Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR6

RTN4R, Reticulon-4 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4RQ9BZR6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RTN4RQ9BZR6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RTN4RQ9BZR6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
RTN4RQ9BZR6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RTN4RQ9BZR6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RTN4RQ9BZR6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RTN4RQ9BZR6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RTN4RQ9BZR6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RTN4RQ9BZR6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RTN4RQ9BZR6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RTN4RQ9BZR6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RTN4RQ9BZR6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RTN4RQ9BZR6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RTN4RQ9BZR6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RTN4RQ9BZR6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RTN4RQ9BZR6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTN4RQ9BZR6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTN4RQ9BZR6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTN4RQ9BZR6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RTN4RQ9BZR6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTN4RQ9BZR6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTN4RQ9BZR6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTN4RQ9BZR6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RTN4RQ9BZR6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTN4RQ9BZR6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTN4RQ9BZR6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTN4RQ9BZR6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RTN4RQ9BZR6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RTN4RQ9BZR6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RTN4RQ9BZR6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTN4RQ9BZR6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTN4RQ9BZR6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTN4RQ9BZR6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTN4RQ9BZR6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTN4RQ9BZR6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTN4RQ9BZR6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTN4RQ9BZR6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTN4RQ9BZR6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTN4RQ9BZR6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTN4RQ9BZR6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTN4RQ9BZR6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTN4RQ9BZR6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTN4RQ9BZR6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTN4RQ9BZR6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTN4RQ9BZR6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTN4RQ9BZR6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTN4RQ9BZR6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTN4RQ9BZR6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTN4RQ9BZR6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTN4RQ9BZR6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTN4RQ9BZR6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTN4RQ9BZR6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTN4RQ9BZR6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RTN4RQ9BZR6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RTN4RQ9BZR6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTN4RQ9BZR6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTN4RQ9BZR6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RTN4RQ9BZR6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTN4RQ9BZR6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTN4RQ9BZR6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTN4RQ9BZR6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTN4RQ9BZR6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTN4RQ9BZR6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTN4RQ9BZR6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTN4RQ9BZR6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTN4RQ9BZR6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RTN4RQ9BZR6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RTN4RQ9BZR6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTN4RQ9BZR6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTN4RQ9BZR6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTN4RQ9BZR6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTN4RQ9BZR6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTN4RQ9BZR6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
RTN4RQ9BZR6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTN4RQ9BZR6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTN4RQ9BZR6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTN4RQ9BZR6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTN4RQ9BZR6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RTN4RQ9BZR6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTN4RQ9BZR6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RTN4RQ9BZR6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RTN4RQ9BZR6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTN4RQ9BZR6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTN4RQ9BZR6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTN4RQ9BZR6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTN4RQ9BZR6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTN4RQ9BZR6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTN4RQ9BZR6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTN4RQ9BZR6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RTN4RQ9BZR6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTN4RQ9BZR6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTN4RQ9BZR6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RTN4RQ9BZR6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RTN4RQ9BZR6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RTN4RQ9BZR6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RTN4RQ9BZR6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RTN4RQ9BZR6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RTN4RQ9BZR6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RTN4RQ9BZR6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RTN4RQ9BZR6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms