Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC43.3■■■■■ 4.52
C9orf78Q9NZ63 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
C9orf78Q9NZ63 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
C9orf78Q9NZ63 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
C9orf78Q9NZ63 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
C9orf78Q9NZ63 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
C9orf78Q9NZ63 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC41.85■■■■■ 4.29
C9orf78Q9NZ63 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
C9orf78Q9NZ63 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
C9orf78Q9NZ63 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
C9orf78Q9NZ63 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
C9orf78Q9NZ63 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
C9orf78Q9NZ63 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
C9orf78Q9NZ63 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
C9orf78Q9NZ63 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
C9orf78Q9NZ63 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.02
C9orf78Q9NZ63 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
C9orf78Q9NZ63 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
C9orf78Q9NZ63 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
C9orf78Q9NZ63 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC39.95■■■■□ 3.99
C9orf78Q9NZ63 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
C9orf78Q9NZ63 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
C9orf78Q9NZ63 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
C9orf78Q9NZ63 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
C9orf78Q9NZ63 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
C9orf78Q9NZ63 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
C9orf78Q9NZ63 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
C9orf78Q9NZ63 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
C9orf78Q9NZ63 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
C9orf78Q9NZ63 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
C9orf78Q9NZ63 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
C9orf78Q9NZ63 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
C9orf78Q9NZ63 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
C9orf78Q9NZ63 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
C9orf78Q9NZ63 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
C9orf78Q9NZ63 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
C9orf78Q9NZ63 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
C9orf78Q9NZ63 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
C9orf78Q9NZ63 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
C9orf78Q9NZ63 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
C9orf78Q9NZ63 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
C9orf78Q9NZ63 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
C9orf78Q9NZ63 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
C9orf78Q9NZ63 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.24■■■■□ 3.71
C9orf78Q9NZ63 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
C9orf78Q9NZ63 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
C9orf78Q9NZ63 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
C9orf78Q9NZ63 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
C9orf78Q9NZ63 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
C9orf78Q9NZ63 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
C9orf78Q9NZ63 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
C9orf78Q9NZ63 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
C9orf78Q9NZ63 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
C9orf78Q9NZ63 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
C9orf78Q9NZ63 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
C9orf78Q9NZ63 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
C9orf78Q9NZ63 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
C9orf78Q9NZ63 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
C9orf78Q9NZ63 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
C9orf78Q9NZ63 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
C9orf78Q9NZ63 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
C9orf78Q9NZ63 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
C9orf78Q9NZ63 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
C9orf78Q9NZ63 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
C9orf78Q9NZ63 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
C9orf78Q9NZ63 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
C9orf78Q9NZ63 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
C9orf78Q9NZ63 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
C9orf78Q9NZ63 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
C9orf78Q9NZ63 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
C9orf78Q9NZ63 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
C9orf78Q9NZ63 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
C9orf78Q9NZ63 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
C9orf78Q9NZ63 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
C9orf78Q9NZ63 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
C9orf78Q9NZ63 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
C9orf78Q9NZ63 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
C9orf78Q9NZ63 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
C9orf78Q9NZ63 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
C9orf78Q9NZ63 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
C9orf78Q9NZ63 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
C9orf78Q9NZ63 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
C9orf78Q9NZ63 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
C9orf78Q9NZ63 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
C9orf78Q9NZ63 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
C9orf78Q9NZ63 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
C9orf78Q9NZ63 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
C9orf78Q9NZ63 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
C9orf78Q9NZ63 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
C9orf78Q9NZ63 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
C9orf78Q9NZ63 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
C9orf78Q9NZ63 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
C9orf78Q9NZ63 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
C9orf78Q9NZ63 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
C9orf78Q9NZ63 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
C9orf78Q9NZ63 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
C9orf78Q9NZ63 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
C9orf78Q9NZ63 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
C9orf78Q9NZ63 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
C9orf78Q9NZ63 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
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