Protein–RNA interactions for Protein: Q99828

CIB1, Calcium and integrin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB1Q99828 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CIB1Q99828 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CIB1Q99828 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CIB1Q99828 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CIB1Q99828 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CIB1Q99828 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CIB1Q99828 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CIB1Q99828 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CIB1Q99828 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CIB1Q99828 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CIB1Q99828 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CIB1Q99828 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CIB1Q99828 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CIB1Q99828 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CIB1Q99828 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CIB1Q99828 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CIB1Q99828 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CIB1Q99828 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CIB1Q99828 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CIB1Q99828 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CIB1Q99828 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CIB1Q99828 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CIB1Q99828 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CIB1Q99828 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CIB1Q99828 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CIB1Q99828 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CIB1Q99828 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CIB1Q99828 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CIB1Q99828 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CIB1Q99828 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CIB1Q99828 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CIB1Q99828 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CIB1Q99828 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CIB1Q99828 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CIB1Q99828 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CIB1Q99828 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CIB1Q99828 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CIB1Q99828 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CIB1Q99828 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CIB1Q99828 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CIB1Q99828 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CIB1Q99828 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CIB1Q99828 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CIB1Q99828 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CIB1Q99828 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CIB1Q99828 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CIB1Q99828 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CIB1Q99828 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CIB1Q99828 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CIB1Q99828 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CIB1Q99828 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CIB1Q99828 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CIB1Q99828 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CIB1Q99828 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CIB1Q99828 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CIB1Q99828 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CIB1Q99828 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CIB1Q99828 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CIB1Q99828 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CIB1Q99828 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CIB1Q99828 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CIB1Q99828 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CIB1Q99828 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CIB1Q99828 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CIB1Q99828 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CIB1Q99828 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CIB1Q99828 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CIB1Q99828 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CIB1Q99828 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CIB1Q99828 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CIB1Q99828 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CIB1Q99828 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CIB1Q99828 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CIB1Q99828 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CIB1Q99828 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CIB1Q99828 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CIB1Q99828 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CIB1Q99828 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CIB1Q99828 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CIB1Q99828 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CIB1Q99828 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CIB1Q99828 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CIB1Q99828 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CIB1Q99828 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CIB1Q99828 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CIB1Q99828 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CIB1Q99828 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CIB1Q99828 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CIB1Q99828 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CIB1Q99828 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CIB1Q99828 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CIB1Q99828 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CIB1Q99828 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CIB1Q99828 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CIB1Q99828 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CIB1Q99828 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CIB1Q99828 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CIB1Q99828 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CIB1Q99828 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CIB1Q99828 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms