Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC54.54■■■■■ 6.32
FYCO1Q9BQS8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC53.46■■■■■ 6.15
FYCO1Q9BQS8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.1■■■■■ 6.09
FYCO1Q9BQS8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.89■■■■■ 6.06
FYCO1Q9BQS8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.81■■■■■ 6.05
FYCO1Q9BQS8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.7■■■■■ 6.03
FYCO1Q9BQS8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC52.54■■■■■ 6
FYCO1Q9BQS8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC52.46■■■■■ 5.99
FYCO1Q9BQS8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.22■■■■■ 5.79
FYCO1Q9BQS8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC51.17■■■■■ 5.78
FYCO1Q9BQS8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC51.16■■■■■ 5.78
FYCO1Q9BQS8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.15■■■■■ 5.78
FYCO1Q9BQS8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC51.05■■■■■ 5.76
FYCO1Q9BQS8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.99■■■■■ 5.75
FYCO1Q9BQS8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC50.96■■■■■ 5.75
FYCO1Q9BQS8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC50.65■■■■■ 5.7
FYCO1Q9BQS8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.56■■■■■ 5.68
FYCO1Q9BQS8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.32■■■■■ 5.65
FYCO1Q9BQS8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC50.29■■■■■ 5.64
FYCO1Q9BQS8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.28■■■■■ 5.64
FYCO1Q9BQS8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC50.15■■■■■ 5.62
FYCO1Q9BQS8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.07■■■■■ 5.61
FYCO1Q9BQS8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.01■■■■■ 5.6
FYCO1Q9BQS8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
FYCO1Q9BQS8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
FYCO1Q9BQS8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.44■■■■■ 5.51
FYCO1Q9BQS8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.43■■■■■ 5.5
FYCO1Q9BQS8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC49.3■■■■■ 5.48
FYCO1Q9BQS8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC49.24■■■■■ 5.47
FYCO1Q9BQS8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.46
FYCO1Q9BQS8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC49.06■■■■■ 5.44
FYCO1Q9BQS8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.93■■■■■ 5.42
FYCO1Q9BQS8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.9■■■■■ 5.42
FYCO1Q9BQS8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC48.79■■■■■ 5.4
FYCO1Q9BQS8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.69■■■■■ 5.39
FYCO1Q9BQS8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC48.67■■■■■ 5.38
FYCO1Q9BQS8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.57■■■■■ 5.37
FYCO1Q9BQS8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.55■■■■■ 5.36
FYCO1Q9BQS8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC48.54■■■■■ 5.36
FYCO1Q9BQS8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC48.46■■■■■ 5.35
FYCO1Q9BQS8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC48.38■■■■■ 5.34
FYCO1Q9BQS8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.35■■■■■ 5.33
FYCO1Q9BQS8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC48.29■■■■■ 5.32
FYCO1Q9BQS8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC48.27■■■■■ 5.32
FYCO1Q9BQS8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.26■■■■■ 5.32
FYCO1Q9BQS8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.93■■■■■ 5.26
FYCO1Q9BQS8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC47.76■■■■■ 5.24
FYCO1Q9BQS8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.68■■■■■ 5.22
FYCO1Q9BQS8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC47.65■■■■■ 5.22
FYCO1Q9BQS8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC47.61■■■■■ 5.21
FYCO1Q9BQS8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC47.6■■■■■ 5.21
FYCO1Q9BQS8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.53■■■■■ 5.2
FYCO1Q9BQS8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.5■■■■■ 5.19
FYCO1Q9BQS8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.46■■■■■ 5.19
FYCO1Q9BQS8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
FYCO1Q9BQS8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.4■■■■■ 5.18
FYCO1Q9BQS8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC47.35■■■■■ 5.17
FYCO1Q9BQS8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.23■■■■■ 5.15
FYCO1Q9BQS8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
FYCO1Q9BQS8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
FYCO1Q9BQS8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.15
FYCO1Q9BQS8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC47.19■■■■■ 5.14
FYCO1Q9BQS8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC47.14■■■■■ 5.14
FYCO1Q9BQS8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC47.09■■■■■ 5.13
FYCO1Q9BQS8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.03■■■■■ 5.12
FYCO1Q9BQS8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
FYCO1Q9BQS8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC46.95■■■■■ 5.11
FYCO1Q9BQS8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
FYCO1Q9BQS8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC46.89■■■■■ 5.1
FYCO1Q9BQS8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
FYCO1Q9BQS8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC46.82■■■■■ 5.09
FYCO1Q9BQS8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
FYCO1Q9BQS8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
FYCO1Q9BQS8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
FYCO1Q9BQS8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
FYCO1Q9BQS8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
FYCO1Q9BQS8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC46.67■■■■■ 5.06
FYCO1Q9BQS8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC46.66■■■■■ 5.06
FYCO1Q9BQS8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC46.63■■■■■ 5.05
FYCO1Q9BQS8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
FYCO1Q9BQS8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC46.55■■■■■ 5.04
FYCO1Q9BQS8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC46.48■■■■■ 5.03
FYCO1Q9BQS8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
FYCO1Q9BQS8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.37■■■■■ 5.01
FYCO1Q9BQS8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
FYCO1Q9BQS8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC46.35■■■■■ 5.01
FYCO1Q9BQS8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC46.34■■■■■ 5.01
FYCO1Q9BQS8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
FYCO1Q9BQS8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.32■■■■■ 5.01
FYCO1Q9BQS8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
FYCO1Q9BQS8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.31■■■■■ 5
FYCO1Q9BQS8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
FYCO1Q9BQS8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.3■■■■■ 5
FYCO1Q9BQS8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC46.27■■■■■ 5
FYCO1Q9BQS8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
FYCO1Q9BQS8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
FYCO1Q9BQS8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
FYCO1Q9BQS8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC46.17■■■■■ 4.98
FYCO1Q9BQS8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
FYCO1Q9BQS8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.11■■■■■ 4.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms