG20BQ9P0W2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
HMG20BQ9P0W2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
HMG20BQ9P0W2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
HMG20BQ9P0W2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
HMG20BQ9P0W2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
HMG20BQ9P0W2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
HMG20BQ9P0W2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
HMG20BQ9P0W2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
HMG20BQ9P0W2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
HMG20BQ9P0W2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
HMG20BQ9P0W2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
HMG20BQ9P0W2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
HMG20BQ9P0W2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
HMG20BQ9P0W2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
HMG20BQ9P0W2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
HMG20BQ9P0W2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
HMG20BQ9P0W2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
HMG20BQ9P0W2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
HMG20BQ9P0W2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
HMG20BQ9P0W2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
HMG20BQ9P0W2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
HMG20BQ9P0W2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
HMG20BQ9P0W2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
HMG20BQ9P0W2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
HMG20BQ9P0W2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
HMG20BQ9P0W2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
HMG20BQ9P0W2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
HMG20BQ9P0W2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
HMG20BQ9P0W2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
HMG20BQ9P0W2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
HMG20BQ9P0W2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
HMG20BQ9P0W2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
HMG20BQ9P0W2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
HMG20BQ9P0W2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
HMG20BQ9P0W2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
HMG20BQ9P0W2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
HMG20BQ9P0W2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
HMG20BQ9P0W2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.5 ms