Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP9-3Q9BYQ3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KRTAP9-3Q9BYQ3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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KRTAP9-3Q9BYQ3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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