Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.42■■■■■ 4.06
TMOD4Q9NZQ9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.79■■■■□ 3.96
TMOD4Q9NZQ9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
TMOD4Q9NZQ9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
TMOD4Q9NZQ9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
TMOD4Q9NZQ9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
TMOD4Q9NZQ9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
TMOD4Q9NZQ9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
TMOD4Q9NZQ9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
TMOD4Q9NZQ9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TMOD4Q9NZQ9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
TMOD4Q9NZQ9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TMOD4Q9NZQ9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
TMOD4Q9NZQ9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
TMOD4Q9NZQ9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TMOD4Q9NZQ9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TMOD4Q9NZQ9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
TMOD4Q9NZQ9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
TMOD4Q9NZQ9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TMOD4Q9NZQ9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TMOD4Q9NZQ9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
TMOD4Q9NZQ9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TMOD4Q9NZQ9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
TMOD4Q9NZQ9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
TMOD4Q9NZQ9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
TMOD4Q9NZQ9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TMOD4Q9NZQ9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
TMOD4Q9NZQ9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
TMOD4Q9NZQ9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
TMOD4Q9NZQ9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TMOD4Q9NZQ9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TMOD4Q9NZQ9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TMOD4Q9NZQ9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TMOD4Q9NZQ9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TMOD4Q9NZQ9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
TMOD4Q9NZQ9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
TMOD4Q9NZQ9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
TMOD4Q9NZQ9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TMOD4Q9NZQ9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TMOD4Q9NZQ9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TMOD4Q9NZQ9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TMOD4Q9NZQ9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TMOD4Q9NZQ9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TMOD4Q9NZQ9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TMOD4Q9NZQ9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TMOD4Q9NZQ9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TMOD4Q9NZQ9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TMOD4Q9NZQ9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TMOD4Q9NZQ9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TMOD4Q9NZQ9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TMOD4Q9NZQ9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
TMOD4Q9NZQ9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TMOD4Q9NZQ9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TMOD4Q9NZQ9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TMOD4Q9NZQ9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TMOD4Q9NZQ9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TMOD4Q9NZQ9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TMOD4Q9NZQ9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TMOD4Q9NZQ9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TMOD4Q9NZQ9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TMOD4Q9NZQ9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TMOD4Q9NZQ9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TMOD4Q9NZQ9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TMOD4Q9NZQ9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TMOD4Q9NZQ9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TMOD4Q9NZQ9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TMOD4Q9NZQ9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TMOD4Q9NZQ9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
TMOD4Q9NZQ9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TMOD4Q9NZQ9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TMOD4Q9NZQ9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TMOD4Q9NZQ9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TMOD4Q9NZQ9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TMOD4Q9NZQ9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TMOD4Q9NZQ9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TMOD4Q9NZQ9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TMOD4Q9NZQ9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TMOD4Q9NZQ9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TMOD4Q9NZQ9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TMOD4Q9NZQ9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TMOD4Q9NZQ9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TMOD4Q9NZQ9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TMOD4Q9NZQ9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TMOD4Q9NZQ9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
TMOD4Q9NZQ9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
TMOD4Q9NZQ9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TMOD4Q9NZQ9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
TMOD4Q9NZQ9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TMOD4Q9NZQ9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TMOD4Q9NZQ9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TMOD4Q9NZQ9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TMOD4Q9NZQ9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TMOD4Q9NZQ9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TMOD4Q9NZQ9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TMOD4Q9NZQ9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TMOD4Q9NZQ9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TMOD4Q9NZQ9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TMOD4Q9NZQ9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TMOD4Q9NZQ9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TMOD4Q9NZQ9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms