Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
TRIOBPQ9H2D6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
TRIOBPQ9H2D6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
TRIOBPQ9H2D6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TRIOBPQ9H2D6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
TRIOBPQ9H2D6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
TRIOBPQ9H2D6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
TRIOBPQ9H2D6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TRIOBPQ9H2D6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
TRIOBPQ9H2D6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
TRIOBPQ9H2D6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
TRIOBPQ9H2D6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TRIOBPQ9H2D6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TRIOBPQ9H2D6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRIOBPQ9H2D6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TRIOBPQ9H2D6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRIOBPQ9H2D6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TRIOBPQ9H2D6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
TRIOBPQ9H2D6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TRIOBPQ9H2D6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRIOBPQ9H2D6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
TRIOBPQ9H2D6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRIOBPQ9H2D6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRIOBPQ9H2D6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRIOBPQ9H2D6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TRIOBPQ9H2D6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
TRIOBPQ9H2D6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TRIOBPQ9H2D6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TRIOBPQ9H2D6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRIOBPQ9H2D6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRIOBPQ9H2D6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRIOBPQ9H2D6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRIOBPQ9H2D6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRIOBPQ9H2D6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
TRIOBPQ9H2D6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
TRIOBPQ9H2D6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TRIOBPQ9H2D6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TRIOBPQ9H2D6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TRIOBPQ9H2D6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TRIOBPQ9H2D6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
TRIOBPQ9H2D6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRIOBPQ9H2D6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRIOBPQ9H2D6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRIOBPQ9H2D6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRIOBPQ9H2D6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRIOBPQ9H2D6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRIOBPQ9H2D6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRIOBPQ9H2D6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRIOBPQ9H2D6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRIOBPQ9H2D6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIOBPQ9H2D6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRIOBPQ9H2D6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRIOBPQ9H2D6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRIOBPQ9H2D6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRIOBPQ9H2D6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIOBPQ9H2D6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRIOBPQ9H2D6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TRIOBPQ9H2D6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TRIOBPQ9H2D6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRIOBPQ9H2D6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRIOBPQ9H2D6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
TRIOBPQ9H2D6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIOBPQ9H2D6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRIOBPQ9H2D6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIOBPQ9H2D6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRIOBPQ9H2D6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRIOBPQ9H2D6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRIOBPQ9H2D6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRIOBPQ9H2D6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIOBPQ9H2D6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
TRIOBPQ9H2D6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRIOBPQ9H2D6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIOBPQ9H2D6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIOBPQ9H2D6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIOBPQ9H2D6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRIOBPQ9H2D6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIOBPQ9H2D6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIOBPQ9H2D6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRIOBPQ9H2D6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIOBPQ9H2D6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRIOBPQ9H2D6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIOBPQ9H2D6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIOBPQ9H2D6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIOBPQ9H2D6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIOBPQ9H2D6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRIOBPQ9H2D6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRIOBPQ9H2D6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
TRIOBPQ9H2D6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TRIOBPQ9H2D6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRIOBPQ9H2D6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRIOBPQ9H2D6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRIOBPQ9H2D6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRIOBPQ9H2D6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRIOBPQ9H2D6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRIOBPQ9H2D6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TRIOBPQ9H2D6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIOBPQ9H2D6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRIOBPQ9H2D6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRIOBPQ9H2D6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
TRIOBPQ9H2D6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms