Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC43.57■■■■■ 4.56
PPP4R2Q9NY27 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
PPP4R2Q9NY27 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
PPP4R2Q9NY27 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
PPP4R2Q9NY27 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
PPP4R2Q9NY27 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC42.06■■■■■ 4.32
PPP4R2Q9NY27 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
PPP4R2Q9NY27 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
PPP4R2Q9NY27 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC41.76■■■■■ 4.28
PPP4R2Q9NY27 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
PPP4R2Q9NY27 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC41.49■■■■■ 4.23
PPP4R2Q9NY27 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
PPP4R2Q9NY27 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
PPP4R2Q9NY27 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
PPP4R2Q9NY27 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
PPP4R2Q9NY27 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
PPP4R2Q9NY27 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
PPP4R2Q9NY27 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.15
PPP4R2Q9NY27 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
PPP4R2Q9NY27 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
PPP4R2Q9NY27 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
PPP4R2Q9NY27 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
PPP4R2Q9NY27 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
PPP4R2Q9NY27 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
PPP4R2Q9NY27 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
PPP4R2Q9NY27 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
PPP4R2Q9NY27 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
PPP4R2Q9NY27 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
PPP4R2Q9NY27 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
PPP4R2Q9NY27 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
PPP4R2Q9NY27 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
PPP4R2Q9NY27 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
PPP4R2Q9NY27 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
PPP4R2Q9NY27 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
PPP4R2Q9NY27 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
PPP4R2Q9NY27 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
PPP4R2Q9NY27 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
PPP4R2Q9NY27 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
PPP4R2Q9NY27 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
PPP4R2Q9NY27 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
PPP4R2Q9NY27 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
PPP4R2Q9NY27 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
PPP4R2Q9NY27 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
PPP4R2Q9NY27 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
PPP4R2Q9NY27 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PPP4R2Q9NY27 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
PPP4R2Q9NY27 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
PPP4R2Q9NY27 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
PPP4R2Q9NY27 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PPP4R2Q9NY27 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
PPP4R2Q9NY27 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
PPP4R2Q9NY27 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC38.35■■■■□ 3.73
PPP4R2Q9NY27 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
PPP4R2Q9NY27 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
PPP4R2Q9NY27 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PPP4R2Q9NY27 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
PPP4R2Q9NY27 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
PPP4R2Q9NY27 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
PPP4R2Q9NY27 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.71
PPP4R2Q9NY27 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PPP4R2Q9NY27 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PPP4R2Q9NY27 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PPP4R2Q9NY27 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PPP4R2Q9NY27 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PPP4R2Q9NY27 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PPP4R2Q9NY27 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
PPP4R2Q9NY27 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
PPP4R2Q9NY27 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PPP4R2Q9NY27 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PPP4R2Q9NY27 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PPP4R2Q9NY27 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PPP4R2Q9NY27 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PPP4R2Q9NY27 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PPP4R2Q9NY27 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
PPP4R2Q9NY27 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PPP4R2Q9NY27 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
PPP4R2Q9NY27 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PPP4R2Q9NY27 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
PPP4R2Q9NY27 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
PPP4R2Q9NY27 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PPP4R2Q9NY27 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PPP4R2Q9NY27 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PPP4R2Q9NY27 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PPP4R2Q9NY27 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PPP4R2Q9NY27 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PPP4R2Q9NY27 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PPP4R2Q9NY27 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PPP4R2Q9NY27 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
PPP4R2Q9NY27 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PPP4R2Q9NY27 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PPP4R2Q9NY27 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PPP4R2Q9NY27 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PPP4R2Q9NY27 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
PPP4R2Q9NY27 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PPP4R2Q9NY27 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PPP4R2Q9NY27 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PPP4R2Q9NY27 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PPP4R2Q9NY27 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PPP4R2Q9NY27 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PPP4R2Q9NY27 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms