Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CYLDQ9NQC7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CYLDQ9NQC7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
CYLDQ9NQC7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CYLDQ9NQC7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CYLDQ9NQC7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CYLDQ9NQC7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CYLDQ9NQC7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CYLDQ9NQC7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CYLDQ9NQC7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CYLDQ9NQC7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CYLDQ9NQC7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CYLDQ9NQC7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CYLDQ9NQC7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CYLDQ9NQC7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CYLDQ9NQC7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CYLDQ9NQC7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CYLDQ9NQC7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CYLDQ9NQC7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CYLDQ9NQC7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CYLDQ9NQC7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CYLDQ9NQC7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
CYLDQ9NQC7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CYLDQ9NQC7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CYLDQ9NQC7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CYLDQ9NQC7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CYLDQ9NQC7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CYLDQ9NQC7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CYLDQ9NQC7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CYLDQ9NQC7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CYLDQ9NQC7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CYLDQ9NQC7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CYLDQ9NQC7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CYLDQ9NQC7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CYLDQ9NQC7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CYLDQ9NQC7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CYLDQ9NQC7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CYLDQ9NQC7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CYLDQ9NQC7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CYLDQ9NQC7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CYLDQ9NQC7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CYLDQ9NQC7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CYLDQ9NQC7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CYLDQ9NQC7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CYLDQ9NQC7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CYLDQ9NQC7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CYLDQ9NQC7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CYLDQ9NQC7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CYLDQ9NQC7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CYLDQ9NQC7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CYLDQ9NQC7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CYLDQ9NQC7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
CYLDQ9NQC7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CYLDQ9NQC7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CYLDQ9NQC7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CYLDQ9NQC7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CYLDQ9NQC7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CYLDQ9NQC7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CYLDQ9NQC7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CYLDQ9NQC7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CYLDQ9NQC7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
CYLDQ9NQC7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CYLDQ9NQC7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CYLDQ9NQC7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CYLDQ9NQC7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CYLDQ9NQC7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
CYLDQ9NQC7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CYLDQ9NQC7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CYLDQ9NQC7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CYLDQ9NQC7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CYLDQ9NQC7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CYLDQ9NQC7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CYLDQ9NQC7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CYLDQ9NQC7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CYLDQ9NQC7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CYLDQ9NQC7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CYLDQ9NQC7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CYLDQ9NQC7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CYLDQ9NQC7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CYLDQ9NQC7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CYLDQ9NQC7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CYLDQ9NQC7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CYLDQ9NQC7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CYLDQ9NQC7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CYLDQ9NQC7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CYLDQ9NQC7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CYLDQ9NQC7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CYLDQ9NQC7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CYLDQ9NQC7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CYLDQ9NQC7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CYLDQ9NQC7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CYLDQ9NQC7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CYLDQ9NQC7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CYLDQ9NQC7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CYLDQ9NQC7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CYLDQ9NQC7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
CYLDQ9NQC7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CYLDQ9NQC7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CYLDQ9NQC7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CYLDQ9NQC7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
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