Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CLMPQ9H6B4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CLMPQ9H6B4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CLMPQ9H6B4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CLMPQ9H6B4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
CLMPQ9H6B4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CLMPQ9H6B4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CLMPQ9H6B4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CLMPQ9H6B4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CLMPQ9H6B4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CLMPQ9H6B4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CLMPQ9H6B4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CLMPQ9H6B4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CLMPQ9H6B4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CLMPQ9H6B4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CLMPQ9H6B4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CLMPQ9H6B4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CLMPQ9H6B4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CLMPQ9H6B4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLMPQ9H6B4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLMPQ9H6B4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CLMPQ9H6B4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLMPQ9H6B4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLMPQ9H6B4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLMPQ9H6B4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLMPQ9H6B4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLMPQ9H6B4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLMPQ9H6B4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLMPQ9H6B4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLMPQ9H6B4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLMPQ9H6B4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLMPQ9H6B4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLMPQ9H6B4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLMPQ9H6B4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLMPQ9H6B4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLMPQ9H6B4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLMPQ9H6B4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLMPQ9H6B4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CLMPQ9H6B4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CLMPQ9H6B4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLMPQ9H6B4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLMPQ9H6B4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLMPQ9H6B4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLMPQ9H6B4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLMPQ9H6B4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLMPQ9H6B4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLMPQ9H6B4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CLMPQ9H6B4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLMPQ9H6B4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLMPQ9H6B4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLMPQ9H6B4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLMPQ9H6B4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLMPQ9H6B4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CLMPQ9H6B4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLMPQ9H6B4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLMPQ9H6B4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLMPQ9H6B4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CLMPQ9H6B4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLMPQ9H6B4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLMPQ9H6B4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLMPQ9H6B4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLMPQ9H6B4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLMPQ9H6B4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLMPQ9H6B4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLMPQ9H6B4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLMPQ9H6B4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLMPQ9H6B4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLMPQ9H6B4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLMPQ9H6B4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLMPQ9H6B4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLMPQ9H6B4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLMPQ9H6B4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLMPQ9H6B4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLMPQ9H6B4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLMPQ9H6B4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLMPQ9H6B4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CLMPQ9H6B4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLMPQ9H6B4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLMPQ9H6B4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLMPQ9H6B4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLMPQ9H6B4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLMPQ9H6B4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLMPQ9H6B4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLMPQ9H6B4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CLMPQ9H6B4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLMPQ9H6B4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLMPQ9H6B4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLMPQ9H6B4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLMPQ9H6B4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLMPQ9H6B4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLMPQ9H6B4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLMPQ9H6B4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLMPQ9H6B4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLMPQ9H6B4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLMPQ9H6B4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLMPQ9H6B4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLMPQ9H6B4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLMPQ9H6B4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLMPQ9H6B4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLMPQ9H6B4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms