Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.45■■■■■ 4.07
EMILIN3Q9NT22 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.7■■■■□ 3.95
EMILIN3Q9NT22 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
EMILIN3Q9NT22 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
EMILIN3Q9NT22 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
EMILIN3Q9NT22 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
EMILIN3Q9NT22 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
EMILIN3Q9NT22 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
EMILIN3Q9NT22 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
EMILIN3Q9NT22 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
EMILIN3Q9NT22 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
EMILIN3Q9NT22 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
EMILIN3Q9NT22 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
EMILIN3Q9NT22 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
EMILIN3Q9NT22 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
EMILIN3Q9NT22 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
EMILIN3Q9NT22 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
EMILIN3Q9NT22 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
EMILIN3Q9NT22 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
EMILIN3Q9NT22 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
EMILIN3Q9NT22 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
EMILIN3Q9NT22 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
EMILIN3Q9NT22 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
EMILIN3Q9NT22 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
EMILIN3Q9NT22 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
EMILIN3Q9NT22 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
EMILIN3Q9NT22 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
EMILIN3Q9NT22 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
EMILIN3Q9NT22 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
EMILIN3Q9NT22 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
EMILIN3Q9NT22 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
EMILIN3Q9NT22 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
EMILIN3Q9NT22 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
EMILIN3Q9NT22 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
EMILIN3Q9NT22 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
EMILIN3Q9NT22 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
EMILIN3Q9NT22 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
EMILIN3Q9NT22 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
EMILIN3Q9NT22 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
EMILIN3Q9NT22 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
EMILIN3Q9NT22 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
EMILIN3Q9NT22 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
EMILIN3Q9NT22 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
EMILIN3Q9NT22 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
EMILIN3Q9NT22 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
EMILIN3Q9NT22 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
EMILIN3Q9NT22 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
EMILIN3Q9NT22 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
EMILIN3Q9NT22 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
EMILIN3Q9NT22 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
EMILIN3Q9NT22 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
EMILIN3Q9NT22 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
EMILIN3Q9NT22 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
EMILIN3Q9NT22 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
EMILIN3Q9NT22 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
EMILIN3Q9NT22 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
EMILIN3Q9NT22 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
EMILIN3Q9NT22 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
EMILIN3Q9NT22 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
EMILIN3Q9NT22 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
EMILIN3Q9NT22 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
EMILIN3Q9NT22 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
EMILIN3Q9NT22 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
EMILIN3Q9NT22 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
EMILIN3Q9NT22 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
EMILIN3Q9NT22 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
EMILIN3Q9NT22 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
EMILIN3Q9NT22 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
EMILIN3Q9NT22 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
EMILIN3Q9NT22 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
EMILIN3Q9NT22 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
EMILIN3Q9NT22 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
EMILIN3Q9NT22 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
EMILIN3Q9NT22 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
EMILIN3Q9NT22 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
EMILIN3Q9NT22 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
EMILIN3Q9NT22 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
EMILIN3Q9NT22 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
EMILIN3Q9NT22 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
EMILIN3Q9NT22 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
EMILIN3Q9NT22 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
EMILIN3Q9NT22 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
EMILIN3Q9NT22 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
EMILIN3Q9NT22 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
EMILIN3Q9NT22 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
EMILIN3Q9NT22 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
EMILIN3Q9NT22 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
EMILIN3Q9NT22 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
EMILIN3Q9NT22 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
EMILIN3Q9NT22 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
EMILIN3Q9NT22 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
EMILIN3Q9NT22 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
EMILIN3Q9NT22 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
EMILIN3Q9NT22 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
EMILIN3Q9NT22 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
EMILIN3Q9NT22 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
EMILIN3Q9NT22 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
EMILIN3Q9NT22 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
EMILIN3Q9NT22 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
EMILIN3Q9NT22 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms