Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SCUBE2Q9NQ36 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SCUBE2Q9NQ36 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
SCUBE2Q9NQ36 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SCUBE2Q9NQ36 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SCUBE2Q9NQ36 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SCUBE2Q9NQ36 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SCUBE2Q9NQ36 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SCUBE2Q9NQ36 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SCUBE2Q9NQ36 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SCUBE2Q9NQ36 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SCUBE2Q9NQ36 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SCUBE2Q9NQ36 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCUBE2Q9NQ36 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCUBE2Q9NQ36 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SCUBE2Q9NQ36 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SCUBE2Q9NQ36 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SCUBE2Q9NQ36 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SCUBE2Q9NQ36 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SCUBE2Q9NQ36 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SCUBE2Q9NQ36 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SCUBE2Q9NQ36 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SCUBE2Q9NQ36 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SCUBE2Q9NQ36 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SCUBE2Q9NQ36 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SCUBE2Q9NQ36 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SCUBE2Q9NQ36 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SCUBE2Q9NQ36 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SCUBE2Q9NQ36 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SCUBE2Q9NQ36 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SCUBE2Q9NQ36 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SCUBE2Q9NQ36 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SCUBE2Q9NQ36 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SCUBE2Q9NQ36 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCUBE2Q9NQ36 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SCUBE2Q9NQ36 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SCUBE2Q9NQ36 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SCUBE2Q9NQ36 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SCUBE2Q9NQ36 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SCUBE2Q9NQ36 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SCUBE2Q9NQ36 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SCUBE2Q9NQ36 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SCUBE2Q9NQ36 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SCUBE2Q9NQ36 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SCUBE2Q9NQ36 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SCUBE2Q9NQ36 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SCUBE2Q9NQ36 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SCUBE2Q9NQ36 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SCUBE2Q9NQ36 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SCUBE2Q9NQ36 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SCUBE2Q9NQ36 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SCUBE2Q9NQ36 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCUBE2Q9NQ36 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCUBE2Q9NQ36 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SCUBE2Q9NQ36 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SCUBE2Q9NQ36 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SCUBE2Q9NQ36 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCUBE2Q9NQ36 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SCUBE2Q9NQ36 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCUBE2Q9NQ36 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SCUBE2Q9NQ36 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
SCUBE2Q9NQ36 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SCUBE2Q9NQ36 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCUBE2Q9NQ36 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SCUBE2Q9NQ36 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SCUBE2Q9NQ36 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SCUBE2Q9NQ36 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SCUBE2Q9NQ36 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCUBE2Q9NQ36 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SCUBE2Q9NQ36 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCUBE2Q9NQ36 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCUBE2Q9NQ36 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCUBE2Q9NQ36 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCUBE2Q9NQ36 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCUBE2Q9NQ36 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCUBE2Q9NQ36 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCUBE2Q9NQ36 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCUBE2Q9NQ36 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCUBE2Q9NQ36 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCUBE2Q9NQ36 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCUBE2Q9NQ36 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCUBE2Q9NQ36 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SCUBE2Q9NQ36 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCUBE2Q9NQ36 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCUBE2Q9NQ36 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCUBE2Q9NQ36 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCUBE2Q9NQ36 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCUBE2Q9NQ36 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCUBE2Q9NQ36 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCUBE2Q9NQ36 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCUBE2Q9NQ36 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCUBE2Q9NQ36 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCUBE2Q9NQ36 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCUBE2Q9NQ36 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SCUBE2Q9NQ36 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SCUBE2Q9NQ36 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCUBE2Q9NQ36 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCUBE2Q9NQ36 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCUBE2Q9NQ36 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCUBE2Q9NQ36 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms